| 缩略词表 | 第5-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 第一章 综述 | 第12-19页 |
| 1.1 甘蔗条纹花叶病毒的研究进展 | 第12-15页 |
| 1.1.1 甘蔗花叶病及其病原 | 第12页 |
| 1.1.2 甘蔗条纹花叶病毒的生物学特征 | 第12-13页 |
| 1.1.3 甘蔗条纹花叶病毒的病原检测 | 第13页 |
| 1.1.4 甘蔗条纹花叶病毒的基因组结构及功能 | 第13-14页 |
| 1.1.5 甘蔗条纹花叶病毒的遗传多样性 | 第14-15页 |
| 1.2 RNA沉默与病毒编码的RNA沉默抑制子 | 第15-18页 |
| 1.2.1 RNA沉默 | 第15页 |
| 1.2.2 病毒编码的RNA沉默抑制子 | 第15-17页 |
| 1.2.3 RNA沉默抑制子的作用机理 | 第17-18页 |
| 1.3 本实验的研究目的和意义 | 第18-19页 |
| 第二章 SCSMV实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立 | 第19-29页 |
| 2.1 实验材料 | 第19页 |
| 2.1.1 叶片样品采集 | 第19页 |
| 2.1.2 所用试剂盒及试剂 | 第19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-22页 |
| 2.2.1 甘蔗叶片总RNA提取 | 第19-20页 |
| 2.2.2 引物和探针的设计 | 第20-21页 |
| 2.2.3 SCSMV CP基因的体外转录及RNA纯化 | 第21页 |
| 2.2.4 一步法实时荧光定量RT-PCR检测 | 第21-22页 |
| 2.2.5 常规RT-PCR检测 | 第22页 |
| 2.2.6 序列分析与系统进化树构建 | 第22页 |
| 2.3 结果与分析 | 第22-27页 |
| 2.3.1 序列比对与引物的特异性分析 | 第22-24页 |
| 2.3.2 实时荧光定量RT-PCR标准曲线的制作 | 第24-25页 |
| 2.3.3 实时荧光定量RT-PCR灵敏度分析 | 第25-26页 |
| 2.3.4 实时荧光定量RT-PCR的应用 | 第26-27页 |
| 2.4 讨论与总结 | 第27-29页 |
| 第三章 甘蔗条纹花叶病毒分子群体遗传及进化分析 | 第29-43页 |
| 3.1 实验材料 | 第29-30页 |
| 3.1.1 病毒分离物来源 | 第29页 |
| 3.1.2 所用试剂盒及试剂 | 第29-30页 |
| 3.2 实验方法 | 第30-33页 |
| 3.2.1 甘蔗叶片总RNA提取 | 第30页 |
| 3.2.2 第一链cDNA的合成 | 第30页 |
| 3.2.3 病毒基因组的克隆 | 第30-31页 |
| 3.2.4 序列分析 | 第31-33页 |
| 3.3 结果与分析 | 第33-41页 |
| 3.3.1 基因组的组成与结构 | 第33页 |
| 3.3.2 一致性与系统进化分析 | 第33-37页 |
| 3.3.3 核苷酸多样性和中性检测 | 第37-39页 |
| 3.3.4 群体间与群体内的遗传分化与基因流 | 第39页 |
| 3.3.5 重组分析 | 第39-40页 |
| 3.3.6 选择压力分析 | 第40-41页 |
| 3.4 讨论与小结 | 第41-43页 |
| 第四章 SCSMV编码的RNA沉默抑制子功能鉴定 | 第43-56页 |
| 4.1 实验材料 | 第43-44页 |
| 4.1.1 植物材料及培养条件 | 第43页 |
| 4.1.2 所用试剂及质粒 | 第43-44页 |
| 4.2 实验方法 | 第44-48页 |
| 4.2.1 载体的构建 | 第44-45页 |
| 4.2.2 基因枪轰击甘蔗嫩叶组织 | 第45-46页 |
| 4.2.3 甘蔗嫩叶上EYFP荧光表达定量分析 | 第46页 |
| 4.2.4 农杆菌侵染烟草 | 第46-47页 |
| 4.2.5 本氏烟草GFP荧光定量分析 | 第47页 |
| 4.2.6 实时荧光定量RT-PCR | 第47-48页 |
| 4.2.7 本氏烟草GFP蛋白Western blot分析 | 第48页 |
| 4.3 结果与分析 | 第48-54页 |
| 4.3.1 植物表达载体的构建 | 第48-49页 |
| 4.3.2 SCSMVP1在甘蔗嫩叶上的活性分析 | 第49-50页 |
| 4.3.3 SCSMVP1在本氏烟上的活性分析 | 第50-51页 |
| 4.3.4 GFP和P1基因在mRNA水平上表达分析 | 第51-53页 |
| 4.3.5 GFP在蛋白水平上表达分析 | 第53-54页 |
| 4.3.6 SCSMVP1蛋白的亚细胞定位 | 第54页 |
| 4.4 讨论与小结 | 第54-56页 |
| 第五章 结论与展望 | 第56-57页 |
| 5.1 结论 | 第56页 |
| 5.2 展望 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 附录 | 第63-67页 |
| 附录参考文献 | 第65-67页 |
| 致谢 | 第67页 |
