| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-23页 |
| ·鲤鱼全基因组研究的重要性 | 第11-12页 |
| ·鲤鱼在我国水产养殖中不可替代的地位 | 第11页 |
| ·鲤鱼全基因组研究对其他鲤科鱼类基因组研究的参考作用 | 第11页 |
| ·开展鲤鱼全基因组研究有助于提高我国水产业的国际影响力和竞争力 | 第11页 |
| ·鲤鱼全基因组研究现状及开展鲤鱼全基因组计划的紧迫性 | 第11-12页 |
| ·BAC 文库的鉴定及其在基因组学中的应用 | 第12-18页 |
| ·细菌人工染色体 | 第12-13页 |
| ·BAC 文库的鉴定 | 第13-14页 |
| ·BAC 文库在基因组中的应用 | 第14-18页 |
| ·BAC 双末端测序功能及分析方法 | 第18-23页 |
| ·BAC 双末端测序的功能 | 第18页 |
| ·BAC 双末端序列分析方法 | 第18-23页 |
| 第二章 鲤鱼BAC 文库的鉴定以及BAC 双末端测序 | 第23-40页 |
| ·材料 | 第23-25页 |
| ·实验样品 | 第23页 |
| ·主要试剂及配方 | 第23-24页 |
| ·主要仪器设备及耗材 | 第24-25页 |
| ·试验方法 | 第25-32页 |
| ·BAC 文库的构建 | 第25-26页 |
| ·BAC 克隆插入片段大小检测 | 第26页 |
| ·鲤鱼BAC 三维混合池的构建 | 第26-29页 |
| ·鲤鱼重要功能基因和微卫星标记的筛选 | 第29-30页 |
| ·高通量提取鲤鱼BAC 质粒DNA | 第30-32页 |
| ·鲤鱼BAC 双末端测序 | 第32页 |
| ·BAC 双末端测序质量控制 | 第32页 |
| ·结果与讨论 | 第32-40页 |
| ·BAC 文库特征描述及插入片段评估 | 第32-34页 |
| ·三维PCR 法筛选重要功能基因及遗传标记 | 第34-37页 |
| ·鲤鱼BAC 双末端测序 | 第37-39页 |
| ·BAC 双末端测序质量控制 | 第39-40页 |
| 第三章 生物信息学分析 | 第40-52页 |
| ·软件及方法 | 第40-42页 |
| ·序列基本处理 | 第40页 |
| ·重复序列分析 | 第40-41页 |
| ·微卫星的查找 | 第41页 |
| ·基因预测 | 第41-42页 |
| ·比较基因组分析 | 第42页 |
| ·结果与讨论 | 第42-52页 |
| ·BAC 双末端序列的产生 | 第42-44页 |
| ·鲤鱼基因组重复序列评估 | 第44-47页 |
| ·BES 中微卫星标记的查找 | 第47页 |
| ·编码序列查找与功能注释 | 第47-48页 |
| ·鲤鱼与斑马鱼比较基因组分析 | 第48-52页 |
| 第四章 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 硕士在读期间撰写与发表的论文 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59页 |
