| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-21页 |
| ·选题的意义 | 第10页 |
| ·文献综述 | 第10-19页 |
| ·ATP合成酶分子马达结构 | 第11-12页 |
| ·ATP合成酶分子马达的转动现象 | 第12-15页 |
| ·ATP合成酶分子马达的做功原理 | 第15-19页 |
| ·ATP合成酶分子马达的储能方式 | 第19页 |
| ·本文工作 | 第19-21页 |
| 第2章 分子动力学模拟原理 | 第21-32页 |
| ·引言 | 第21页 |
| ·分子动力学模拟的原理 | 第21-23页 |
| ·分子力场简述 | 第23-27页 |
| ·分子力场的发展 | 第23-24页 |
| ·力场中的分子体系势能表达 | 第24-27页 |
| ·牛顿运动学方程的数值解法 | 第27-30页 |
| ·Verlet法 | 第28页 |
| ·Verlet蛙跳法 | 第28-29页 |
| ·速度Verlet法 | 第29-30页 |
| ·分子动力学模拟软件 | 第30-31页 |
| ·本章小结 | 第31-32页 |
| 第3章 能量平衡模拟 | 第32-46页 |
| ·引言 | 第32页 |
| ·模拟过程与结果 | 第32-41页 |
| ·模拟所需文件 | 第32-34页 |
| ·模拟过程 | 第34-36页 |
| ·模拟结果分析 | 第36-41页 |
| ·结果验证 | 第41-45页 |
| ·麦克斯韦-波尔兹曼(Maxwell-Botltzmann)能量分布 | 第42-44页 |
| ·温度分布 | 第44-45页 |
| ·本章小结 | 第45-46页 |
| 第4章 ATP合成酶γ亚基α-螺旋的拉伸模拟实验 | 第46-52页 |
| ·引言 | 第46页 |
| ·恒速拉伸模拟实验 | 第46-51页 |
| ·恒速拉伸模拟原理 | 第46-47页 |
| ·模拟参数的设定 | 第47-49页 |
| ·拉伸模拟结果分析 | 第49-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第5章 基于γ亚基扭转拉伸形变的ATP合成酶分子马达的储能模型 | 第52-62页 |
| ·引言 | 第52页 |
| ·现有储能模型分析 | 第52-55页 |
| ·Neukirch等提出的储能模型 | 第52-54页 |
| ·武江勇等提出的氢键能储能模型 | 第54-55页 |
| ·基于γ亚基中α-双螺旋的扭转拉伸形变的储能模型研究 | 第55-61页 |
| ·γ亚基α-双螺旋储能模型的建立 | 第56-58页 |
| ·ATP合成酶分子马达γ亚基储能计算 | 第58-61页 |
| ·本章小结 | 第61-62页 |
| 总结与展望 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-69页 |
| 攻读硕士期间发表论文情况 | 第69页 |
