| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| Résumé | 第9-13页 |
| Chapter Ⅰ Introduction and outline of the thesis | 第13-61页 |
| 1. The genus Aspergillus | 第16-26页 |
| ·Ecology | 第16页 |
| ·Reproduction and morphological features | 第16-18页 |
| ·Identification of Aspergillus species | 第18-19页 |
| ·Aspergillus fumigatus | 第19-22页 |
| ·Aspergillus flavus | 第22-25页 |
| ·Production of mycotoxins | 第25-26页 |
| 2. Molecular typing of Aspergillus species | 第26-34页 |
| ·Random amplified polymorphic DNA(RAPD) | 第27页 |
| ·Restriction fragment length polymorphism(RFLP)and related methods | 第27-29页 |
| ·Multilocus sequence typing(MLST) | 第29-30页 |
| ·Microsatellite length polymorphism(MLP) | 第30-32页 |
| ·Multiple locus VNTR analysis(MLVA) | 第32-34页 |
| 3. Aspergillosis | 第34-45页 |
| ·Virulence factors | 第34-36页 |
| ·Immunity and host susceptibility | 第36-39页 |
| ·Human aspergillosis | 第39-41页 |
| ·Avian aspergillosis | 第41-43页 |
| ·Treatment of fungal infections and emergence of azote resistance in Aspergillusfumigatus | 第43-45页 |
| 4. Importance of poultry in China and Guangxi | 第45-60页 |
| ·Geographical context | 第45-49页 |
| ·Chinese market of animal products | 第49-52页 |
| ·Focus on poultry products market in China | 第52-54页 |
| ·Poultry genetic resources in China | 第54-58页 |
| ·Poultry systems in China | 第58-60页 |
| 5. Outline of the thesis | 第60-61页 |
| Chapter Ⅱ Fungal contamination in avian farms in Guangxi,China | 第61-78页 |
| 1. Introduction | 第62页 |
| 2. Material and methods | 第62-68页 |
| ·Avian farms | 第62-65页 |
| ·Sampling and fungal isolation | 第65-66页 |
| ·Identification of Fungal | 第66-68页 |
| ·Statistical analyses | 第68页 |
| 3. Results | 第68-74页 |
| 4. Discussion | 第74-77页 |
| 5. Conclusion | 第77-78页 |
| Chapter Ⅲ Development and use of VNTR based methods for typing Aspergillus spp | 第78-96页 |
| 1. Introduction | 第79-80页 |
| 2. Materials and methods | 第80-86页 |
| ·Origin of fungal isolates | 第80-83页 |
| ·DNA isolation | 第83页 |
| ·Selection of VNTR markers for A.flavus | 第83-84页 |
| ·VNTR markers for A.fumigatus | 第84页 |
| ·Specificity | 第84-85页 |
| ·Stability and reproducibility | 第85页 |
| ·Discriminatory power | 第85页 |
| ·Clustering analysis for A.flavus and A.fumigatus isolates | 第85-86页 |
| 3. Results | 第86-93页 |
| ·Development of the MLVA method for A. flavus | 第86-89页 |
| ·Genetic diversity of A. flavus isolates | 第89-91页 |
| ·Genetic diversity of A. fumigatus isolates | 第91-93页 |
| 4. Discussion | 第93-95页 |
| 5. Conclusion | 第95-96页 |
| Chapter IV Susceptibility to itraconazole in Aspergillusisolated from avian farms in France and China | 第96-113页 |
| 1. Introduction | 第97-101页 |
| 2. Materials and methods | 第101-103页 |
| ·Origin of fungal isolates | 第101页 |
| ·Antifungal susceptibility testing | 第101-102页 |
| ·Sequencing of Cyp21A | 第102页 |
| ·MLVA typing | 第102-103页 |
| 3. Results | 第103-108页 |
| ·Susceptibility to itraconazole | 第103-104页 |
| ·Mutations of Cyp51A and corresponding protein | 第104-106页 |
| ·MLVA typing | 第106-108页 |
| 4. Discussion | 第108-112页 |
| 5. Conclusion | 第112-113页 |
| General discussion and perspectives | 第113-120页 |
| References | 第120-139页 |
| Acknowledgements | 第139-141页 |
| 致谢 | 第141-142页 |
| Appendix | 第142-148页 |
| List of abbreviations | 第142-143页 |
| Glossary | 第143-148页 |
| Communications | 第148-150页 |
| Published Papers | 第150-151页 |
