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马立克病毒感染后鸡脾脏转录组学及miR-M4-5p调控马立克病毒致病机理的研究

摘要第6-8页
abstract第8-10页
第一章 文献综述第14-35页
    1.1 马立克病毒的研究进展第14-21页
        1.1.1 MDV的分类第15-16页
        1.1.2 MDV基因组结构第16页
        1.1.3 MDV致瘤相关基因第16-18页
        1.1.4 MDV的感染阶段第18-19页
        1.1.5 影响MDV感染的因素第19-20页
        1.1.6 马立克病疫苗第20-21页
    1.2 MDV感染后宿主基因表达谱研究进展第21-26页
        1.2.1 利用芯片技术研究MDV感染后宿主基因表达谱第22-23页
        1.2.2 qRT-PCR技术研究MDV感染后宿主基因表达谱第23-24页
        1.2.3 RNA-seq技术及应用第24-26页
    1.3 病毒编码microRNA的研究进展第26-34页
        1.3.1 mcroiRNA的出现第26-27页
        1.3.2 病毒miRNA及其生物起源第27-28页
        1.3.3 疱疹病毒miRNA及其功能第28-32页
        1.3.4 MDV编码的miRNA第32-34页
    1.4 本研究的目的与意义第34-35页
第二章 MDV感染鸡脾脏组织转录组研究第35-62页
    2.1 前言第35页
    2.2 材料第35-36页
        2.2.1 构建测序文库及qRT-PCR验证的组织材料第35页
        2.2.2 主要试剂第35页
        2.2.3 主要仪器设备第35-36页
    2.3 方法第36-42页
        2.3.1 RNA提取及浓度测定第36-37页
        2.3.2 甲醛变性凝胶电泳检测RNA质量第37页
        2.3.3 测序文库的构建及测序第37-38页
        2.3.4 转录组测序数据质控和比对分析第38-39页
        2.3.5 qRT-PCR验证差异基因第39-42页
    2.4 结果与分析第42-59页
        2.4.1 RNA样品检测结果第42-44页
        2.4.2 Raw data的质量评估结果第44-45页
        2.4.3 Clean reads与参考基因组的比对结果第45-46页
        2.4.4 基因表达量分析结果第46-47页
        2.4.5 DEGs的筛选结果第47-48页
        2.4.6 qRT-PCR验证结果第48-49页
        2.4.7 DEGs的K-means分析结果第49-50页
        2.4.8 DEGs的GO、KEGG分析结果第50-57页
        2.4.9 蛋白互作网络第57-59页
    2.5 讨论第59-60页
    2.6 小结第60-62页
第三章 miR-M4-5p靶向hnRNPAB促进CEF和DF-1 细胞的增殖第62-87页
    3.1 前言第62页
    3.2 材料第62-65页
        3.2.1 病毒和细胞材料第62页
        3.2.2 载体第62页
        3.2.3 合成的引物或核酸序列第62-64页
        3.2.4 主要试剂第64页
        3.2.5 主要仪器设备第64-65页
    3.3 方法第65-73页
        3.3.1 生物信息学方法预测第65页
        3.3.2 psi CHECK2- 和pcDNA6.2- 系列载体构建第65-68页
        3.3.3 双荧光素酶报告实验第68-69页
        3.3.4 miR-M4-5p过表达和GX0101感染细胞样品的制备第69-70页
        3.3.5 荧光定量PCR第70-71页
        3.3.6 Western blot第71-72页
        3.3.7 细胞增殖和凋亡检测第72-73页
    3.4 结果与分析第73-81页
        3.4.1 生物信息学预测miR-M4-5p靶标第73-74页
        3.4.2 候选靶基因的载体构建结果第74-75页
        3.4.3 双荧光素酶报告基因检测结果第75-76页
        3.4.4 miR-M4-5p下调hnRNPAB mRNA水平的表达第76-78页
        3.4.5 miR-M4-5p抑制hnRNPAB蛋白水平的表达第78页
        3.4.6 miR-M4-5p靶向hnRNPAB促进CEF和DF-1 细胞的增殖第78-81页
    3.5 讨论第81-85页
        3.5.1 miR-M4-5p在MDV感染中的作用第81-82页
        3.5.2 HnRNPs家族成员在肿瘤中的作用及hnRNPAB的作用第82-85页
    3.6 小结第85-87页
第四章 鸡hnRNPAB蛋白单克隆抗体的制备第87-100页
    4.1 前言第87页
    4.2 材料第87-88页
        4.2.1 动物、细胞材料、载体和菌株第87页
        4.2.2 主要试剂第87-88页
        4.2.3 主要设备第88页
    4.3 方法第88-92页
        4.3.1 重组蛋白制备第88-89页
        4.3.2 小鼠免疫及检测第89-91页
        4.3.3 杂交瘤细胞制备及筛选第91页
        4.3.4 单克隆抗体制备第91-92页
        4.3.5 单克隆抗体的鉴定第92页
    4.4 结果与分析第92-98页
        4.4.1 HnRNPAB载体构建结果第92-93页
        4.4.2 HnRNPAB蛋白表达及纯化结果第93-95页
        4.4.3 HnRNPAB抗体的筛选及鉴定结果第95-97页
        4.4.4 HnRNPAB抗体的检测第97-98页
    4.5 讨论第98页
    4.6 小结第98-100页
全文总结与创新点第100-102页
    全文总结第100页
    创新点第100-102页
参考文献第102-117页
附录第117-122页
致谢第122-123页
作者简介第123-124页

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