鸡双向选择家系肠道微生物宏基因组学研究
摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-13页 |
1 引言 | 第13-27页 |
·动物属于“超级生物” | 第13-15页 |
·肠道微生物菌群 | 第13页 |
·肠道微生物功能 | 第13-15页 |
·肠道微生物宏基因组学 | 第15-19页 |
·概述 | 第15-16页 |
·宏基因组学研究技术 | 第16-19页 |
·荧光原位杂交技术 | 第16-17页 |
·末端限制性片段长度多态性技术 | 第17页 |
·变性/温度梯度凝胶电泳技术 | 第17-18页 |
·高通量测序技术 | 第18-19页 |
·肠道宏基因组学研究 | 第19-25页 |
·人类肠道宏基因组学研究进展 | 第19-23页 |
·动物肠道宏基因组学研究进展 | 第23-24页 |
·存在问题 | 第24-25页 |
·研究目的与意义 | 第25-27页 |
2 材料方法 | 第27-41页 |
·材料 | 第27-29页 |
·实验动物 | 第27-29页 |
·样品采集 | 第29页 |
·试剂与仪器 | 第29-31页 |
·试剂药品 | 第29-30页 |
·仪器设备 | 第30-31页 |
·实验方法 | 第31-39页 |
·粪便样品 DNA 提取与检测 | 第31-33页 |
·16s DNA V4 区 PCR 扩增 | 第33-34页 |
·PCR 扩增产物的琼脂糖凝胶回收纯化 | 第34-36页 |
·构建上机文库并测序 | 第36-37页 |
·实时荧光定量 PCR | 第37-39页 |
·统计分析 | 第39-41页 |
·数据处理 | 第39页 |
·生物分类和统计分析 | 第39-41页 |
3 结果分析 | 第41-62页 |
·测序基本数据分析 | 第41-43页 |
·双向选择家系肠道微生物比较 | 第43-45页 |
·宿主基因型与肠道微生物组成 | 第45-50页 |
·HW 和 LW 两个家系肠道微生物比较 | 第45-47页 |
·同性别 HW 和 LW 家系肠道微生物比较 | 第47-50页 |
·宿主性别与肠道微生物组成 | 第50-56页 |
·乳酸菌与差异菌群 | 第56-62页 |
·乳酸菌是主要差异菌种 | 第56-57页 |
·实时荧光定量 PCR 的验证 | 第57-62页 |
4 讨论 | 第62-66页 |
5 结论 | 第66-67页 |
参考文献 | 第67-90页 |
附录一 | 第90-96页 |
附录二 | 第96-99页 |
致谢 | 第99-100页 |
攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第100-101页 |