| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-59页 |
| 1 海洋环境中微生物的多样性 | 第15-24页 |
| ·海洋微生物生境 | 第15-17页 |
| ·海洋微生物的多样性及其分布 | 第17-24页 |
| 2 海洋微生物多样性的研究现状 | 第24-37页 |
| ·微生物培养的传统方法 | 第24-25页 |
| ·非培养技术在海洋微生物研究中的应用 | 第25-29页 |
| ·常见的非培养技术 | 第25-27页 |
| ·单细胞水平上的研究 | 第27-29页 |
| ·微生物不能被培养的原因 | 第29-31页 |
| ·增进微生物可培养性的一些措施 | 第31-37页 |
| ·在原有培养方式上的改进 | 第31-32页 |
| ·一些新颖的培养方法 | 第32-37页 |
| 3 研究开发海洋微生物资源的意义 | 第37-40页 |
| ·海洋微生物酶资源 | 第37-38页 |
| ·海洋生物活性物质 | 第38-39页 |
| ·微生物新种属的重要来源 | 第39-40页 |
| 4 细胞微包埋技术 | 第40-54页 |
| ·细胞微包埋技术简介 | 第40-41页 |
| ·单细胞微包埋技术 | 第41-44页 |
| ·海洋微生物微包埋技术的应用 | 第44-48页 |
| ·海洋微生物生物的培养和多样性分析 | 第44-45页 |
| ·慢速生长菌株的培养和分离 | 第45页 |
| ·代谢产物的生产 | 第45-47页 |
| ·生物传感器 | 第47-48页 |
| ·包埋材料 | 第48-49页 |
| ·细胞包埋的方法 | 第49-54页 |
| ·乳化法（油水乳化，膜乳化） | 第50-51页 |
| ·挤出法 | 第51-52页 |
| ·微流体法 | 第52-54页 |
| 5 海洋细菌的分类与鉴定方法 | 第54-58页 |
| ·经典的形态特征及生理生化鉴定方法 | 第54-55页 |
| ·微生物遗传型的鉴定 | 第55-56页 |
| ·G+C 含的测定 | 第55页 |
| ·DNA-DNA 杂交 | 第55页 |
| ·16S rDNA 序列分析 | 第55-56页 |
| ·其他基因分析 | 第56页 |
| ·细胞化学成分的鉴定 | 第56-57页 |
| ·细胞壁化学组分 | 第56页 |
| ·细胞膜化学组分 | 第56-57页 |
| ·微生物快速鉴定系统 | 第57-58页 |
| ·API 鉴定系统 | 第57页 |
| ·Biolog 系统 | 第57页 |
| ·VITEK 系统 | 第57-58页 |
| 6 本论文研究的目的和意义 | 第58-59页 |
| 第二章 三种适于活细胞包埋的微球制备方法的建立 | 第59-82页 |
| 摘要 | 第59页 |
| 前言 | 第59-60页 |
| 1 实验材料、仪器和方法 | 第60-67页 |
| ·实验材料和设备 | 第60-61页 |
| ·实验方法 | 第61-67页 |
| ·搅拌乳化法实验装置的设计 | 第61页 |
| ·搅拌乳化法的微球制备 | 第61-62页 |
| ·两相共流法实验设备的设计 | 第62-63页 |
| ·两相共流法微球的制备 | 第63-64页 |
| ·膜乳化法实验装置 | 第64-65页 |
| ·膜乳化法微球的制备 | 第65-66页 |
| ·微球稳定性，形态学观察和粒径分布 | 第66-67页 |
| 2 实验结果 | 第67-78页 |
| ·搅拌乳化法制备微球结果 | 第67-71页 |
| ·海藻酸钠微球 | 第67-68页 |
| ·琼脂糖微球 | 第68-69页 |
| ·结冷胶微球 | 第69-71页 |
| ·两相共流法微球制备结果 | 第71-73页 |
| ·海藻酸钠微球 | 第71-72页 |
| ·琼脂糖微球 | 第72-73页 |
| ·结冷胶微球 | 第73页 |
| ·膜乳化法制备微球结果 | 第73-78页 |
| ·海藻酸钠微球 | 第73-74页 |
| ·琼脂糖微球 | 第74-76页 |
| ·结冷胶微球 | 第76-77页 |
| ·乳化膜和不同膜型号对微球粒径的影响 | 第77-78页 |
| 3 讨论 | 第78-80页 |
| ·三种微球制备方法技术特点比较 | 第78-80页 |
| ·三种方法制备微球结果比较 | 第80页 |
| 4 本章小结 | 第80-82页 |
| 第三章 海洋微生物高通量培养和分选方法的建立和应用 | 第82-123页 |
| 摘要 | 第82-83页 |
| 前言 | 第83-85页 |
