| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-18页 |
| 1.1 半滑舌鳎概述 | 第12页 |
| 1.2 星斑川鲽概述 | 第12页 |
| 1.3 微卫星 | 第12-15页 |
| 1.3.1 SSR标记的起源 | 第13页 |
| 1.3.2 SSR标记的优缺点 | 第13-14页 |
| 1.3.3 SSR标记的研究方法 | 第14页 |
| 1.3.4 SSR标记在鱼类遗传育种中的应用 | 第14-15页 |
| 1.4 遗传多样性的概念及研究意义 | 第15-16页 |
| 1.4.1 遗传多样性的概念 | 第15-16页 |
| 1.4.2 遗传多样性的研究意义 | 第16页 |
| 1.5 鱼类性别相关SSR标记的研究概况 | 第16-17页 |
| 1.6 本论文的研究目的与意义 | 第17-18页 |
| 第二章 半滑舌鳎真、伪雄鱼母系半同胞家系的遗传性状分析 | 第18-31页 |
| 2.1 材料与方法 | 第18-23页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第18-19页 |
| 2.1.1.1 实验用鱼 | 第18页 |
| 2.1.1.2 仪器与试剂 | 第18-19页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第19-23页 |
| 2.1.2.1 半滑舌鳎真、伪雄鱼半同胞家系的建立、培育 | 第19页 |
| 2.1.2.2 样本采集 | 第19页 |
| 2.1.2.3 基因组DNA的提取 | 第19-20页 |
| 2.1.2.4 微卫星引物 | 第20-21页 |
| 2.1.2.5 PCR扩增反应体系与程序 | 第21-22页 |
| 2.1.2.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测和基因分型 | 第22-23页 |
| 2.1.2.6 数据分析 | 第23页 |
| 2.2 结果 | 第23-28页 |
| 2.2.1 基因组DNA提取结果 | 第23-24页 |
| 2.2.2 微卫星扩增图谱 | 第24-25页 |
| 2.2.3 四个家系群体的遗传多样性与分化 | 第25-27页 |
| 2.2.4 四个家系群体间的Nei's遗传距离和遗传相似性系数分析 | 第27-28页 |
| 2.3 讨论 | 第28-31页 |
| 2.3.1 遗传多样性分析 | 第28-29页 |
| 2.3.2 杂合度 | 第29页 |
| 2.3.3 多态信息含量 | 第29页 |
| 2.3.4 真、伪雄鱼半同胞家系群体间的遗传分化 | 第29-31页 |
| 第三章 星斑川鲽微卫星标记的开发及其相关类型特征分析 | 第31-44页 |
| 3.1 材料和方法 | 第31-33页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第31-32页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第32-33页 |
| 3.1.2.1 DNA提取 | 第32页 |
| 3.1.2.2 RAD-seq测序文库的构建与微卫星序列的查找 | 第32页 |
| 3.1.2.3 微卫星序列统计术语的定义 | 第32页 |
| 3.1.2.4 微卫星序列的特征分析 | 第32-33页 |
| 3.2 实验结果 | 第33-41页 |
| 3.2.1 星斑川鲽微卫星序列各重复类型的分析 | 第33页 |
| 3.2.2 星斑川鲽微卫星序列各重复拷贝类别的分析 | 第33-34页 |
| 3.2.3 星斑川鲽微卫星序列的重复拷贝数及变异能力分析 | 第34-40页 |
| 3.2.4 星斑川鲽微卫星序列中AT含量与各重复单元微卫星序列的重复序列数、累积长度及平均拷贝数间的相关性分析 | 第40-41页 |
| 3.3 讨论 | 第41-44页 |
| 3.3.1 RAD-seq技术及其应用优势 | 第41页 |
| 3.3.2 星斑川鲽微卫星序列各重复类型和各重复拷贝类别分析 | 第41-42页 |
| 3.3.3 星斑川鲽微卫星序列的重复单元长度与拷贝数及变异系数间的相关关系 | 第42页 |
| 3.3.4 星斑川鲽微卫星序列中的AT含量 | 第42-44页 |
| 第四章 星斑川鲽性别相关SSR标记的筛选 | 第44-52页 |
| 4.1 材料与方法 | 第44-48页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第44页 |
| 4.1.1.1 实验用鱼 | 第44页 |
| 4.1.2 实验方法 | 第44-48页 |
| 4.1.2.1 引物设计与合成 | 第44-46页 |
| 4.1.2.2 基因组DNA的提取 | 第46-47页 |
| 4.1.2.3 PCR扩增体系及程序 | 第47页 |
| 4.1.2.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 | 第47页 |
| 4.1.2.5 差异条带的个体验证 | 第47页 |
| 4.1.2.6 差异条带的克隆与测序 | 第47-48页 |
| 4.1.2.6.1 差异条带的回收与纯化 | 第47页 |
| 4.1.2.6.2 回收产物的连接和转化 | 第47-48页 |
| 4.1.2.6.3 重组质粒的鉴定与测序 | 第48页 |
| 4.1.2.7 数据分析 | 第48页 |
| 4.2 结果 | 第48-50页 |
| 4.2.1 基因组DNA提取结果 | 第48页 |
| 4.2.2 差异等位基因片段在个体中的验证 | 第48-49页 |
| 4.2.3 差异条带在雌、雄个体中的扩大验证 | 第49页 |
| 4.2.4 差异等位基因片段的克隆与测序结果 | 第49-50页 |
| 4.3 讨论 | 第50-52页 |
| 小结 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-64页 |
| 硕士期间发表的论文列表 | 第64-65页 |
| 课题资助项目 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
