摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第一章 计算机辅助药物分子设计与HIV-1、GPR55抑制剂及TLR8激动剂的介绍 | 第10-30页 |
1.1 计算机辅助药物分子设计方法 | 第10-22页 |
1.1.1 计算机辅助药物分子设计方法概述 | 第10-11页 |
1.1.2 定量构效关系简介 | 第11页 |
1.1.3 2D-QSAR简介 | 第11-15页 |
1.1.4 3D-QSAR简介 | 第15-17页 |
1.1.5 定量构效关系模型稳定性和可靠性评估 | 第17-18页 |
1.1.6 分子对接的介绍 | 第18-20页 |
1.1.7 分子动力学介绍 | 第20-22页 |
1.2 本论文工作介绍 | 第22-25页 |
1.2.1 HIV-1抑制剂 | 第22-23页 |
1.2.2 GPR55抑制剂 | 第23-24页 |
1.2.3 TLR8激动剂 | 第24-25页 |
参考文献 | 第25-30页 |
第二章 HIV-1抑制剂的定量构效关系、分子对接和分子动力学模拟研究 | 第30-47页 |
2.1 研究背景 | 第30-31页 |
2.2 数据集和研究方法 | 第31-35页 |
2.2.1 数据集 | 第31-33页 |
2.2.2 基于结构分子描述符的计算 | 第33页 |
2.2.3 基于SMILES编码的计算 | 第33-34页 |
2.2.4 虚拟筛选和分子对接 | 第34页 |
2.2.5 分子动力学模拟 | 第34-35页 |
2.3 结果和讨论 | 第35-44页 |
2.3.1 基于结构描述符线性建模的结果和讨论 | 第35-37页 |
2.3.2 基于SMILES编码的线性建模的结果和讨论 | 第37-40页 |
2.3.3 分子对接的结果和讨论 | 第40-43页 |
2.3.4 分子动力学的结果和讨论 | 第43-44页 |
2.4 结论 | 第44-45页 |
参考文献 | 第45-47页 |
第三章 GPR55拮抗剂的定量构效关系与分子设计研究 | 第47-70页 |
3.1 研究背景 | 第47-48页 |
3.2 数据集和研究方法 | 第48-52页 |
3.2.1 数据集 | 第48-51页 |
3.2.2 基于结构分子描述符的计算 | 第51页 |
3.2.3 基于SMILES编码的计算 | 第51页 |
3.2.4 3D-QSAR模型的构建 | 第51-52页 |
3.2.5 模型预测能力的验证 | 第52页 |
3.3 结果与讨论 | 第52-66页 |
3.3.1 基于结构描述符线性建模的结果和讨论 | 第52-57页 |
3.3.2 基于SMILES编码的线性建模的结果和讨论 | 第57-58页 |
3.3.3 3D-QSAR的结果和讨论 | 第58-61页 |
3.3.4 设计新的化合物 | 第61-63页 |
3.3.5 对文献中没有具体活性值的化合物的预测 | 第63-66页 |
3.4 结论 | 第66-68页 |
参考文献 | 第68-70页 |
第四章 TLR8激动剂的定量构效关系、分子对接和分子动力学模拟研究 | 第70-88页 |
4.1 背景研究 | 第70-71页 |
4.2 数据集和研究方法 | 第71-76页 |
4.2.1 数据集 | 第71-73页 |
4.2.2 基于SMILES编码的计算 | 第73-74页 |
4.2.3 3D-QSAR模型的构建 | 第74-75页 |
4.2.4 分子对接 | 第75页 |
4.2.5 分子动力学模拟 | 第75-76页 |
4.3 结果讨论 | 第76-85页 |
4.3.1 基于SMILES编码的线性建模的结果和讨论 | 第76-77页 |
4.3.2 3D-QSAR的结果和讨论 | 第77-81页 |
4.3.3 分子对接的结果和讨论 | 第81-84页 |
4.3.4 分子动力学的结果和讨论 | 第84-85页 |
4.4 结论 | 第85-86页 |
参考文献 | 第86-88页 |
在学期间的研究成果 | 第88-89页 |
致谢 | 第89页 |