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啤酒花矮化类病毒寄主适应性和致病性研究

摘要第1-6页
Abstract第6-13页
第一章 绪论第13-36页
   ·类病毒概述第13-19页
     ·类病毒的发现及分类第13-15页
     ·类病毒的生物学特征第15-19页
   ·类病毒的结构第19-21页
   ·类病毒的复制第21-26页
     ·类病毒的亚细胞定位第22页
     ·RNA 转录第22-25页
     ·剪切和连接第25-26页
   ·类病毒的移动和运输第26-28页
     ·细胞与细胞间的转运第27页
     ·长距离运输第27-28页
   ·类病毒的致病机制第28-32页
     ·类病毒与寄主因子的相互作用第28-31页
     ·RNA 沉默与类病毒致病性第31页
     ·类病毒的侵染对寄主特定基因的表达的影响第31-32页
   ·类病毒的遗传与进化第32页
     ·种群形成机制第32页
     ·遗传多样性与寄主的适应性第32页
   ·类病毒研究的基础生物学意义第32-33页
   ·本研究的目的、意义及技术路线第33-36页
     ·本研究的目的和意义第33-34页
     ·研究内容和技术路线第34-36页
第二章 多聚探针同时检测 4 种侵染葡萄的类病毒第36-46页
   ·前言第36-37页
   ·实验材料第37-38页
     ·材料的采集第37页
     ·试剂及溶液配制第37-38页
     ·主要仪器第38页
   ·实验方法第38-40页
     ·总 RNA 提取第38页
     ·RT-PCR,克隆和测序第38-39页
     ·单个类病毒的探针和多聚探针 (Polyprobe) 的制备第39-40页
     ·斑点杂交 (Dot-blot hybridization)第40页
   ·结果第40-44页
     ·提取的葡萄总 RNA 的质量第40页
     ·多聚探针检测的特异性和灵敏度测定第40-41页
     ·使用多聚探针检测田间葡萄样品第41-42页
     ·葡萄类病毒田间发生分布的调查第42-44页
   ·讨论第44-46页
第三章 HSVd 发生和分布的调查及遗传进化分析第46-68页
   ·前言第46页
   ·实验材料第46-49页
     ·样品采集第46-47页
     ·试剂及溶液配制第47-49页
     ·主要仪器第49页
   ·实验方法第49-53页
     ·低分子量 RNA 的提取及浓度测定第49页
     ·HSVd-cRNA 探针制备及斑点杂交 (dot-blot hybridization)第49-51页
     ·RT-PCR、克隆和测序第51-53页
     ·序列分析及 HSVd 二级结构预测第53页
     ·系统发育分析第53页
   ·结果与分析第53-64页
     ·发生和分布第53页
     ·多序列比对第53-55页
     ·系统发育分析第55-62页
     ·重组分析第62-63页
     ·突变位点及信息位点的分析第63-64页
   ·讨论第64-68页
     ·HSVd 在不同寄主间的交叉传播第64-66页
     ·重组和突变是 HSVd 进化的动力第66页
     ·HSVd 复制相关的 Hairpin I 和 Loop E-like 结构基序第66-68页
第四章 HSVd-KY04 及 HSVd-KFKi 的寄主适应性和致病性研究第68-91页
   ·前言第68页
   ·实验材料第68-70页
     ·接种植株和接种物第68-69页
     ·试剂及常用溶液配制第69-70页
     ·主要仪器第70页
   ·实验方法第70-74页
     ·侵染性克隆的构建第70-72页
     ·RNA 的提取第72页
     ·小 RNA 的分离与纯化第72页
     ·核酸分子杂交检测第72-73页
     ·HSVd 的克隆及测序第73-74页
     ·高通量测序及分析第74页
   ·结果第74-89页
     ·HSVd-KY04 和 KFKi 的侵染性和复制稳定性第74-77页
     ·HSVd-KY04 和 KFKi 的致病性第77-78页
     ·HSVd-KY04 和 KFKi 的复制能力第78-79页
     ·HSVd-KY04 和 KFKi 的基因组 RNA 和 sRNAs 的积累第79-80页
     ·HSVd- KY04 和 KFKi 的结构稳定性第80-81页
     ·HSVd-KY04 和 KFKi 的高通量测序第81-82页
     ·HSVd-sRNAs (21~24 nt) 的分析第82-83页
     ·HSVd-sRNA 的大小分布第83-84页
     ·HSVd-sRNA 的 5~’末端碱基分析第84-85页
     ·HSVd-sRNA 在基因组上的不均衡分布第85-89页
   ·讨论第89-91页
     ·HSVd 在啤酒花上的进化第89页
     ·HSVd-KFKi 与 HSVd-KY04 的致病性变化第89-91页
全文结论第91-93页
参考文献第93-105页
致谢第105-106页
作者简历第106页

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