| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-16页 |
| 资源家系测定性状的英文缩写 | 第16-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-35页 |
| 1 引言 | 第17页 |
| 2 猪重要经济性状基因的位置候选克隆 | 第17-25页 |
| ·位置候选克隆策略 | 第18-19页 |
| ·猪生产性状QTL定位研究进展 | 第19-23页 |
| ·位置候选基因的研究进展 | 第23-25页 |
| 3 新候选基因的筛选 | 第25-27页 |
| 4 五个候选基因的研究现状 | 第27-30页 |
| ·碳酸酐酶3(Carbonic anhydrase Ⅲ,CA3)基因 | 第27-28页 |
| ·肝脏丙酮酸激酶(Pyruvate kinase,liver and red blood cell,PKLR)基因 | 第28页 |
| ·糖原脱支酶(Glycogen debranching enzyme,AGL)基因 | 第28-29页 |
| ·肌肉特异性烯醇化酶(Muscle-specific enolase,ENO3)基因 | 第29页 |
| ·肝细胞核因子3B(Hepatic nuclear factor-3-beta,HNF3B/FOXA2)基因 | 第29-30页 |
| 5 mRNA选择性剪接 | 第30-31页 |
| 6 基因启动子研究 | 第31-33页 |
| ·启动子克隆方法 | 第32-33页 |
| ·启动子研究方法 | 第33页 |
| 7 本研究的目的与意义 | 第33-35页 |
| 第二章 材料与方法 | 第35-54页 |
| 1 试验材料 | 第35-38页 |
| ·试验样品 | 第35-36页 |
| ·主要仪器和设备 | 第36页 |
| ·主要药品和试剂 | 第36页 |
| ·常用试剂的配制 | 第36-38页 |
| ·生物信息学分析及相应软件 | 第38页 |
| 2 试验方法 | 第38-54页 |
| ·总RNA的提取 | 第38-39页 |
| ·猪基因组DNA的提取 | 第39-40页 |
| ·猪候选基因cDNA序列的克隆、测序及序列分析 | 第40-44页 |
| ·猪候选基因基因组序列的克隆、测序 | 第44-45页 |
| ·猪候选基因微卫星多态位点的基因型分析 | 第45-46页 |
| ·猪候选基因部分SNP位点的PCR-RFLP检测 | 第46-47页 |
| ·统计分析 | 第47页 |
| ·RT-PCR方法进行基因的组织表达谱分析 | 第47-48页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第48页 |
| ·基因启动子的克隆及特征分析 | 第48-54页 |
| 第三章 结果与分析 | 第54-114页 |
| 1 总RNA的提取 | 第54页 |
| 2 猪CA3基因的分离、鉴定及表达特征分析 | 第54-70页 |
| ·猪CA3基因cDNA序列的克隆及序列分析 | 第54-56页 |
| ·猪CA3基因基因组序列的克隆及序列分析 | 第56-57页 |
| ·猪CA3基因的多态性及性状关联分析 | 第57-69页 |
| ·猪CA3基因的表达特征分析 | 第69-70页 |
| 3 猪PKLR基因的克隆、序列分析及多态性检测 | 第70-78页 |
| ·猪PKLR基因基因组序列的克隆及序列分析 | 第70-71页 |
| ·猪PKLR基因的多态性及性状关联分析 | 第71-78页 |
| 4 猪AGL基因的分离、鉴定及启动子克隆 | 第78-88页 |
| ·猪AGL基因cDNA序列的克隆 | 第78页 |
| ·猪AGL基因启动子的克隆及序列分析 | 第78-81页 |
| ·猪AGL基因其它转录本的鉴定及cDNA全长序列的生物信息学分析 | 第81-88页 |
| ·猪AGL基因多态性检测 | 第88页 |
| 5 猪ENO3基因的分离、鉴定及表达调控分析 | 第88-107页 |
| ·猪ENO3基因cDNA序列的克隆及序列分析 | 第88-92页 |
| ·猪ENO3基因基因组序列的克隆及序列分析 | 第92-94页 |
| ·猪ENO3基因的多态性及性状关联分析 | 第94-100页 |
| ·猪ENO3基因的表达特征分析 | 第100-103页 |
| ·猪ENO3基因启动子克隆及功能分析 | 第103-107页 |
| 6 猪FOXA2基因的分离、鉴定 | 第107-114页 |
| ·猪FOXA2基因cDNA序列的克隆及序列分析 | 第107-110页 |
| ·猪FOXA2基因基因组序列的克隆及序列分析 | 第110-111页 |
| ·猪FOXA2基因的多态性检测 | 第111-113页 |
| ·猪FOXA2基因的组织表达谱分析 | 第113-114页 |
| 第四章 讨论 | 第114-127页 |
| 1 关于候选基因的筛选 | 第114-115页 |
| 2 猪与人、鼠间基因序列及结构的保守性 | 第115页 |
| 3 基因的选择性剪接现象 | 第115-116页 |
| 4 不同猪种间基因序列的多态性研究 | 第116-117页 |
| 5 分子标记在不同猪种间的基因频率分布 | 第117-118页 |
| 6 分子标记的遗传效应分析 | 第118-120页 |
| ·CA3基因多态位点的遗传效应分析 | 第118-119页 |
| ·PKLR基因多态位点的遗传效应分析 | 第119-120页 |
| ·ENO3基因StuI-RFLP的遗传效应分析 | 第120页 |
| 7 基因的表达特征分析 | 第120-123页 |
| ·CA3基因的表达特征分析 | 第121页 |
| ·ENO3基因的表达特征分析 | 第121-122页 |
| ·FOXA2基因的组织表达谱分析 | 第122-123页 |
| 8 基因的启动子克隆及其活性检测 | 第123-125页 |
| ·ENO3基因的启动子克隆及活性检测 | 第124-125页 |
| ·AGL基因的启动子序列分析 | 第125页 |
| 9 下一步研究工作 | 第125-127页 |
| 小结 | 第127-128页 |
| 参考文献 | 第128-139页 |
| 致谢 | 第139-140页 |
| 在读期间发表论文题录 | 第140页 |
