| 目录 | 第4-7页 |
| 中文摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略词与中英文对照表 | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-33页 |
| 1.0 柑橘黄龙病概述 | 第15-16页 |
| 1.1 柑橘黄龙病症状 | 第16-17页 |
| 1.2 柑橘黄龙病检测技术 | 第17-20页 |
| 1.2.1 电镜检测 | 第17页 |
| 1.2.2 生化指标检测 | 第17-18页 |
| 1.2.3 高光谱检测方法 | 第18页 |
| 1.2.4 血清学检测 | 第18页 |
| 1.2.5 核酸检测 | 第18-20页 |
| 1.3 柑橘黄龙病病原 | 第20-23页 |
| 1.3.1 柑橘黄龙病病原菌的探索历程 | 第20-22页 |
| 1.3.2 柑橘黄龙病病原菌培养研究进展 | 第22-23页 |
| 1.4 韧皮部杆菌亚洲种遗传分化研究 | 第23-26页 |
| 1.4.1 基于单位点的韧皮部杆菌亚洲种遗传分化研究 | 第23-25页 |
| 1.4.2 基于多位点串联重复序列分析(MLVA)的CaLas遗传变异研究 | 第25-26页 |
| 1.5 柑橘黄龙病病原菌菌的寄主种类 | 第26-28页 |
| 1.5.1 昆虫寄主 | 第26页 |
| 1.5.2 植物寄主 | 第26-28页 |
| 1.6 柑橘黄龙病菌侵染寄主后转录组学研究进展 | 第28-30页 |
| 1.7 柑橘黄龙病菌致病机理研究进展 | 第30-33页 |
| 第二章 引言 | 第33-37页 |
| 第三章 韧皮部杆菌亚洲种培养探索 | 第37-47页 |
| 3.1 材料与方法 | 第37-41页 |
| 3.1.1 培养供试感病材料 | 第37页 |
| 3.1.2 主要试剂与仪器 | 第37-38页 |
| 3.1.3 所用培养基配方及培养方法 | 第38-39页 |
| 3.1.4 实时定量PCR检测及标准曲线的建立 | 第39-41页 |
| 3.2 结果与分析 | 第41-44页 |
| 3.2.1 三种实时定量PCR检测比较结果 | 第41页 |
| 3.2.2 实时定量PCR标准曲线 | 第41-43页 |
| 3.2.3 培养所用植物材料HLB检测结果 | 第43页 |
| 3.2.4 各种培养基培养结果 | 第43-44页 |
| 3.2.5 共培养放线菌检测结果 | 第44页 |
| 3.3 讨论 | 第44-46页 |
| 3.4 结论 | 第46-47页 |
| 第四章 基于SSR分子标记的中国韧皮部杆菌亚洲种种群结构研究 | 第47-79页 |
| 4.1 材料与方法 | 第47-56页 |
| 4.1.1 柑橘黄龙病样品采集 | 第47页 |
| 4.1.2 主要试剂与仪器 | 第47-49页 |
| 4.1.3 主要存储液及培养基配制 | 第49-50页 |
| 4.1.4 核酸DNA提取 | 第50页 |
| 4.1.5 PCR反应及所用引物 | 第50-53页 |
| 4.1.6 PAGE胶电泳及快速银染步骤 | 第53-54页 |
| 4.1.7 PCR产物纯化、克隆与测序 | 第54-55页 |
| 4.1.8 带型读取及聚类分析 | 第55-56页 |
| 4.2 结果与分析 | 第56-75页 |
| 4.2.1 黄龙病疑似样品的检测 | 第56-59页 |
| 4.2.2 引物退火温度优化 | 第59-61页 |
| 4.2.3 SSR变异位点筛选 | 第61-65页 |
| 4.2.4 基于5个SSR变异位点的中国8个CaLas地理种群结构研究 | 第65-73页 |
| 4.2.5 不同中国地理来源CaLas寄主症状比较 | 第73-74页 |
| 4.2.6 基于3个SSR变异位点世界不同CaLas地理种群结构研究 | 第74-75页 |
| 4.3 讨论 | 第75-78页 |
| 4.4 结论 | 第78-79页 |
| 第五章 CaLas侵染甜橙后的转录组学研究 | 第79-107页 |
| 5.1 材料与方法 | 第79-85页 |
| 5.1.1 甜橙苗木准备及嫁接毒源 | 第79-80页 |
| 5.1.2 核酸RNA提取 | 第80页 |
| 5.1.3 转录组测序分析 | 第80-82页 |
| 5.1.4 测序结果qPCR验证 | 第82-85页 |
| 5.2 结果与分析 | 第85-104页 |
| 5.2.1 嫁接甜橙苗HLB检测 | 第85页 |
| 5.2.2 嫁接传毒甜橙苗其他病害检测 | 第85-86页 |
| 5.2.3 送测序样品RNA质量检测 | 第86-87页 |
| 5.2.4 测序数据情况概况 | 第87-89页 |
| 5.2.5 测序所获得的新基因 | 第89-91页 |
| 5.2.6 两样品比对差异基因情况 | 第91页 |
| 5.2.7 差异基因GO分类 | 第91-94页 |
| 5.2.8 差异基因COG分类 | 第94-95页 |
| 5.2.9 差异基因KEGG注释 | 第95-103页 |
| 5.2.10 差异基因qPCR实时验证结果 | 第103-104页 |
| 5.3 讨论 | 第104-106页 |
| 5.4 结论 | 第106-107页 |
| 第六章 不同品种间差异基因表达情况 | 第107-115页 |
| 6.1 材料与方法 | 第107页 |
| 6.1.1 供试苗木嫁接及传毒 | 第107页 |
| 6.1.2 供试苗木核酸DNA提取及柑橘黄龙病的实时检测 | 第107页 |
| 6.1.3 核酸RNA提取及表达量验证 | 第107页 |
| 6.2 结果与分析 | 第107-113页 |
| 6.2.1 嫁接HLB检测 | 第108-109页 |
| 6.2.2 差异基因在不同品种中表达情况 | 第109-111页 |
| 6.2.3 差异基因蛋白互作分析 | 第111-113页 |
| 6.3 讨论 | 第113-114页 |
| 6.4 结论 | 第114-115页 |
| 第七章 主要结论、创新点及研究展望 | 第115-119页 |
| 7.1 主要结论 | 第115-116页 |
| 7.1.1 病原纯培养结果 | 第115页 |
| 7.1.2 中国境内CaLas多态性研究 | 第115页 |
| 7.1.3 甜橙在CaLas侵染后的转录组学研究 | 第115-116页 |
| 7.1.4 不同品种间差异基因表达情况 | 第116页 |
| 7.2 创新点 | 第116-117页 |
| 7.3 研究展望 | 第117-119页 |
| 参考文献 | 第119-133页 |
| 攻读学位期间发表论文及参加科研项目 | 第133-135页 |
| 致谢 | 第135-139页 |
| 附录Ⅰ | 第139-140页 |