| 1 实验材料、仪器和方法 | 第85-93页 |
| ·实验仪器 | 第85页 |
| ·培养基和实验菌株 | 第85-86页 |
| ·实验方法 | 第86-93页 |
| ·样品采集和处理 | 第86-87页 |
| ·样品处理及计数 | 第87-88页 |
| ·微生物的包埋 | 第88页 |
| ·模拟原位环境培养 | 第88-89页 |
| ·光学和荧光显微镜观察 | 第89页 |
| ·基于FACS 的流式细胞仪分选 | 第89-90页 |
| ·加富培养和菌种分离纯化 | 第90页 |
| ·平板分离法 | 第90页 |
| ·菌种的保藏和活化 | 第90页 |
| ·16SrDNA 序列分析 | 第90-93页 |
| 2 实验结果 | 第93-114页 |
| ·计数和镜检结果 | 第93-96页 |
| ·流式细胞仪分选 | 第96-98页 |
| ·微球及微克隆信号的确定 | 第96-98页 |
| ·流式细胞仪分选效率检测和样品加富培养后OD 变化 | 第98页 |
| ·极地底泥的海洋微生物多样性 | 第98-102页 |
| ·文昌鱼繁殖区海洋微生物多样性 | 第102-114页 |
| ·高通量培养法分析文昌鱼繁殖区海水样品结果 | 第102-109页 |
| ·平板法分离菌株结果 | 第109-114页 |
| 3 讨论 | 第114-121页 |
| ·高通量培养和分选方法的建立 | 第114-115页 |
| ·平板法和高通量培养法的比较 | 第115-121页 |
| ·文昌鱼繁殖区海水中细菌两种培养结果比较 | 第115-119页 |
| ·泥样分离方法结果比较 | 第119-121页 |
| 4 本章小结 | 第121-123页 |
| 第四章 海洋细菌新种—底泥铁单胞菌（Ferrimonas sediminu sp. nov.）的分类鉴定 | 第123-139页 |
| 摘要 | 第123页 |
| 前言 | 第123-124页 |
| 1 实验材料和仪器 | 第124页 |
| ·实验试剂和培养基 | 第124页 |
| ·实验仪器 | 第124页 |
| 2 实验方法 | 第124-131页 |
| ·实验菌株及来源 | 第124-125页 |
| ·待测菌株JYr13~T | 第124-125页 |
| ·与JYr13~T 亲缘关系最近的标准菌株 | 第125页 |
| ·实验菌株16S rRNA 和gyrB 基因鉴定 | 第125页 |
| ·实验菌株表型特征鉴定 | 第125-127页 |
| ·革兰氏染色 | 第125-126页 |
| ·鞭毛染色 | 第126页 |
| ·运动性观察 | 第126页 |
| ·电镜观察 | 第126-127页 |
| ·实验菌株经典生理生化鉴定 | 第127-130页 |
| ·盐度试验 | 第127页 |
| ·温度试验 | 第127页 |
| ·pH 试验 | 第127页 |
| ·氧化酶试验 | 第127页 |
| ·过氧化氢酶试验 | 第127-128页 |
| ·淀粉酶试验 | 第128页 |
| ·脂酶试验 | 第128页 |
| ·明胶酶试验 | 第128页 |
| ·酪蛋白酶试验 | 第128页 |
| ·脲酶试验 | 第128-129页 |
| ·硝酸盐还原实验 | 第129页 |
| ·H_2S 产生 | 第129页 |
| ·厌氧实验 | 第129页 |
| ·利用氢氧化铁，柠檬酸铁和亚硒酸根作为电子受体实验 | 第129-130页 |
| ·实验菌株API 20NE 快速鉴定系统 | 第130页 |
| ·BIOLOG 鉴定系统 | 第130页 |
| ·脂肪酸含量分析 | 第130-131页 |
| ·G+C 含量测定 | 第131页 |
| 3 实验结果 | 第131-134页 |
| ·JYr13~T 的表型特征 | 第131页 |
| ·JYr13~T 的生理生化特征 | 第131-132页 |
| ·利用氢氧化铁，柠檬酸铁和亚硒酸根作为电子受体实验 | 第132-133页 |
| ·JYr13~T G+C 的mol%含量 | 第133页 |
| ·JYr13~T 脂肪酸和醌含量 | 第133页 |
| ·JYr13~T 165 rRNA 和gyrB 基因测序结果及分析 | 第133-134页 |
| 4 讨论 | 第134-137页 |
| 5 本章小结 | 第137-139页 |
| 全文总结 | 第139-141页 |
| 创新点 | 第141-142页 |
| 展望 | 第142-143页 |
| 参考文献 | 第143-158页 |
| 攻读博士学位期间的学术成果 | 第158页 |
