| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略词表(abbreviation) | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-20页 |
| 1 前言 | 第11页 |
| 2 基因差异表达研究方法 | 第11-13页 |
| ·消减杂交法(Subtractive Hybridization) | 第11页 |
| ·mRNA差异显示技术(mRNA Differential Display) | 第11-12页 |
| ·代表性序列差别分析(Representational Difference Analysis) | 第12页 |
| ·抑制消减杂交法(Suppression Subtractive Hybridization,SSH) | 第12页 |
| ·基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE) | 第12页 |
| ·基因芯片技术(Microarray) | 第12-13页 |
| 3 基因芯片的研究进展 | 第13-17页 |
| ·基因芯片技术的原理 | 第13页 |
| ·基因芯片制备与数据处理 | 第13-14页 |
| ·基因芯片制备 | 第13-14页 |
| ·基因芯片数据处理 | 第14页 |
| ·基因芯片在猪遗传育种中的应用 | 第14-16页 |
| ·基因表达水平的检测 | 第15页 |
| ·借助基因芯片技术发现新的候选基因 | 第15页 |
| ·在杂种优势方面的应用 | 第15页 |
| ·在猪疾病检测方面的应用 | 第15-16页 |
| ·在猪繁殖性状研究中的应用 | 第16页 |
| ·在猪免疫学研究方面的应用 | 第16页 |
| ·基因芯片存在的问题与前景 | 第16-17页 |
| 4 猪繁殖性状的候选基因研究进展 | 第17-19页 |
| ·雌激素受体基因 | 第17-18页 |
| ·促卵泡激素β亚基基因 | 第18页 |
| ·视黄酸受体γ亚基和视黄醇结合蛋白4基因 | 第18页 |
| ·催乳素受体基因 | 第18页 |
| ·骨桥蛋白位点 | 第18-19页 |
| ·其它与繁殖性状相关的候选基因 | 第19页 |
| 5 BAX基因 | 第19-20页 |
| 第二章 研究的目的和意义 | 第20-21页 |
| 第三章 材料与方法 | 第21-30页 |
| 1 试验材料 | 第21-23页 |
| ·试验样品 | 第21页 |
| ·组织样品 | 第21页 |
| ·DNA样品 | 第21页 |
| ·主要仪器和设备 | 第21-22页 |
| ·主要试剂及试剂盒 | 第22页 |
| ·常用试剂的配制 | 第22-23页 |
| ·试验器械的处理 | 第23页 |
| 2 试验方法 | 第23-30页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第23页 |
| ·猪基因组DNA的提取 | 第23页 |
| ·猪基因组DNA浓度的测定 | 第23页 |
| ·总RNA的提取 | 第23页 |
| ·猪卵泡组织总RNA的提取 | 第23页 |
| ·猪卵泡组织总RNA浓度的测定和质量检测 | 第23页 |
| ·实时定量PCR验证差异表达基因 | 第23-25页 |
| ·cDNA的准备 | 第23-24页 |
| ·Real-time PCR的操作过程 | 第24-25页 |
| ·候选基因的扩增及酶切 | 第25-26页 |
| ·PCR扩增 | 第25-26页 |
| ·PCR扩增产物的酶切分型 | 第26页 |
| ·所有引物的设计与合成 | 第26-28页 |
| ·数据处理分析 | 第28-30页 |
| ·猪卵泡组织的芯片杂交试验与数据分析 | 第28页 |
| ·Real-time PCR验证的差异表达基因及分析方法 | 第28页 |
| ·候选基因的关联性分析及数据处理 | 第28-30页 |
| 第四章 结果与分析 | 第30-43页 |
| 1 猪基因组DNA及总RNA的提取与质量检测结果 | 第30页 |
| 2 基因芯片结果分析 | 第30-34页 |
| ·芯片获得的差异表达基因(MAS 3.0) | 第30-33页 |
| ·差异表达基因通路分析结果(MAS 3.0) | 第33-34页 |
| 3 实时定量PCR验证差异表达基因 | 第34-39页 |
| ·PCR扩增结果 | 第34-36页 |
| ·差异表达基因的实时定量PCR结果 | 第36-37页 |
| ·实时定量PCR与基因芯片结果的相关系数 | 第37-39页 |
| 4 猪BAX基因的研究结果 | 第39-43页 |
| ·猪BAX基因第一内含子Ear Ⅰ酶切位点 | 第39-41页 |
| ·猪BAX基因多态位点与猪繁殖性状的关联分析 | 第41-43页 |
| 第五章 讨论 | 第43-46页 |
| 1 关于试验设计 | 第43页 |
| 2 关于基因芯片技术 | 第43页 |
| 3 关于荧光定量PCR及其内参 | 第43-44页 |
| 4 关于SNP分析 | 第44-45页 |
| 5 下一步工作 | 第45-46页 |
| 小结 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-53页 |
| 致谢 | 第53页 |
