| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第14-44页 |
| 1.1 鱼类性别的多样性和复杂性 | 第14-16页 |
| 1.1.1 遗传因子在鱼类性别决定中的作用 | 第14-15页 |
| 1.1.2 环境因子在鱼类性别决定中的作用 | 第15-16页 |
| 1.2 鱼类的性腺分化 | 第16-17页 |
| 1.3 性别相关基因及调控通路 | 第17-31页 |
| 1.3.1 性别相关基因的筛选 | 第17-20页 |
| 1.3.2 性别决定基因 | 第20-22页 |
| 1.3.3 性腺分化相关基因 | 第22-28页 |
| 1.3.4 鱼类性腺分化相关的信号通路 | 第28-30页 |
| 1.3.5 鱼类性腺分化相关基因的相互调控关系 | 第30-31页 |
| 1.4 外源因子对鱼类性腺分化影响的分子生物学研究进展 | 第31-34页 |
| 1.4.1 外源性激素对鱼类性腺分化影响的分子机制研究 | 第31-32页 |
| 1.4.2 温度对鱼类性腺分化影响的分子机制研究 | 第32-34页 |
| 1.5 表观遗传修饰在鱼类性腺分化中作用的研究进展 | 第34-40页 |
| 1.5.1 表观遗传修饰 | 第34-36页 |
| 1.5.2 DNA甲基化作用于性腺分化的研究进展 | 第36-37页 |
| 1.5.3 组蛋白修饰在性腺分化中作用的研究 | 第37-38页 |
| 1.5.4 非编码RNA在性腺分化中作用的研究 | 第38-40页 |
| 1.6 牙鲆性别及性腺分化分子生物学及表观遗传学相关研究进展 | 第40-42页 |
| 1.7 研究目的和意义 | 第42-44页 |
| 第二章 牙鲆性腺转录组特征和性别差异表达基因筛选 | 第44-63页 |
| 2.1 前言 | 第44-45页 |
| 2.2 材料和方法 | 第45-48页 |
| 2.2.1 实验用鱼 | 第45页 |
| 2.2.2 实验仪器和试剂 | 第45-46页 |
| 2.2.3 性腺发育时期组织学鉴定 | 第46页 |
| 2.2.4 RNA提取和cDNA文库构建 | 第46-47页 |
| 2.2.5 测序、功能注释和生物信息学分析 | 第47页 |
| 2.2.6 差异表达基因筛选和富集分析以及性别相关基因挖掘 | 第47-48页 |
| 2.3 实验结果 | 第48-59页 |
| 2.3.1 转录组数据组装、注释和生物信息学分析 | 第48-52页 |
| 2.3.2 两性差异表达基因筛选 | 第52-55页 |
| 2.3.3 差异表达基因参与的KEGG通路分析 | 第55-59页 |
| 2.4 讨论 | 第59-63页 |
| 2.4.1 两性差异表达基因 | 第59-61页 |
| 2.4.2 性类固醇激素及其合成途径 | 第61-63页 |
| 第三章 cyp19a及其转录因子在牙鲆性腺分化时期的表达特征及其在启动子区DNA甲基化分析 | 第63-87页 |
| 3.1 前言 | 第63-64页 |
| 3.2 材料和方法 | 第64-75页 |
| 3.2.1 实验用鱼 | 第64-65页 |
| 3.2.2 实验仪器和试剂 | 第65页 |
| 3.2.3 高温和雌二醇诱导实验 | 第65-66页 |
| 3.2.4 样品采集和性腺组织学分析 | 第66页 |
| 3.2.5 性类固醇激素水平检测 | 第66-67页 |
| 3.2.6 RNA提取和第一链cDNA合成 | 第67-68页 |
| 3.2.7 荧光定量RT-PCR（qPCR） | 第68-69页 |
| 3.2.8 性腺DNA提取 | 第69-70页 |
| 3.2.9 基因启动子区的扩增和分析 | 第70-71页 |
| 3.2.10 性腺总体DNA甲基化水平和相关基因启动子区CpG岛DNA甲基化水平检测 | 第71-75页 |
| 3.2.11 数据分析 | 第75页 |
| 3.3 实验结果 | 第75-83页 |
| 3.3.1 cyp19a及其转录因子在牙鲆性腺分化过程中的表达特征 | 第76-78页 |
| 3.3.2 DNA甲基化水平在牙鲆性腺分化过程中的变化 | 第78-82页 |
| 3.3.3 性类固醇激素水平在牙鲆性腺分化过程中的变化 | 第82-83页 |
| 3.4 讨论 | 第83-87页 |
| 3.4.1 cyp19a及其转录因子与性激素水平在牙鲆性腺分化过程中动态变化的比较分析 | 第83-85页 |
| 3.4.2 高温和外源雌二醇诱导产生的基因启动区DNA甲基化变化 | 第85-87页 |
| 第四章 转录因子和表观修饰对cyp19a表达的调控作用 | 第87-109页 |
| 4.1 前言 | 第87-88页 |
| 4.2 材料和方法 | 第88-101页 |
| 4.2.1 实验用鱼 | 第88页 |
| 4.2.2 实验用细胞 | 第88页 |
| 4.2.3 实验仪器和试剂 | 第88-89页 |
| 4.2.4 原位杂交 | 第89-92页 |
| 4.2.5 免疫组化 | 第92页 |
| 4.2.6 凝胶阻滞实验（EMSA） | 第92-96页 |
| 4.2.7 cyp19a启动子活性检测 | 第96-100页 |
| 4.2.8 牙鲆精巢支持细胞系中cyp19a活性检测 | 第100页 |
| 4.2.9 数据分析 | 第100-101页 |
| 4.3 实验结果 | 第101-106页 |
| 4.3.1 转录因子foxl2、nr5a2、nr0b1在牙鲆性腺组织中的定位 | 第101-103页 |
| 4.3.2 转录因子foxl2、nr5a2和nr0b1对cyp19a的调控作用 | 第103-105页 |
| 4.3.3 甲基化表观修饰对cyp19a启动子调控作用 | 第105-106页 |
| 4.4 讨论 | 第106-109页 |
| 4.4.1 转录因子对cyp19a表达调控的作用 | 第106-107页 |
| 4.4.2 启动子区甲基化对cyp19a表达调控的作用 | 第107-109页 |
| 结论 | 第109-111页 |
| 展望 | 第111-112页 |
| 参考文献 | 第112-135页 |
| 致谢 | 第135-136页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第136-137页 |
