| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 本文缩写词表 | 第13-16页 |
| 第1章 文献综述 | 第16-34页 |
| 1.1 烟草和烟碱 | 第16-20页 |
| 1.1.1 烟草 | 第16-17页 |
| 1.1.2 烟碱 | 第17-20页 |
| 1.2 烟草尼古丁的调控和诱导 | 第20-23页 |
| 1.2.1 烟草尼古丁的合成与代谢 | 第20-21页 |
| 1.2.2 转录因子对尼古丁合成的调控 | 第21-23页 |
| 1.2.3 打顶和叶片损伤对烟草尼古丁合成的诱导 | 第23页 |
| 1.3 植物内源非编码小RNA在植物生长发育过程中的作用 | 第23-33页 |
| 1.3.1 内源非编码小RNA | 第24-26页 |
| 1.3.2 植物中的miRNA及其功能 | 第26-30页 |
| 1.3.4 非编码小RNA在植物抵御生物胁迫和环境胁迫中的功能 | 第30-33页 |
| 1.3.4.1 小RNA在非生物胁迫中的适应性 | 第30-32页 |
| 1.3.4.2 小RNA在生物胁迫中的调控 | 第32-33页 |
| 1.4 高通量测序技术 | 第33-34页 |
| 第2章 烟草尼古丁合成诱导因子——叶片损伤和打顶相关小RNA基因分析 | 第34-84页 |
| 2.1 前言 | 第34-35页 |
| 2.2 材料和方法 | 第35-38页 |
| 2.2.1 植物材料和样品制备 | 第35页 |
| 2.2.2 烟草RNA的提取和小RNA的降解组测序 | 第35-36页 |
| 2.2.3 烟草序列分析的数据库信息概要 | 第36-37页 |
| 2.2.4 miRNA和小RNA簇的鉴别 | 第37页 |
| 2.2.5 基于降解组测序的小RNA靶基因识别 | 第37-38页 |
| 2.2.6 miRNA表达的Northern杂交验证 | 第38页 |
| 2.3 结果与分析 | 第38-80页 |
| 2.3.1 烟草小RNA的高通量深度测序 | 第38-41页 |
| 2.3.2 烟草中miRNA和相位siRNA的鉴定 | 第41-66页 |
| 2.3.2.1 miRNA的预测和鉴定 | 第41-52页 |
| 2.3.2.2 产生相位siRNA的基因位点鉴定 | 第52-66页 |
| 2.3.3 小RNA靶基因的降解组测序鉴定 | 第66-75页 |
| 2.3.3.1 miRNA靶基因鉴定 | 第66-73页 |
| 2.3.3.2 相位小RNA靶基因鉴定 | 第73-75页 |
| 2.3.4 打顶和叶片损伤相关小RNA | 第75-80页 |
| 2.3.4.1 与打顶和叶片损伤相关miRNA | 第75-78页 |
| 2.3.4.2 与打顶和叶片损伤相关相位小RNA | 第78-80页 |
| 2.4 讨论 | 第80-84页 |
| 2.4.1 小RNA调控烟草植株伤害应激生理反应 | 第80-81页 |
| 2.4.2 小RNA调控烟草尼古丁合成途径 | 第81-84页 |
| 第3章 烟草亚甲基四氢叶酸还原酶及其尼古丁合成相关基因表达的芯片分析 | 第84-95页 |
| 3.1 前言 | 第84-86页 |
| 3.2 材料与方法 | 第86-88页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第86-87页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第87-88页 |
| 3.2.2.1 烟草总RNA的提取 | 第87页 |
| 3.2.2.2 亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因的克隆和测序 | 第87页 |
| 3.2.2.3 基因芯片分析流程 | 第87-88页 |
| 3.3 结果与分析 | 第88-92页 |
| 3.3.1 烟草MTHFR过表达和RNAi干扰转基因植株基因表达分析 | 第88-90页 |
| 3.3.2 同尼古丁合成相关基因的表达变化分析 | 第90-92页 |
| 3.4 讨论与结论 | 第92-95页 |
| 参考文献 | 第95-106页 |
| 附件 | 第106-144页 |
| 博士期间取得科研成果 | 第144-145页 |
| 致谢 | 第145页 |
