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基于龙眼转录组的SSR引物开发与应用研究

缩写词第9-11页
摘要第11-13页
Abstract第13-16页
第一章 引言第17-25页
    1 龙眼种质资源概述第17-18页
    2 分子标记在龙眼上的应用第18-20页
    3 SSR分子标记技术第20-22页
        3.1 SSR的定义及原理第20页
        3.2 SSR分子标记的优缺点第20-21页
        3.3 SSR分子标记的分类第21页
        3.4 SSR标记在植物上的应用第21-22页
            3.4.1 构建植物遗传连锁图谱第21页
            3.4.2 植物亲缘关系及遗传多样性研究第21-22页
            3.4.3 植物种质资源的鉴定分析第22页
            3.4.4 开发SSR标记的途径第22页
    4 本研究的目的意义及主要内容第22-25页
        4.1 本研究的目的意义第22-23页
        4.2 本研究的主要内容第23-25页
第二章 龙眼EST-SSR位点分析第25-32页
    1 材料与方法第25-26页
        1.1 转录组数据及分析软件第25页
        1.2 方法第25-26页
            1.2.1 龙眼转录组数据特征第25页
            1.2.2 龙眼EST-SSR位点信息检索第25-26页
    2 结果与分析第26-29页
        2.1 龙眼EST-SSR位点信息出现频率及总体特征第26页
        2.2 龙眼EST-SSR位点出现比例及长度特征第26-27页
        2.3 龙眼EST-SSR位点优势基元出现频率及比例第27-29页
    3 讨论第29-32页
        3.1 龙眼EST-SSR位点含量丰富第29-30页
        3.2 龙眼EST-SSR基元数量与种类丰富第30-32页
第三章 EST-SSR引物初筛与体系优化第32-41页
    1 材料与方法第32-35页
        1.1 材料第32页
            1.1.1 植物材料与分析软件第32页
            1.1.2 药品耗材与仪器设备第32页
        1.2 方法第32-35页
            1.2.1 龙眼EST-SSR标记引物设计第33页
            1.2.2 龙眼总DNA提取及检测第33-34页
            1.2.3 SSR-PCR反应预扩增及龙眼EST-SSR标记引物初步筛选第34页
            1.2.4 龙眼SSR-PCR体系优化第34-35页
            1.2.5 SSR-PCR优化体系验证第35页
    2 结果与分析第35-39页
        2.1 龙眼EST-SSR引物初步筛选第35-37页
        2.2 SSR-PCR体系L_(16)(4~4)正交实验结果分析第37-38页
        2.3 最优SSR-PCR反应体系的验证分析第38-39页
    3 讨论第39-41页
        3.1 龙眼SSR-PCR优化体系稳定可靠第39-40页
        3.2 龙眼EST-SSR标记引物多态性良好第40-41页
第四章 龙眼EST-SSR标记在亲缘关系分析上的应用及其与ISSR的比较分析第41-65页
    第一节 龙眼EST-SSR在亲缘关系分析上的应用第41-51页
        1 材料与方法第41-44页
            1.1 材料第41-42页
                1.1.1 植物材料与分析软件第42页
                1.1.2 药品耗材与仪器设备第42页
            1.2 方法第42-44页
                1.2.1 龙眼总DNA提取及检测第42页
                1.2.2 多态性EST-SSR引物开发第42页
                1.2.3 SSR-PCR体系与扩增程序第42页
                1.2.4 SSR-PCR产物检测第42-43页
                1.2.5 数据统计与分析第43-44页
        2 结果与分析第44-50页
            2.1 龙眼材料总DNA检测第44页
            2.2 EST-SSR分子标记扩增结果分析第44-47页
            2.3 EST-SSR分子标记引物多态性分析第47页
            2.4 基于EST-SSR标记的聚类分析第47-50页
        3 讨论第50-51页
            3.1 龙眼EST-SSR扩增谱带多态性良好第50页
            3.2 龙眼EST-SSR聚类能揭示品种差异第50-51页
    第二节 ISSR在龙眼亲缘关系研究上的应用第51-59页
        1 材料与方法第52-53页
            1.1 材料第52页
                1.1.1 植物材料与分析软件第52页
                1.1.2 药品耗材与仪器设备第52页
            1.2 方法第52-53页
                1.2.1 龙眼总DNA提取及检测第52页
                1.2.2 ISSR引物选择第52-53页
                1.2.3 ISSR-PCR体系与扩增程序第53页
                1.2.4 ISSR-PCR产物检测第53页
                1.2.5 数据统计与分析第53页
        2 结果与分析第53-59页
            2.1 龙眼材料总DNA检测第53-54页
            2.2 ISSR分子标记扩增结果分析第54-56页
            2.3 ISSR分子标记引物多态性分析第56页
            2.4 基于ISSR标记的聚类分析第56-59页
        3 讨论第59页
    第三节 龙眼EST-SSR与ISSR的比较分析第59-65页
        1 材料与方法第60页
            1.1 植物材料与分析软件第60页
            1.2 方法第60页
                1.2.1 电泳扩增效果比较第60页
                1.2.2 聚类结果比较第60页
        2 结果与分析第60-62页
            2.1 EST-SSR与ISSR的扩增效果比较分析第60-61页
            2.2 EST-SSR与ISSR的聚类结果比较分析第61-62页
        3 讨论第62-65页
            3.1 龙眼EST-SSR的特异扩增效果优于ISSR第62-63页
            3.2 龙眼EST-SSR可用于龙眼亲缘关系分析第63-65页
第五章 小结第65-68页
    1 龙眼EST-SSR位点含量丰富第65页
    2 龙眼EST-SSR-PCR体系的优化第65-66页
    3 龙眼EST-SSR标记具有丰富多态性第66页
    4 龙眼EST-SSR标记与ISSR标记的比较分析第66-68页
参考文献第68-74页
附录Ⅰ 95份龙眼供试材料第74-76页
附录Ⅱ 95份龙眼供试材料的DNA检测结果第76-77页
附录Ⅲ 各EST-SSR标记引物对95份龙眼供试材料的扩增结果第77-83页
附录Ⅳ 各ISSR标记引物对95份龙眼供试材料的扩增结果第83-93页
致谢第93页

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