缩写词 | 第9-11页 |
摘要 | 第11-13页 |
Abstract | 第13-16页 |
第一章 引言 | 第17-25页 |
1 龙眼种质资源概述 | 第17-18页 |
2 分子标记在龙眼上的应用 | 第18-20页 |
3 SSR分子标记技术 | 第20-22页 |
3.1 SSR的定义及原理 | 第20页 |
3.2 SSR分子标记的优缺点 | 第20-21页 |
3.3 SSR分子标记的分类 | 第21页 |
3.4 SSR标记在植物上的应用 | 第21-22页 |
3.4.1 构建植物遗传连锁图谱 | 第21页 |
3.4.2 植物亲缘关系及遗传多样性研究 | 第21-22页 |
3.4.3 植物种质资源的鉴定分析 | 第22页 |
3.4.4 开发SSR标记的途径 | 第22页 |
4 本研究的目的意义及主要内容 | 第22-25页 |
4.1 本研究的目的意义 | 第22-23页 |
4.2 本研究的主要内容 | 第23-25页 |
第二章 龙眼EST-SSR位点分析 | 第25-32页 |
1 材料与方法 | 第25-26页 |
1.1 转录组数据及分析软件 | 第25页 |
1.2 方法 | 第25-26页 |
1.2.1 龙眼转录组数据特征 | 第25页 |
1.2.2 龙眼EST-SSR位点信息检索 | 第25-26页 |
2 结果与分析 | 第26-29页 |
2.1 龙眼EST-SSR位点信息出现频率及总体特征 | 第26页 |
2.2 龙眼EST-SSR位点出现比例及长度特征 | 第26-27页 |
2.3 龙眼EST-SSR位点优势基元出现频率及比例 | 第27-29页 |
3 讨论 | 第29-32页 |
3.1 龙眼EST-SSR位点含量丰富 | 第29-30页 |
3.2 龙眼EST-SSR基元数量与种类丰富 | 第30-32页 |
第三章 EST-SSR引物初筛与体系优化 | 第32-41页 |
1 材料与方法 | 第32-35页 |
1.1 材料 | 第32页 |
1.1.1 植物材料与分析软件 | 第32页 |
1.1.2 药品耗材与仪器设备 | 第32页 |
1.2 方法 | 第32-35页 |
1.2.1 龙眼EST-SSR标记引物设计 | 第33页 |
1.2.2 龙眼总DNA提取及检测 | 第33-34页 |
1.2.3 SSR-PCR反应预扩增及龙眼EST-SSR标记引物初步筛选 | 第34页 |
1.2.4 龙眼SSR-PCR体系优化 | 第34-35页 |
1.2.5 SSR-PCR优化体系验证 | 第35页 |
2 结果与分析 | 第35-39页 |
2.1 龙眼EST-SSR引物初步筛选 | 第35-37页 |
2.2 SSR-PCR体系L_(16)(4~4)正交实验结果分析 | 第37-38页 |
2.3 最优SSR-PCR反应体系的验证分析 | 第38-39页 |
3 讨论 | 第39-41页 |
3.1 龙眼SSR-PCR优化体系稳定可靠 | 第39-40页 |
3.2 龙眼EST-SSR标记引物多态性良好 | 第40-41页 |
第四章 龙眼EST-SSR标记在亲缘关系分析上的应用及其与ISSR的比较分析 | 第41-65页 |
第一节 龙眼EST-SSR在亲缘关系分析上的应用 | 第41-51页 |
1 材料与方法 | 第41-44页 |
1.1 材料 | 第41-42页 |
1.1.1 植物材料与分析软件 | 第42页 |
1.1.2 药品耗材与仪器设备 | 第42页 |
1.2 方法 | 第42-44页 |
1.2.1 龙眼总DNA提取及检测 | 第42页 |
1.2.2 多态性EST-SSR引物开发 | 第42页 |
1.2.3 SSR-PCR体系与扩增程序 | 第42页 |
1.2.4 SSR-PCR产物检测 | 第42-43页 |
1.2.5 数据统计与分析 | 第43-44页 |
2 结果与分析 | 第44-50页 |
2.1 龙眼材料总DNA检测 | 第44页 |
2.2 EST-SSR分子标记扩增结果分析 | 第44-47页 |
2.3 EST-SSR分子标记引物多态性分析 | 第47页 |
2.4 基于EST-SSR标记的聚类分析 | 第47-50页 |
3 讨论 | 第50-51页 |
3.1 龙眼EST-SSR扩增谱带多态性良好 | 第50页 |
3.2 龙眼EST-SSR聚类能揭示品种差异 | 第50-51页 |
第二节 ISSR在龙眼亲缘关系研究上的应用 | 第51-59页 |
1 材料与方法 | 第52-53页 |
1.1 材料 | 第52页 |
1.1.1 植物材料与分析软件 | 第52页 |
1.1.2 药品耗材与仪器设备 | 第52页 |
1.2 方法 | 第52-53页 |
1.2.1 龙眼总DNA提取及检测 | 第52页 |
1.2.2 ISSR引物选择 | 第52-53页 |
1.2.3 ISSR-PCR体系与扩增程序 | 第53页 |
1.2.4 ISSR-PCR产物检测 | 第53页 |
1.2.5 数据统计与分析 | 第53页 |
2 结果与分析 | 第53-59页 |
2.1 龙眼材料总DNA检测 | 第53-54页 |
2.2 ISSR分子标记扩增结果分析 | 第54-56页 |
2.3 ISSR分子标记引物多态性分析 | 第56页 |
2.4 基于ISSR标记的聚类分析 | 第56-59页 |
3 讨论 | 第59页 |
第三节 龙眼EST-SSR与ISSR的比较分析 | 第59-65页 |
1 材料与方法 | 第60页 |
1.1 植物材料与分析软件 | 第60页 |
1.2 方法 | 第60页 |
1.2.1 电泳扩增效果比较 | 第60页 |
1.2.2 聚类结果比较 | 第60页 |
2 结果与分析 | 第60-62页 |
2.1 EST-SSR与ISSR的扩增效果比较分析 | 第60-61页 |
2.2 EST-SSR与ISSR的聚类结果比较分析 | 第61-62页 |
3 讨论 | 第62-65页 |
3.1 龙眼EST-SSR的特异扩增效果优于ISSR | 第62-63页 |
3.2 龙眼EST-SSR可用于龙眼亲缘关系分析 | 第63-65页 |
第五章 小结 | 第65-68页 |
1 龙眼EST-SSR位点含量丰富 | 第65页 |
2 龙眼EST-SSR-PCR体系的优化 | 第65-66页 |
3 龙眼EST-SSR标记具有丰富多态性 | 第66页 |
4 龙眼EST-SSR标记与ISSR标记的比较分析 | 第66-68页 |
参考文献 | 第68-74页 |
附录Ⅰ 95份龙眼供试材料 | 第74-76页 |
附录Ⅱ 95份龙眼供试材料的DNA检测结果 | 第76-77页 |
附录Ⅲ 各EST-SSR标记引物对95份龙眼供试材料的扩增结果 | 第77-83页 |
附录Ⅳ 各ISSR标记引物对95份龙眼供试材料的扩增结果 | 第83-93页 |
致谢 | 第93页 |