| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-27页 |
| 1. 转录组概述 | 第11-13页 |
| 1.1 转录组在鱼类性别分化及性腺发育中的研究概况 | 第11-12页 |
| 1.2 转录组研究方法概述 | 第12-13页 |
| 2. 超雄鱼类研究进展 | 第13-14页 |
| 3. RNA结合蛋白概述 | 第14-24页 |
| 3.1 RNA结合蛋白的结构与作用机制 | 第14-17页 |
| 3.2 RNA结合蛋白在性别决定及性腺发育过程中的功能 | 第17-19页 |
| 3.3 RNA结合蛋白的研究方法 | 第19-21页 |
| 3.4 RNA Binding Mofit families（RBM）家族研究进展 | 第21-24页 |
| 4. 实验动物研究背景 | 第24-26页 |
| 4.1 黄颡鱼 | 第24-25页 |
| 4.2 斑马鱼 | 第25-26页 |
| 5. 研究目的和意义 | 第26-27页 |
| 第二章 黄颡鱼XY, YY精巢转录组分析 | 第27-52页 |
| 1. 实验材料 | 第27-28页 |
| 1.1 实验动物 | 第27页 |
| 1.2 所用载体 | 第27-28页 |
| 2. 实验方法 | 第28-36页 |
| 2.1 黄颡鱼基因组DNA提取 | 第28页 |
| 2.2 黄颡鱼性别鉴定 | 第28页 |
| 2.3 RNA抽提 | 第28-29页 |
| 2.4 Illumina RNA文库构建及测序 | 第29-30页 |
| 2.5 Illumina测序结果拼接及注释 | 第30-31页 |
| 2.6 差异mRNA表达分析 | 第31页 |
| 2.7 差异mRNA富集分析 | 第31-32页 |
| 2.8 RNA反转录 | 第32页 |
| 2.9 荧光定量PCR | 第32-34页 |
| 2.10 miRNA靶基因验证质粒构建 | 第34-35页 |
| 2.11 双荧光素酶系统验证 | 第35-36页 |
| 3. 结果 | 第36-50页 |
| 3.1 RNA质量检测 | 第36页 |
| 3.2 RNA高通量测序数据总览 | 第36-37页 |
| 3.3 de novo拼接及功能注释 | 第37-39页 |
| 3.4 Unigene表达丰度分析 | 第39-41页 |
| 3.5 差异表达Unigene统计 | 第41-42页 |
| 3.6 差异表达Unigene GO富集分析 | 第42-43页 |
| 3.7 差异表达Unigene KEGG富集分析 | 第43-46页 |
| 3.8 荧光定量PCR验证结果 | 第46-47页 |
| 3.9 miR-141/429 靶基因预测及双荧光素酶报告系统检测 | 第47-49页 |
| 3.10 miR141/429 及其潜在靶基因rbmx在XY、YY精巢中的表达 | 第49-50页 |
| 4. 讨论 | 第50-52页 |
| 第三章 rbmx基因在鱼类性腺发育过程中的功能研究 | 第52-92页 |
| 1. 实验材料 | 第52-53页 |
| 1.1 实验动物 | 第52-53页 |
| 1.2 所用载体 | 第53页 |
| 2. 实验方法 | 第53-68页 |
| 2.1 rbmx基因生物信息学分析 | 第53-54页 |
| 2.2 rbmx基因表达分析 | 第54-59页 |
| 2.3 斑马鱼rbmx基因CRISPR/Cas9敲除系统构建 | 第59-62页 |
| 2.4 显微注射 | 第62-63页 |
| 2.5 斑马鱼敲除靶位点有效性验证 | 第63-66页 |
| 2.6 斑马鱼F0代突变体筛选 | 第66页 |
| 2.7 斑马鱼F1代突变体筛选 | 第66-67页 |
| 2.8 斑马鱼F2纯合突变体筛选 | 第67页 |
| 2.9 斑马鱼F2代个体性别比例分析 | 第67页 |
| 2.10 斑马鱼rbmx~(-/-)精子活力分析 | 第67-68页 |
| 3. 结果 | 第68-89页 |
| 3.1 rbmx基因生物信息学分析 | 第68-74页 |
| 3.2 rbmx基因时空表达分析 | 第74-76页 |
| 3.3 斑马鱼rbmx CRISPR/Cas9系统构建 | 第76-80页 |
| 3.4 斑马鱼rbmx靶位点有效性验证及突变效率分析 | 第80-81页 |
| 3.5 rbmx F0代突变体筛选 | 第81-83页 |
| 3.6 rbmx F1代突变体筛选 | 第83-84页 |
| 3.7 rbmx F2代突变体筛选 | 第84-86页 |
| 3.8 rbmx F2代个体性别比例统计 | 第86-87页 |
| 3.9 rbmx~(-/-)突变体精子活力分析 | 第87-89页 |
| 4. 讨论 | 第89-92页 |
| 参考文献 | 第92-115页 |
| 附录 | 第115-118页 |
| 附录1 实验所需仪器 | 第115-116页 |
| 附录2 实验所需试剂 | 第116-117页 |
| 附录3 发表论文 | 第117-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
