CONTENTS | 第5-8页 |
摘要 | 第8-9页 |
Abstract | 第9-10页 |
1 前言 | 第11-26页 |
1.1 微生物全基因组测序研究进展 | 第11-20页 |
1.1.1 微生物全基因组学研究 | 第11-13页 |
1.1.2 测序技术的发展近况 | 第13-18页 |
1.1.3 生物信息学研究 | 第18-20页 |
1.2 阿特拉津危害及降解的相关研究概述 | 第20-23页 |
1.2.1 阿特拉津的危害 | 第20-21页 |
1.2.2 阿特拉津污染的修复以及降解菌分离的情况 | 第21-22页 |
1.2.3 阿特拉津降解机制 | 第22-23页 |
1.3 主要研究内容和意义 | 第23-24页 |
1.3.1 主要研究内容 | 第23-24页 |
1.3.2 研究意义 | 第24页 |
1.4 技术路线 | 第24-26页 |
2 材料与方法 | 第26-33页 |
2.1 材料与仪器 | 第26-29页 |
2.1.1 供试菌株 | 第26页 |
2.1.2 试验所用的药品与试剂 | 第26-27页 |
2.1.3 试验所用的仪器设备 | 第27页 |
2.1.4 培养液 | 第27-28页 |
2.1.5 主要软件与数据库 | 第28-29页 |
2.2 阿特拉津降解菌Arthrobacter sp.DNS10全基因组测序 | 第29-33页 |
2.2.1 阿特拉津降解菌Arthrobacter sp.DNS10基因组DNA的提取 | 第29页 |
2.2.2 基因组测序 | 第29-30页 |
2.2.3 全序列的获取及其生物信息学分析 | 第30-33页 |
3 结果与分析 | 第33-57页 |
3.1 菌株Arthrobacter sp.DNS10全基因组基本特征 | 第33-40页 |
3.1.1 菌株Arthrobacter sp.DNS10高通量测序初步结果 | 第33-34页 |
3.1.2 菌株Arthrobacter sp.DNS10高通量测序数据组装结果 | 第34-36页 |
3.1.3 菌株Arthrobacter sp.DNS10基因功能注释 | 第36-40页 |
3.2 菌株Arthrobacter sp.DNS10的代谢通路分析 | 第40-51页 |
3.2.1 菌株Arthrobacter sp.DNS10的DNA复制通路 | 第40-41页 |
3.2.2 菌株Arthrobacter sp.DNS10内生物能量的代谢 | 第41-51页 |
3.3 菌株Arthrobacter sp.DNS10降解基因的全序列克隆及生物信息学分析 | 第51-57页 |
3.3.1 trzN,atzB,atzC基因序列的分析 | 第52-53页 |
3.3.2 降解基因trzN、atzB、atzC氨基酸的分析 | 第53-54页 |
3.3.3 降解基因trzN、atzB、atzC编码的蛋白质的二级和三级结构分析 | 第54-57页 |
4 讨论 | 第57-60页 |
4.1 阿特拉津降解菌Arthrobacter sp.DNS10的全基因组研究 | 第57-59页 |
4.2 阿特拉津降解基因的生物学研究 | 第59-60页 |
5 结论 | 第60-61页 |
致谢 | 第61-62页 |
参考文献 | 第62-70页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第70页 |