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海洋样品中放线菌菌株的分离及其抗生素生物合成基因簇的挖掘

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
缩略词表第11-13页
第一章 前言第13-27页
    1.1 放线菌简介第13-14页
    1.2 海洋放线菌简介第14-15页
    1.3 从海洋样品中筛选放线菌策略第15-16页
        1.3.1 海洋样品前处理第15页
        1.3.2 筛选海洋放线菌时培养基的选择第15-16页
    1.4 海洋放线菌产生的生物活性物质第16-17页
    1.5 筛选放线菌来源的天然产物的策略第17-24页
        1.5.1 调控基因激活沉默基因簇第18-20页
        1.5.2 药物靶标筛选第20-21页
        1.5.3 转录组信息挖掘策略第21页
        1.5.4 基因组信息挖掘第21-23页
        1.5.5 基因异源表达策略第23-24页
    1.6 本课题研究目的和意义第24-27页
        1.6.1 本课题研究目的第24-25页
        1.6.2 本课题研究意义第25-27页
第二章 实验材料与方法第27-41页
    2.1 海洋泥样信息第27页
    2.2 菌株第27-28页
    2.3 质粒第28页
    2.4 培养基与试剂第28-31页
        2.4.1 培养基第28-30页
        2.4.2 试剂第30-31页
    2.5 实验方法第31-41页
        2.5.1 菌种的培养及保藏第31-32页
            2.5.1.1 细菌的培养和保藏第31-32页
            2.5.1.2 链霉菌的培养和保藏第32页
            2.5.1.3 真菌的培养和保藏第32页
        2.5.2 从海洋土壤中筛选链霉菌第32页
        2.5.3 对获得的放线菌进行16s rDNA检测第32-33页
        2.5.4 生物活性测定第33页
            2.5.4.1 以红酵母、白假丝酵母为指示菌的生测第33页
            2.5.4.2 以DH5α、枯草芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌、蕈状芽孢杆菌、耻垢分支杆菌为指示菌的生测第33页
            2.5.4.3 以玉米小斑菌为指示菌做生测第33页
        2.5.5 链霉菌基因组提取(孢子提取法)第33页
        2.5.6 大肠杆菌质粒的提取第33-34页
        2.5.7 DNA片段回收第34页
        2.5.8 大肠杆菌感受态细胞的制备第34-35页
        2.5.9 将构建的质粒转化入E.coli感受态细胞中第35页
        2.5.10 链霉菌与大肠杆菌的属间接合转移第35页
        2.5.11 构建链霉菌基因组cosmid文库第35-39页
            2.5.11.1 提取基因组DNA第35-36页
            2.5.11.2 基因组DNA酶切第36-37页
            2.5.11.3 质粒载体的制备第37-38页
            2.5.11.4 对连接产物进行包装第38页
            2.5.11.5 包装产物的转染第38-39页
        2.5.12 阳性克隆的发酵及HPLC分析第39-41页
第三章 结果与讨论第41-57页
    3.1 海洋放线菌的分离第41页
    3.2 比较各菌株在不同培养基上的产孢情况第41-43页
    3.3 生物活性测定第43-45页
    3.4 链霉菌42第45-46页
    3.5 链霉菌42第46-47页
    3.6 接合转移子的生物活性测定第47-49页
    3.7 42第49-50页
    3.8 42第50-51页
    3.9 M1152/42第51-57页
        3.9.1 M1152/42第51-53页
        3.9.2 利用LC-MS对M1152/42第53-55页
        3.9.3 利用LC-MS对M1152/42第55-57页
第四章 总结与展望第57-59页
    4.1 工作总结第57-58页
        4.1.1 从海洋泥样中筛选放线菌第57页
        4.1.2 选用链霉菌42第57-58页
        4.1.3 对42第58页
    4.2 工作展望第58-59页
参考文献第59-65页
致谢第65-66页
学位论文评阅及答辩情况表第66页

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