| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略语表 | 第13-15页 |
| 1 引言 | 第15-39页 |
| 1.1 涝渍胁迫是玉米重要的非生物胁迫 | 第15-16页 |
| 1.2 涝渍胁迫对植物造成的影响 | 第16-25页 |
| 1.2.1 涝渍胁迫影响气体的扩散 | 第16-17页 |
| 1.2.2 涝渍胁迫后植物的适应性变化 | 第17-25页 |
| 1.3 植物涝渍胁迫遗传研究进展 | 第25-28页 |
| 1.3.1 玉米涝渍胁迫遗传研究进展 | 第25-27页 |
| 1.3.2 其它作物涝渍胁迫遗传研究进展 | 第27-28页 |
| 1.4 植物涝渍胁迫响应分子机理研究 | 第28-33页 |
| 1.4.1 植物细胞对低氧信号的感知 | 第28-29页 |
| 1.4.2 第七亚家族ERFs(Group Ⅶ ERFs)调控低氧适应性反应 | 第29-30页 |
| 1.4.3 拟南芥ERF-Ⅶs通过NERP被降解 | 第30-32页 |
| 1.4.4 乙烯调控涝渍胁迫后适应性的生长响应 | 第32-33页 |
| 1.5 植物复杂数量性状的遗传解析 | 第33-37页 |
| 1.5.1 连锁定位与数量性状的遗传解析 | 第33-34页 |
| 1.5.2 关联分析与数量性状的遗传解析 | 第34-36页 |
| 1.5.3 结合连锁定位与关联分析解析数量性状遗传基础 | 第36页 |
| 1.5.4 关联分析在解析植物抗逆性遗传基础中的应用 | 第36-37页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第37-39页 |
| 2 材料与方法 | 第39-51页 |
| 2.1 玉米第五染色体主效耐渍性QTL的定位 | 第39-46页 |
| 2.1.1 亲本材料 | 第39页 |
| 2.1.2 A3237与A3239淹水胁迫后表型分析 | 第39-40页 |
| 2.1.3 A3237与A3239淹水胁迫后蛋白质组学分析 | 第40-43页 |
| 2.1.4 A3237与A3239分离群体构建 | 第43-44页 |
| 2.1.5 基因型鉴定与连锁图谱构建 | 第44页 |
| 2.1.6 连锁定位群体表型鉴定 | 第44-45页 |
| 2.1.7 表型数据统计分析及QTL连锁定位 | 第45-46页 |
| 2.2 玉米苗期耐渍性的全基因组关联分析 | 第46-47页 |
| 2.2.1 关联分析群体材料 | 第46页 |
| 2.2.2 关联群体表型鉴定及数据统计分析 | 第46页 |
| 2.2.3 全基因组关联分析 | 第46-47页 |
| 2.3 解析zmERF-Ⅶs基因与耐渍性的关联性 | 第47-51页 |
| 2.3.1 zmERF-Ⅶs基因序列克隆 | 第47页 |
| 2.3.2 zmERF-Ⅶs基因进化关系分析 | 第47页 |
| 2.3.3 zmERF-Ⅶs基因共线性分析 | 第47-48页 |
| 2.3.4 zmERF-Ⅶs表达模式分析 | 第48页 |
| 2.3.5 关联群体存活率表型鉴定 | 第48页 |
| 2.3.6 候选基因关联分析 | 第48-49页 |
| 2.3.7 zmERF-Ⅶa1.2重测序分析 | 第49页 |
| 2.3.8 zmERF-Ⅶa1.2表达量分析 | 第49页 |
| 2.3.9 zmERF-Ⅶa1.2在拟南芥中超表达分析 | 第49-51页 |
| 3 结果与分析 | 第51-87页 |
| 3.1 基于A3237与A3239的连锁定位 | 第51-65页 |
| 3.1.1 A3237与A3239表型差异分析 | 第51-53页 |
| 3.1.2 A3237与A3239生理响应差异分析 | 第53-54页 |
| 3.1.3 A3237与A3239蛋白质差异分析 | 第54-61页 |
| 3.1.4 A3237与A3239遗传差异分析及连锁图谱构建 | 第61-62页 |
| 3.1.5 F_(2:3)群体表型统计分析 | 第62-63页 |
