一个基于GPU的快速序列比对软件的设计与实现
| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 1 绪论 | 第7-11页 |
| 1.1 课题背景与意义 | 第7-8页 |
| 1.2 国内外研究概况 | 第8-10页 |
| 1.3 论文的主要研究内容 | 第10-11页 |
| 2 关键技术研究 | 第11-21页 |
| 2.1 CUDA并行计算平台 | 第11-14页 |
| 2.2 序列比对算法 | 第14-20页 |
| 2.3 本章小结 | 第20-21页 |
| 3 基于GPU快速序列比对软件的分析与设计 | 第21-30页 |
| 3.1 软件的需求分析 | 第21-23页 |
| 3.2 软件的总体设计 | 第23-24页 |
| 3.3 软件的详细设计 | 第24-29页 |
| 3.4 本章小结 | 第29-30页 |
| 4 基于GPU快速序列比对软件的实现 | 第30-56页 |
| 4.1 开发环境的选择 | 第30页 |
| 4.2 软件的实现 | 第30-45页 |
| 4.3 GPU上的加速方法 | 第45-55页 |
| 4.4 本章小结 | 第55-56页 |
| 5 基于GPU快速序列比对软件的测试 | 第56-63页 |
| 5.1 测试用例 | 第56页 |
| 5.2 测试环境与配置 | 第56-57页 |
| 5.3 测试方法 | 第57-59页 |
| 5.4 测试情况 | 第59-62页 |
| 5.5 本章小结 | 第62-63页 |
| 6 总结与展望 | 第63-65页 |
| 6.1 全文总结 | 第63页 |
| 6.2 展望 | 第63-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-69页 |
