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基于RNA-Seq的雅致放射毛霉羧肽酶研究及其基因AecpY在毕赤酵母中的表达和特性研究

摘要第5-6页
Abstract第6页
缩略词第10-11页
第一章 绪论第11-21页
    1.1 雅致放射毛霉的概况第11-13页
        1.1.1 雅致放射毛霉的简介第11页
        1.1.2 雅致放射毛霉的产酶特征第11-12页
        1.1.3 雅致放射毛霉的应用第12页
        1.1.4 雅致放射毛霉的研究进展第12-13页
    1.2 羧肽酶总述第13-19页
        1.2.1 羧肽酶的概况第13-16页
        1.2.2 丝氨酸羧肽酶的概况第16-18页
        1.2.3 羧肽酶的研究进展第18-19页
    1.3 本论文立题依据及研究内容第19-21页
        1.3.1 立题依据第19页
        1.3.2 研究内容第19-21页
第二章 雅致放射毛霉转录组羧肽酶数据分析第21-30页
    2.1 材料和主要试剂第21-22页
        2.1.1 研究菌株第21页
        2.1.2 分析的数据来源第21-22页
        2.1.3 主要的软件和数据库第22页
    2.2 RNA-Seq测序数据及分析方法第22-25页
        2.2.1 雅致放射毛霉的RNA-Seq测序第22页
        2.2.2 羧肽酶序列的上传第22页
        2.2.3 羧肽酶信号肽的分析第22-23页
        2.2.4 开放阅读框(ORF)的分析第23-24页
        2.2.5 羧肽酶所属家族分析第24页
        2.2.6 构建羧肽酶系统进化树第24-25页
    2.3 结果与讨论第25-29页
        2.3.1 雅致放射毛霉的RNA-Seq测序结果第25-26页
        2.3.2 羧肽酶信号肽分析结果第26页
        2.3.3 开放阅读框(ORF)分析第26-27页
        2.3.4 羧肽酶所属家族分析第27-28页
        2.3.5 羧肽酶系统进化树分析第28-29页
    2.4 本章小结第29-30页
第三章 雅致放射毛霉羧肽酶基因AecpY的克隆及其在毕赤酵母中的表达第30-51页
    3.1 实验材料第31-33页
        3.1.1 供试菌株和质粒第31页
        3.1.2 主要试剂第31页
        3.1.3 主要仪器第31-32页
        3.1.4 培养基和溶液配制第32页
        3.1.5 引物设计与合成第32-33页
    3.2 实验方法第33-46页
        3.2.1 雅致放射毛霉菌株的培养第33页
        3.2.2 雅致放射毛霉菌丝体总RNA的提取第33-35页
        3.2.3 反转录cDNA第一链的合成第35-36页
        3.2.4 雅致放射毛霉羧肽酶全长编码基因的克隆第36-41页
        3.2.5 雅致放射毛霉羧肽酶基因转化毕赤酵母第41-45页
        3.2.7 重组羧肽酶在毕赤酵母中的诱导表达第45-46页
    3.3 实验结果与分析第46-50页
        3.3.1 雅致放射毛霉菌株的培养情况第46页
        3.3.2 雅致放射毛霉总RNA的提取结果第46-47页
        3.3.3 雅致放射毛霉羧肽酶基因AecpY的克隆结果第47-48页
        3.3.4 阳性重组羧肽酶基因的筛选结果第48-49页
        3.3.5 重组羧肽酶在毕赤酵母中的诱导表达结果第49-50页
    3.4 本章小结第50-51页
第四章 雅致放射毛霉粗酶液和羧肽酶的酶学性质研究第51-66页
    4.1 实验材料第51-52页
        4.1.1 主要试剂和材料第51页
        4.1.2 主要仪器第51-52页
    4.2 实验方法第52-57页
        4.2.1 酶液的分离纯化第52-53页
        4.2.2 酶液的脱盐第53-54页
        4.2.3 BCA法测定蛋白浓度第54-55页
        4.2.4 雅致放射毛霉羧肽酶酶学性质的测定第55-57页
        4.2.5 雅致放射毛霉粗酶液的酶活测定第57页
    4.3 实验结果与分析第57-64页
        4.3.1 酶液分离纯化结果第57-58页
        4.3.2 酶液脱盐的结果第58页
        4.3.3 BCA法测定蛋白浓度结果第58页
        4.3.4 羧肽酶基因酶活性质的测定结果第58-62页
        4.3.5 粗酶液酶活性质的测定结果第62-64页
    4.4 本章小结第64-66页
结论和展望第66-69页
参考文献第69-71页
附录第71-73页
攻读博士/硕士学位期间取得的研究成果第73-74页
致谢第74-75页
附件第75页

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