电场下多肽在纳米管中输运的分子动力学模拟研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第11-13页 |
| 1.1 课题的研究背景 | 第11-12页 |
| 1.2 课题研究的目的意义以及论文的主要内容 | 第12-13页 |
| 第二章 碳纳米管与纳米粒子 | 第13-18页 |
| 2.1 碳纳米管 | 第13-15页 |
| 2.1.1 碳纳米管简介 | 第13页 |
| 2.1.2 碳纳米管的基本特征 | 第13-15页 |
| 2.2 细胞穿透肽 | 第15-18页 |
| 第三章 分子动力学模拟 | 第18-35页 |
| 3.1 分子动力学模拟简介 | 第18-19页 |
| 3.2 分子动力学模拟理论基础 | 第19-25页 |
| 3.2.1 分子动力学模拟的计算原理 | 第19-23页 |
| 3.2.2 粒子间相互作用的势能函数 | 第23-24页 |
| 3.2.3 周期性边界条件 | 第24-25页 |
| 3.3 分子动力学模拟的相关概念 | 第25-31页 |
| 3.3.1 力场 | 第25-27页 |
| 3.3.2 能量最小化 | 第27页 |
| 3.3.3 系综 | 第27-31页 |
| 3.3.4 水分子的势能模型 | 第31页 |
| 3.4 分子动力学模拟的步骤 | 第31-32页 |
| 3.5 分子动力学模拟软件Gromacs | 第32-35页 |
| 3.5.1 Gromacs简介 | 第32-33页 |
| 3.5.2 Gromacs相关文件及工作流程 | 第33-35页 |
| 第四章 在电场下多肽穿过碳纳米管输运过程模拟 | 第35-57页 |
| 4.1 前言 | 第35页 |
| 4.2 分子动力学模拟 | 第35-38页 |
| 4.2.1 模型 | 第35-36页 |
| 4.2.2 模拟细节 | 第36-38页 |
| 4.3 模拟结果 | 第38-49页 |
| 4.3.1 纳米管在多肽输运过程中的作用 | 第38-41页 |
| 4.3.2 电场在多肽输运过程中的作用 | 第41-42页 |
| 4.3.3 不同电场下多肽穿过SWCNT的模拟 | 第42-46页 |
| 4.3.4 多肽穿过不同种类CNT的模拟 | 第46-49页 |
| 4.4 模拟结果分析 | 第49-56页 |
| 4.4.1 L-J势能分析 | 第49-51页 |
| 4.4.2 PMF自由能分析 | 第51-54页 |
| 4.4.3 RMSD分析 | 第54-56页 |
| 4.5 结论 | 第56-57页 |
| 第五章 总结及展望 | 第57-59页 |
| 5.1 全文总结 | 第57-58页 |
| 5.2 展望 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-64页 |
| 在学期间取得的与学位论文相关的研究成果 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65页 |
