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鸡双向选择家系肠道微生物宏基因组学研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-13页
1 引言第13-27页
   ·动物属于“超级生物”第13-15页
     ·肠道微生物菌群第13页
     ·肠道微生物功能第13-15页
   ·肠道微生物宏基因组学第15-19页
     ·概述第15-16页
     ·宏基因组学研究技术第16-19页
       ·荧光原位杂交技术第16-17页
       ·末端限制性片段长度多态性技术第17页
       ·变性/温度梯度凝胶电泳技术第17-18页
       ·高通量测序技术第18-19页
   ·肠道宏基因组学研究第19-25页
     ·人类肠道宏基因组学研究进展第19-23页
     ·动物肠道宏基因组学研究进展第23-24页
     ·存在问题第24-25页
   ·研究目的与意义第25-27页
2 材料方法第27-41页
   ·材料第27-29页
     ·实验动物第27-29页
     ·样品采集第29页
   ·试剂与仪器第29-31页
     ·试剂药品第29-30页
     ·仪器设备第30-31页
   ·实验方法第31-39页
     ·粪便样品 DNA 提取与检测第31-33页
     ·16s DNA V4 区 PCR 扩增第33-34页
     ·PCR 扩增产物的琼脂糖凝胶回收纯化第34-36页
     ·构建上机文库并测序第36-37页
     ·实时荧光定量 PCR第37-39页
   ·统计分析第39-41页
     ·数据处理第39页
     ·生物分类和统计分析第39-41页
3 结果分析第41-62页
   ·测序基本数据分析第41-43页
   ·双向选择家系肠道微生物比较第43-45页
   ·宿主基因型与肠道微生物组成第45-50页
     ·HW 和 LW 两个家系肠道微生物比较第45-47页
     ·同性别 HW 和 LW 家系肠道微生物比较第47-50页
   ·宿主性别与肠道微生物组成第50-56页
   ·乳酸菌与差异菌群第56-62页
     ·乳酸菌是主要差异菌种第56-57页
     ·实时荧光定量 PCR 的验证第57-62页
4 讨论第62-66页
5 结论第66-67页
参考文献第67-90页
附录一第90-96页
附录二第96-99页
致谢第99-100页
攻读硕士学位期间已发表或录用的论文第100-101页

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