| 3.1.6 QTL定位分析及候选基因预测 | 第63-65页 |
| 3.2 全基因组关联分析 | 第65-72页 |
| 3.2.1 关联群体的表型变异 | 第65-68页 |
| 3.2.2 关联分析 | 第68-69页 |
| 3.2.3 关联分析结果与前人研究结果比较分析 | 第69-72页 |
| 3.3 zmERF-Ⅶs基因特征及其与玉米耐渍性的关联性 | 第72-87页 |
| 3.3.1 zmERF-Ⅶs基因结构分析 | 第72-73页 |
| 3.3.2 zmERF-Ⅶs基因进化关系分析 | 第73-75页 |
| 3.3.3 zmERF-Ⅶs基因共线性分析 | 第75-76页 |
| 3.3.4 zmERF-Ⅶs基因表达模式分析 | 第76-79页 |
| 3.3.5 zmERF-Ⅶs基因候选基因关联分析 | 第79-81页 |
| 3.3.6 zmERF-Ⅶa1.2遗传多样性分析 | 第81-84页 |
| 3.3.7 zmERF-Ⅶa1.2表达量与表型的相关性 | 第84-85页 |
| 3.3.8 zmERF-Ⅶa1.2在拟南芥中超表达分析 | 第85-87页 |
| 4 讨论 | 第87-95页 |
| 4.1 多方面解析A3237与A3239间差异 | 第87-89页 |
| 4.1.1 A3237与A3239渍水胁迫后表型变异 | 第87-88页 |
| 4.1.2 蛋白质组水平解析A3237与A3239耐性差异 | 第88-89页 |
| 4.1.3 A3237与A3239遗传差异解析 | 第89页 |
| 4.2 连锁定位候选区间分析 | 第89-90页 |
| 4.3 全基因组关联分析解析玉米苗期耐渍性遗传基础 | 第90-92页 |
| 4.3.1 玉米苗期耐渍性指标的评价 | 第90-91页 |
| 4.3.2 玉米全基因组内可能的耐渍性遗传位点 | 第91-92页 |
| 4.3.3 可能的耐渍性候选基因分析 | 第92页 |
| 4.4 玉米zmERF-Ⅶs家族基因特征 | 第92-93页 |
| 4.5 zmERF-Ⅶa1.2在玉米苗期耐渍性响应中的重要作用 | 第93-94页 |
| 4.6 总结 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-116页 |
| 附录 | 第116-139页 |
| 附录一 植物总RNA的提取 | 第116页 |
| 附录二 植物总RNA纯化 | 第116-117页 |
| 附录三 RNA的反转录 | 第117页 |
| 附录四 qRT-PCR引物序列信息 | 第117-118页 |
| 附录五 玉米总DNA的小量提取(CTAB法) | 第118页 |
| 附录六 QTL区段内开发的分子标记信息 | 第118页 |
| 附录七 PCR体系和程序 | 第118-119页 |
| 附录八 PAGE胶制备和PCR产物检测 | 第119-121页 |
| 附录九 zmERF-Ⅶs基因qRT-PCR分析引物信息 | 第121-122页 |
| 附录十 电转法制备农杆菌感受态 | 第122页 |
| 附录十一 农杆菌双元载体的构建 | 第122-123页 |
| 附录十二 花序侵染法转化拟南芥的流程 | 第123-124页 |
| 附录十三 拟南芥阳性苗筛选 | 第124-125页 |
| 附录十四 iTRAQ鉴定到的蛋白质的GO分类 | 第125-126页 |
| 附录十五 57个A3239中特异响应的蛋白信息 | 第126-129页 |
| 附录十六 73个A3237和A3239共同响应的蛋白信息 | 第129-133页 |
| 附录十七 F_2群体连锁图谱信息 | 第133-134页 |
| 附录十八 8个性状显著关联SNP位点的详细信息 | 第134-136页 |
| 附录十九 SK1、SK2和SUB1A与玉米ERF基因序列相似性 | 第136-137页 |
| 附录二十 渍水处理后ADH1组织特异性表达模式 | 第137-138页 |
| 附录二十一 在读期间发表论文 | 第138-139页 |
| 致谢 | 第139-140页 |
