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药物分子的计算机辅助理论模拟及分子设计

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 计算机辅助药物分子设计与HIV-1、GPR55抑制剂及TLR8激动剂的介绍第10-30页
    1.1 计算机辅助药物分子设计方法第10-22页
        1.1.1 计算机辅助药物分子设计方法概述第10-11页
        1.1.2 定量构效关系简介第11页
        1.1.3 2D-QSAR简介第11-15页
        1.1.4 3D-QSAR简介第15-17页
        1.1.5 定量构效关系模型稳定性和可靠性评估第17-18页
        1.1.6 分子对接的介绍第18-20页
        1.1.7 分子动力学介绍第20-22页
    1.2 本论文工作介绍第22-25页
        1.2.1 HIV-1抑制剂第22-23页
        1.2.2 GPR55抑制剂第23-24页
        1.2.3 TLR8激动剂第24-25页
    参考文献第25-30页
第二章 HIV-1抑制剂的定量构效关系、分子对接和分子动力学模拟研究第30-47页
    2.1 研究背景第30-31页
    2.2 数据集和研究方法第31-35页
        2.2.1 数据集第31-33页
        2.2.2 基于结构分子描述符的计算第33页
        2.2.3 基于SMILES编码的计算第33-34页
        2.2.4 虚拟筛选和分子对接第34页
        2.2.5 分子动力学模拟第34-35页
    2.3 结果和讨论第35-44页
        2.3.1 基于结构描述符线性建模的结果和讨论第35-37页
        2.3.2 基于SMILES编码的线性建模的结果和讨论第37-40页
        2.3.3 分子对接的结果和讨论第40-43页
        2.3.4 分子动力学的结果和讨论第43-44页
    2.4 结论第44-45页
    参考文献第45-47页
第三章 GPR55拮抗剂的定量构效关系与分子设计研究第47-70页
    3.1 研究背景第47-48页
    3.2 数据集和研究方法第48-52页
        3.2.1 数据集第48-51页
        3.2.2 基于结构分子描述符的计算第51页
        3.2.3 基于SMILES编码的计算第51页
        3.2.4 3D-QSAR模型的构建第51-52页
        3.2.5 模型预测能力的验证第52页
    3.3 结果与讨论第52-66页
        3.3.1 基于结构描述符线性建模的结果和讨论第52-57页
        3.3.2 基于SMILES编码的线性建模的结果和讨论第57-58页
        3.3.3 3D-QSAR的结果和讨论第58-61页
        3.3.4 设计新的化合物第61-63页
        3.3.5 对文献中没有具体活性值的化合物的预测第63-66页
    3.4 结论第66-68页
    参考文献第68-70页
第四章 TLR8激动剂的定量构效关系、分子对接和分子动力学模拟研究第70-88页
    4.1 背景研究第70-71页
    4.2 数据集和研究方法第71-76页
        4.2.1 数据集第71-73页
        4.2.2 基于SMILES编码的计算第73-74页
        4.2.3 3D-QSAR模型的构建第74-75页
        4.2.4 分子对接第75页
        4.2.5 分子动力学模拟第75-76页
    4.3 结果讨论第76-85页
        4.3.1 基于SMILES编码的线性建模的结果和讨论第76-77页
        4.3.2 3D-QSAR的结果和讨论第77-81页
        4.3.3 分子对接的结果和讨论第81-84页
        4.3.4 分子动力学的结果和讨论第84-85页
    4.4 结论第85-86页
    参考文献第86-88页
在学期间的研究成果第88-89页
致谢第89页

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