450K甲基化芯片数据的扩展算法设计与实现
摘要 | 第5-6页 |
abstract | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-22页 |
1.1 课题背景及研究意义 | 第10-16页 |
1.1.1 表观遗传学 | 第10-11页 |
1.1.2 DNA甲基化 | 第11-13页 |
1.1.3 CpG位点 | 第13-15页 |
1.1.4 课题意义 | 第15-16页 |
1.2 DNA甲基化研究国内外研究现状 | 第16-20页 |
1.2.1 DNA甲基化的检测方法研究现状 | 第16-17页 |
1.2.2 DNA甲基化的相关数据库研究现状 | 第17-18页 |
1.2.3 DNA甲基化水平的预测研究现状 | 第18-20页 |
1.3 本文研究的具体工作和内容 | 第20-21页 |
1.4 章节安排 | 第21-22页 |
第二章 450K甲基化数据的扩展研究 | 第22-40页 |
2.1 研究概述 | 第23-24页 |
2.2 实验数据描述 | 第24-25页 |
2.3 特征提取研究 | 第25-29页 |
2.4 预测模型研究 | 第29-32页 |
2.4.1 Logistic回归模型 | 第29-31页 |
2.4.2 损失函数分析 | 第31-32页 |
2.5 预测及扩展结果分析 | 第32-38页 |
2.5.1 性能指标 | 第32-35页 |
2.5.2 预测结果分析 | 第35-37页 |
2.5.3 扩展结果分析 | 第37-38页 |
2.6 本章小结 | 第38-40页 |
第三章 450K甲基化数据在线扩展平台 | 第40-54页 |
3.1 在线平台相关技术 | 第40-43页 |
3.2 在线平台的功能设计 | 第43-47页 |
3.3 在线平台的界面展示 | 第47-50页 |
3.4 在线平台的性能分析 | 第50-53页 |
3.5 本章小结 | 第53-54页 |
第四章 克罗恩病的DNA甲基化研究 | 第54-65页 |
4.1 研究概述 | 第54-55页 |
4.2 在线平台在克罗恩病甲基化研究中的应用 | 第55-59页 |
4.3 克罗恩病相关基因及通路分析 | 第59-63页 |
4.4 本章小结 | 第63-65页 |
第五章 总结与展望 | 第65-67页 |
致谢 | 第67-68页 |
参考文献 | 第68-73页 |
攻读硕士学位期间研究成果 | 第73-74页 |