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利用宏基因组技术克隆和鉴定高糖土壤中与糖类水解相关酶类的基因

摘要第4-8页
ABSTRACT第8-12页
第一章 前言第17-30页
    1.1 燃料酒精第17-18页
    1.2 宏基因组研究第18-23页
        1.2.1 微生物资源第18页
        1.2.2 未培养微生物第18-20页
        1.2.3 未培养微生物的研究方法第20页
        1.2.4 宏基因组的研究第20-23页
    1.3 β-葡萄糖苷酶第23-28页
        1.3.1 β-葡萄糖苷酶的分类第23-24页
        1.3.2 β-葡萄糖苷酶的分子结构和催化机制第24-25页
        1.3.3 β-葡萄糖苷酶的研究进展第25-27页
        1.3.4 β-葡萄糖苷酶的应用第27-28页
    1.4 蔗糖酶第28-29页
    1.5 本课题研究的目的和意义第29-30页
第二章 材料与方法第30-51页
    2.1 材料第30-31页
        2.1.1 菌株与质粒第30页
        2.1.2 主要酶制剂和化学试剂第30页
        2.1.3 PCR引物及DNA测序第30页
        2.1.4 主要仪器设备第30-31页
        2.1.5 培养基和溶液配制第31页
    2.2 方法与步骤第31-51页
        2.2.1 土样的采集第31页
        2.2.2 菌种保藏第31页
        2.2.3 细菌基因组总DNA的提取第31-32页
        2.2.4 小量质粒DNA提取第32页
        2.2.5 DNA酶切与连接第32页
        2.2.6 CaCl_2法制备大肠杆菌感受态细胞和转化第32页
        2.2.7 电透析洗脱法回收DNA片段第32-33页
        2.2.8 SDS-PAGE蛋白质电泳第33页
        2.2.9 蛋白质浓度测定第33-34页
        2.2.10 金属镍亲和层析柱纯化目的蛋白第34页
        2.2.11 高糖土壤宏基因组DNA提取第34-35页
        2.2.12 高糖土壤宏基因组DNA的纯化第35页
        2.2.13 高糖土壤细菌16S rDNA基因文库构建及系统发育分析第35-36页
        2.2.14 Fosmid文库的构建第36-38页
        2.2.15 高糖土壤基因组文库的筛选第38页
        2.2.16 重组Fosmid质粒的亚克隆及序列分析第38-39页
        2.2.17 基因的表达与蛋白质产物的纯化第39-44页
        2.2.18 蔗糖转化酶的酶学特性的测定第44-46页
        2.2.19 β-葡萄糖苷酶酶的酶学特性的测定第46-48页
        2.2.20 β-葡萄糖苷酶Unbgl3A定点饱和突变第48-51页
第三章 结果与分析第51-110页
    3.1 宏基因组Fosmid文库的构建和新型酶基因筛选第51-57页
        3.1.1 高糖土壤宏基因DNA提取和纯化第51-52页
        3.1.2 高糖土壤细菌多样性分析第52-53页
        3.1.3 高糖土壤宏基因组文库构建及质量评价第53-54页
        3.1.4 和糖类水解相关酶活性克隆的筛选第54-57页
    3.2 高效表达的酸性β-葡萄糖苷酶-Unbgl3A第57-72页
        3.2.1 unbgl3A基因的生物信息学分析第57-60页
        3.2.2 unbgl3A基因的克隆和表达第60-62页
        3.2.3 Unbgl3A的酶学特性研究第62-70页
        3.2.4 Unbgl3A β-葡萄糖苷酶基因的分子改造第70-72页
    3.3 高耐受酒精的β-葡萄糖苷酶-Unbgl3B第72-87页
        3.3.1 unbgl3B对基因的生物信息学分析第72-78页
        3.3.2 unbgl3B基因的克隆和表达第78-80页
        3.3.3 Unbgl3B的酶学特性分析第80-87页
    3.4 高耐受葡萄糖的β-葡萄糖苷酶-Unbgl1A第87-102页
        3.4.1 unbgl1A基因的生物信息学分析第87-91页
        3.4.2 unbgl1A基因的克隆和表达第91-94页
        3.4.3 Unbgl1A的酶学特性分析第94-102页
    3.5 中性蔗糖转化酶-Uminv4第102-110页
        3.5.1 uminv4基因的生物信息学分析第102-105页
        3.5.2 uminv4基因的克隆、表达第105-107页
        3.5.3 Uminv4的酶学特性研究第107-110页
第四章 讨论第110-117页
    4.1 高糖土壤宏基因组DNA提取与纯化第110-111页
    4.2 高效表达的酸性β-葡萄糖苷酶-Unbgl3A第111-112页
        4.2.1 Unbgl3A是一个被多种单糖和双糖激活的β-葡萄糖苷酶第111页
        4.2.2 Unbgl3A具有中温条件下热稳定的特性第111页
        4.2.3 Unbgl3A不是金属酶第111-112页
        4.2.4 Unbgl3A在大肠杆菌得到高效表达第112页
    4.3 高耐受酒精的β-葡萄糖苷酶-Unbgl3B第112-114页
        4.3.1 Unbgl3B是一个新的β-葡萄糖苷酶第112-113页
        4.3.2 Unbgl3B是一个水解作用温和的β-葡萄糖苷酶第113页
        4.3.3 Unbgl3B具有耐受酒精的优良特性第113-114页
    4.4 高耐受葡萄糖的β-葡萄糖苷酶-Unbgl1A第114-116页
        4.4.1 Unbgl1A是一个具有强的抗葡萄糖抑制的β-葡萄糖苷酶第114-115页
        4.4.2 Unbgl1A拥有一个高的酶活力和底物亲和力第115页
        4.4.3 Unbgl1A具有较强的转糖苷作用第115-116页
        4.4.4 Unbgl1A具有较强的耐受NaCl的能力第116页
    4.5 Uminv4是一个能水解菊糖的蔗糖转化酶第116-117页
第五章 结论和展望第117-121页
    5.1 结论第117-119页
        5.1.1 高糖土壤未培养微生物宏基因组的构建、筛选和多样性分析第117页
        5.1.2 Unbgl3A的克隆表达、酶学特性和生物信息学研究第117-118页
        5.1.3 Unbgl3B的克隆表达、酶学特性和生物信息学研究第118页
        5.1.4 Unbgl1A克隆表达、酶学特性和生物信息学研究第118-119页
        5.1.5 Uminv4克隆表达、酶学特性和生物信息学研究第119页
    5.2 展望第119-121页
参考文献第121-138页
附录1第138-142页
附录2第142-144页
致谢第144-145页
攻读学位期间所发表的学术论文和研究成果第145页

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