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DDX家族分子和PC分子在2型登革病毒复制中的作用机制研究

缩略语表第8-14页
中文摘要第14-20页
英文摘要第20-25页
前言第26-28页
文献回顾第28-58页
第一部分 DDX50在DENV-2复制中的作用机制研究第58-84页
    1 实验材料与仪器第58-61页
        1.1 质粒、细胞株及病毒株第58-59页
        1.2 主要试剂第59-60页
        1.3 主要仪器第60-61页
    2 实验方法第61-70页
        2.1 细胞的培养第61页
        2.2 siRNA序列设计及合成第61页
        2.3 实时定量PCR引物设计及合成第61-62页
        2.4 质粒及siRNA的转染第62-63页
            2.4.1 质粒转染第62-63页
            2.4.2 siRNA转染第63页
        2.5 病毒的扩增和浓缩第63页
        2.6 病毒空斑形成单位(plaque forming unit, PFU)的测定及病毒感染第63-64页
            2.6.1 PFU的测定第63-64页
            2.6.2 病毒感染第64页
        2.7 慢病毒的制备第64-65页
        2.8 慢病毒滴度的测定及感染第65-66页
            2.8.1 慢病毒滴度测定第65-66页
            2.8.2 慢病毒感染第66页
        2.9 总RNA的提取第66-67页
        2.10 RNA的反转录及实时定量PCR第67-68页
        2.11 Western Blot第68-69页
        2.12 荧光素酶活性检测第69页
        2.13 免疫荧光及共聚焦显微镜观察第69-70页
        2.14 数据分析第70页
    3 实验结果第70-79页
        3.1 在DENV-2感染早期DDX50抑制病毒复制第70-73页
            3.1.1 DDX50的表达水平随着病毒感染时间的延长而增加第70页
            3.1.2 沉默DDX50后促进DENV-2复制第70-71页
            3.1.3 DDX50过表达后抑制DENV-2复制第71-73页
        3.2 DDX50通过上调IFN-β的表达抑制DENV-2复制第73-75页
            3.2.1 在病毒感染早期,IFN-βmRNA的表达水平与DDX50的表达水平呈正相关第73页
            3.2.2 DDX50上调IFN-β的表达第73-75页
        3.3 DDX50和RIG-I或者MDA5对IFN-β启动子活性诱导具有协同效应第75-78页
            3.3.1 DDX50和RIG-I对IFN-β启动子活性诱导具有协同效应第75页
            3.3.2 DDX50和MDA5对IFN-β启动子活性诱导具有协同效应第75-76页
            3.3.3 DENV-2感染不能诱导DDX50出核第76-78页
        3.4 过表达DDX50后感染DENV-2诱导ISG的表达上调第78-79页
            3.4.1 过表达DDX50后感染DENV-2诱导ISRE启动子水平上调第78页
            3.4.2 过表达DDX50后感染DENV-2诱导一些ISG表达上调第78-79页
    4 讨论第79-84页
第二部分 DDX17在DENV-2复制中的作用机制研究第84-103页
    1 实验材料与仪器第84-85页
        1.1 质粒、细胞株及病毒株第84页
        1.2 主要试剂第84-85页
        1.3 主要仪器第85页
    2 实验方法第85-89页
        2.1 细胞的培养第85页
        2.2 siRNA序列设计及合成第85页
        2.3 实时定量PCR引物设计及合成第85-86页
        2.4 质粒及siRNA的转染第86页
            2.4.1 质粒转染第86页
            2.4.2 siRNA转染第86页
        2.5 病毒的扩增和浓缩第86页
        2.6 病毒PFU的测定及感染第86页
            2.6.1 PFU的测定第86页
            2.6.2 病毒感染第86页
        2.7 总RNA的提取第86页
        2.8 RNA的反转录及实时定量PCR第86页
        2.9 Western Blot第86页
        2.10 荧光素酶活性检测第86页
        2.11 免疫荧光及共聚焦显微镜观察第86-87页
        2.12 RNA沉淀实验(RNA Immunoprecipitation,RIP)第87-88页
        2.13 免疫共沉淀实验(Co-immunoprecipitation,Co-IP)第88-89页
        2.14 数据分析第89页
    3 实验结果第89-99页
        3.1 在DENV-2感染早期DDX17促进病毒复制第89-91页
            3.1.1 DDX17沉默后抑制DENV-2复制第89-90页
            3.1.2 DDX17过表达后促进DENV-2复制第90-91页
        3.2 DDX17抑制IFN-β的表达第91-93页
        3.3 DDX17与DENV-2RNA相互作用第93-94页
            3.3.1 DDX17与DENV-2RNA存在共定位第93页
            3.3.2 DDX17结合DENV-2RNA第93-94页
        3.4 DDX17和G3BP1相互作用并促进DENV-2复制第94-99页
            3.4.1 DDX17与G3BP1存在相互作用第94-95页
            3.4.2 DENV-2dsRNA、DDX17和G3BP1存在共定位第95-97页
            3.4.3 HEK 293T细胞感染DENV-2后不形成SG第97-99页
            3.4.4 DDX17和G3BP1共转染促进DENV-2复制第99页
    4 讨论第99-103页
第三部分 PC在DENV-2复制中的作用机制研究第103-135页
    1 实验材料与仪器第103-104页
        1.1 质粒、细胞株及病毒株第103页
        1.2 主要试剂第103-104页
        1.3 主要仪器第104页
    2 实验方法第104-107页
        2.1 细胞的培养第104页
        2.2 实时定量PCR引物设计及合成第104-105页
        2.3 质粒转染第105页
        2.4 病毒的扩增和浓缩第105页
        2.5 病毒PFU的测定及病毒感染第105页
            2.5.1 PFU的测定第105页
            2.5.2 病毒感染第105页
        2.6 总RNA的提取第105页
        2.7 RNA的反转录及实时定量PCR第105页
        2.8 Western Blot第105页
        2.9 荧光素酶活性检测第105页
        2.10 免疫荧光及共聚焦显微镜观察第105页
        2.11 免疫共沉淀实验(Co-immunoprecipitation,Co-IP)第105-106页
        2.12 亲和层析纯化实验第106页
        2.13 线粒体染色第106-107页
        2.14 数据分析第107页
    3 实验结果第107-131页
        3.1 质谱鉴定结果第107-117页
            3.1.1 亲和层析纯化后SDS-PAGE检测结果第107-108页
            3.1.2 质谱检测及结果分析第108-117页
        3.2 PC和NS3相互作用鉴定第117-121页
            3.2.1 PC与NS3共定位结果第117-120页
            3.2.2 PC和NS3相互作用验证第120页
            3.2.3 PC截短体和NS3相互作用验证第120-121页
        3.3 PC在不同细胞系中对DENV-2复制的影响不同第121-123页
        3.4 PC在不同细胞系中对IFN-β表达的影响不同第123-124页
        3.5 PC和NS3在线粒体上共定位结果第124-127页
        3.6 DENV-2感染对线粒体形态的影响第127-131页
    4 讨论第131-135页
小结第135-136页
参考文献第136-151页
个人简历和研究成果第151-153页
致谢第153-154页

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