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基于IGPD靶标探讨头孢喹肟干预木糖葡萄球菌生物被膜形成的机制

摘要第10-12页
英文摘要第12-14页
1 引言第15-29页
    1.1 细菌生物被膜研究进展第15-21页
        1.1.1 细菌生物被膜简介第15-16页
        1.1.2 细菌生物被膜的形成第16-17页
        1.1.3 细菌生物被膜的信号调节第17-18页
        1.1.4 凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)生物被膜形成的分子机制第18-20页
        1.1.5 干预细菌生物被膜形成的策略第20-21页
    1.2 头孢菌素及头孢喹肟影响生物被膜形成的研究进展第21-22页
        1.2.1 头孢菌素及头孢喹肟简介第21-22页
        1.2.2 头孢菌素及头孢喹肟对生物被膜的影响第22页
    1.3 咪唑甘油磷酸酯脱水酶(IGPD)及组氨酸研究进展第22-27页
        1.3.1 咪唑甘油磷酸酯脱水酶(IGPD)简介第22-23页
        1.3.2 IGPD分子结构第23-24页
        1.3.3 IGPD抑制剂第24-25页
        1.3.4 L-组氨酸简介第25-26页
        1.3.5 IGPD及组氨酸影响生物被膜形成第26-27页
    1.4 研究目的与意义第27-29页
2 材料和方法第29-39页
    2.1 材料第29-32页
        2.1.1 菌株第29页
        2.1.2 药品第29页
        2.1.3 培养基及试剂第29-30页
        2.1.4 仪器设备第30页
        2.1.5 PCR引物第30-32页
    2.2 方法第32-39页
        2.2.1 头孢喹肟对木糖葡萄球菌的抑菌作用第32页
        2.2.2 木糖葡萄球菌生物被膜培养及形成能力测定第32页
        2.2.3 头孢喹肟对木糖葡萄球菌生物被膜的干预作用第32-33页
        2.2.4 1/2MIC头孢喹肟干预木糖葡萄球菌生物被膜形成的蛋白质组学研究第33-34页
        2.2.5 木糖葡萄球菌ATCC700404hisB基因缺失株及回补株的构建第34-36页
        2.2.6 头孢喹肟对hisB基因缺失株和野生株IGPD及组氨酸的影响第36-37页
        2.2.7 IGPD的同源建模及与头孢喹肟结合位点的预测第37页
        2.2.8 IGPD与头孢喹肟相互作用的验证第37-39页
3 结果与分析第39-63页
    3.1 头孢喹肟对木糖葡萄球菌的抑菌作用第39页
    3.2 亚抑菌浓度头孢喹肟对木糖葡萄球菌生物被膜形成的干预作用第39-41页
        3.2.1 头孢喹肟对木糖葡萄球菌生物被膜的影响第39-41页
        3.2.2 头孢喹肟对木糖葡萄球菌生物被膜形态的影响第41页
    3.3 亚抑菌浓度头孢喹肟干预木糖葡萄球菌生物被膜形成的蛋白组学研究第41-47页
        3.3.1 蛋白质鉴定结果第41-42页
        3.3.2 生物信息学分析第42-47页
    3.4 木糖葡萄球菌ATCC 700404 hisB基因缺失株及回补株的构建第47-53页
        3.4.1 PCR扩增木糖葡萄球菌ATCC 700404 hisB基因的上下游同源臂第47-48页
        3.4.2 PCR扩增ermB基因第48页
        3.4.3 木糖葡萄球菌ATCC 700404 hisB基因的上游同源臂测序比对结果第48-49页
        3.4.4 木糖葡萄球菌ATCC 700404 hisB基因的下游同源臂测序比对结果第49页
        3.4.5 ermB基因测序比对结果第49页
        3.4.6 自杀质粒的PCR鉴定第49-50页
        3.4.7 自杀质粒上木糖葡萄球菌ATCC 700404 hisB基因的上游同源臂测序比对结果第50页
        3.4.8 自杀质粒上木糖葡萄球菌ATCC 700404 hisB基因的下游同源臂测序比对结果第50-51页
        3.4.9 自杀质粒上ermB基因测序比对结果第51页
        3.4.10 木糖葡萄球菌ATCC 700404 hisB基因缺失株的PCR鉴定第51-52页
        3.4.11 木糖葡萄球菌ATCC 700404 hisB基因回补株的PCR鉴定第52-53页
    3.5 头孢喹肟对木糖葡萄球菌hisB基因缺失菌株和野生菌株IGPD及组氨酸的影响第53-56页
        3.5.1 木糖葡萄球菌ATCC 700404 hisB基因缺失株生物被膜形成能力的测定第53-54页
        3.5.2 木糖葡萄球菌ATCC 700404 hisB基因回补株生物被膜形成能力的测定第54页
        3.5.3 头孢喹肟对木糖葡萄球菌ATCC 700404 IGPD活性的影响第54-55页
        3.5.4 头孢喹肟对木糖葡萄球菌ATCC 700404 hisB基因缺失株及野生株组氨酸含量的影响第55-56页
    3.6 IGPD与头孢喹肟结合位点的预测第56-58页
        3.6.1 IGPD的同源建模及验证第56-57页
        3.6.2 IGPD与头孢喹肟靶点预测第57-58页
    3.7 IGPD与头孢喹肟相互作用的验证第58-63页
        3.7.1 IGPD及突变蛋白的表达和纯化第58-61页
        3.7.2 BIAcore检测IGPD与头孢喹肟相互作用第61-62页
        3.7.3 IGPD突变蛋白与头孢喹肟相互作用第62-63页
4 讨论第63-70页
    4.1 头孢喹肟对木糖葡萄球菌的作用第63页
    4.2 头孢喹肟对木糖葡萄球菌生物被膜的干预作用第63-64页
    4.3 头孢喹肟对木糖葡萄球菌的蛋白组学分析第64-66页
    4.4 组氨酸代谢及IGPD对于木糖葡萄球菌生物被膜的形成发挥重要作用第66-68页
    4.5 IGPD是头孢喹肟的潜在靶标第68-70页
5 结论第70-71页
致谢第71-72页
参考文献第72-81页
附录第81-123页
攻读博士学位期间发表的学术论文第123页

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