| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-15页 |
| 1.1 研究工作的背景与意义 | 第10-11页 |
| 1.1.1 核小体空白区域NFR | 第10页 |
| 1.1.2 脱氧核糖核酸酶I高敏感位点 | 第10-11页 |
| 1.1.3 研究意义 | 第11页 |
| 1.2 DHS的国内外研究历史与现状 | 第11-13页 |
| 1.2.1 传统的Southern blotting方法 | 第11页 |
| 1.2.2 高通量技术 | 第11-13页 |
| 1.3 本文的主要贡献与创新 | 第13-14页 |
| 1.4 本论文的结构安排 | 第14-15页 |
| 第二章 项目规划和可行性测试 | 第15-24页 |
| 2.1 实验规划 | 第15-17页 |
| 2.2 琼脂糖凝胶测试 | 第17-18页 |
| 2.2.1 琼脂糖凝胶浓度选择 | 第17页 |
| 2.2.2 琼脂糖内DNA分子扩散的效率测试 | 第17-18页 |
| 2.3 裸露DNA酶切和MDA分析 | 第18-23页 |
| 2.3.1 酶切条件设置 | 第19页 |
| 2.3.2 DNaseI酶切电泳检测 | 第19-20页 |
| 2.3.3 MDA反应设置 | 第20页 |
| 2.3.4 MDA产物检测 | 第20-23页 |
| 2.4 本章小结 | 第23-24页 |
| 第三章 材料和方法 | 第24-41页 |
| 3.1 试剂和耗材准备 | 第24-32页 |
| 3.2 细胞准备 | 第32页 |
| 3.3 细胞弱裂解 | 第32-34页 |
| 3.4 脱氧核糖核酸酶I酶切 | 第34页 |
| 3.4.1 设置酶切反应 | 第34页 |
| 3.4.2 琼脂糖胶固定细胞 | 第34页 |
| 3.5 细胞核裂解 | 第34-35页 |
| 3.6 检测酶切片段大小 | 第35页 |
| 3.7 末端修复 | 第35页 |
| 3.8 TAG接头连接 | 第35-36页 |
| 3.9 缺.补平 | 第36-37页 |
| 3.10 QPCR质控检测 | 第37-39页 |
| 3.11接头连接后的MDA反应以及QC | 第39-40页 |
| 3.12构建DNA文库 | 第40页 |
| 3.13本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 结果和讨论 | 第41-56页 |
| 4.1 酶切结果分析 | 第41页 |
| 4.2 接头连接后QC | 第41-48页 |
| 4.2.1 QPCR定量样品DNA浓度 | 第41-44页 |
| 4.2.2 QPCR定量TAG接头浓度 | 第44-48页 |
| 4.3 MDA后QC | 第48-50页 |
| 4.4 末端修复条件探索 | 第50-52页 |
| 4.5 接头长度比较 | 第52-53页 |
| 4.6 MDA优化 | 第53-54页 |
| 4.7 测序结果初步分析 | 第54-56页 |
| 第五章 全文总结与展望 | 第56-58页 |
| 5.1 全文总结 | 第56页 |
| 5.2 后续工作展望 | 第56-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-61页 |
| 附录:缩略词和专业术语的解释 | 第61-62页 |
| 攻读硕士学位期间取得的成果 | 第62-63页 |