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中国汉族人群寻常型天疱疮全基因组关联分析研究

英文缩略词表第7-8页
中文摘要第8-12页
Abstract第12-15页
1 引言第16-22页
    1.1 研究背景第16-21页
        1.1.1 疾病概述第16-17页
        1.1.2 PV免疫学研究第17-18页
        1.1.3 PV遗传学研究第18-21页
    1.2 研究思路第21-22页
2 实验材料与方法第22-64页
    2.1 研究设计第22-25页
        2.1.1 初筛阶段第22页
        2.1.2 验证阶段第22-25页
    2.2 实验对象第25页
    2.3 实验试剂第25-28页
        2.3.1 DNA提取试剂第25-26页
        2.3.2 电泳相关试剂第26页
        2.3.3 全基因组基因分型所需试剂第26-27页
        2.3.4 Sequenom Mass Array系统基因分型所用试剂第27-28页
    2.4 实验仪器第28-31页
        2.4.1 DNA提取器材第28页
        2.4.2 电泳所用仪器第28-29页
        2.4.3 测OD值仪器第29页
        2.4.4 全基因组SNP分型仪器第29-30页
        2.4.5 Sequenom MassArray系统基因分型所用仪器第30-31页
    2.5 实验步骤第31-56页
        2.5.1 全血标本采集第31页
        2.5.2 基因组DNA提取第31-32页
        2.5.3 基因组DNA电泳检测第32-34页
        2.5.4 DNA浓度检测和标准化处理(简称DNA标化)第34-35页
        2.5.5 全基因组SNPs基因分型第35-43页
        2.5.6 Sequenom MassArray系统基因分型第43-56页
    2.6 数据质控与统计分析第56-57页
        2.6.1 质控方法第56-57页
        2.6.2 统计方法第57页
    2.7 分析软件和电子数据库信息查询第57-59页
        2.7.1 基因分型软件的应用:Plink 1.07第57页
        2.7.2 Haploview的应用第57-58页
        2.7.3 R软件的应用第58页
        2.7.4 美国国立生物技术信息中心第58-59页
        2.7.5 HapMap计划数据库第59页
        2.7.6 其他相关数据库及网站第59页
    2.8 数据的处理第59-61页
        2.8.1 初筛阶段样本质控第59-60页
        2.8.2 初筛阶段SNP质控第60-61页
        2.8.3 验证阶段的SNP质控第61页
        2.8.4 Illumiina和Sequenom MassArray的分型一致性比较第61页
    2.9 数据统计分析第61-64页
3 结果第64-87页
    3.1 研究对象一般情况和SNP数据第64页
    3.2 初筛阶段SNP分型数据的统计结果第64-77页
        3.2.1 中国汉族人群初筛结果第67-70页
        3.2.2 伊朗人群初筛结果第70-71页
        3.2.3 初筛阶段中国汉族和伊朗人群Meta分析结果第71-77页
    3.3 验证阶段SNP分型数据的统计结果第77-86页
        3.3.1 中国汉族人群验证结果和与伊朗人群验证结果的比较第77-84页
        3.3.2 中国汉族人群和伊朗人群Meta结果第84-86页
        3.3.3 对既往PV-GWAS报道位点的验证结果第86页
    3.4 对p38和其下游效应器MAPK蛋白激活激酶(MK2)基因在本研究中与PV相关性的观察第86-87页
4 讨论第87-94页
    4.1 本研究发现的PV的HLA区域易感位点第88-91页
    4.2 验证犹太人PV易感基因第91-92页
    4.3 与其他PV相关研究的比较第92-93页
    4.4 展望第93-94页
5 结论第94-96页
6 参考文献第96-106页
附录第106-109页
致谢第109-111页
课题综述 天疱疮遗传学发病机制研究进展第111-138页
    参考文献第126-138页

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