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中国春小麦3B染色体Sr2/FHB区BAC测序及大片段线粒体DNA插入分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
1 引言第11-24页
   ·小麦基因组测序第11-16页
     ·小麦基因组测序的意义第11页
     ·小麦BAC 文库的构建第11-15页
     ·小麦BAC 克隆测序第15-16页
   ·小麦线粒体DNA 向小麦细胞核基因组转移的研究第16-24页
     ·线粒体介绍第16-18页
     ·小麦线粒体基因组和高等植物线粒体基因组介绍第18-20页
     ·细胞器基因组DNA 向细胞核的转移第20-24页
2 材料与方法第24-35页
   ·材料第24页
   ·方法第24-35页
     ·BAC 克隆测序第24-32页
       ·BAC 亚克隆文库的构建第25-29页
       ·亚克隆测序第29-32页
     ·BAC 全序列的拼接第32页
     ·BAC 全序列分析第32-33页
     ·引物设计第33页
       ·填补空隙(gap)的引物设计第33页
       ·插入区特异引物的设计第33页
     ·BAC 文库高密度膜的筛选第33-35页
       ·预杂交第33-34页
       ·探针标记第34页
       ·杂交第34页
       ·洗膜第34-35页
       ·放射性自显影第35页
3. 结果与分析第35-54页
   ·BAC 克隆测序第35-38页
     ·鸟枪法亚克隆文库的构建第35-37页
     ·亚克隆测序第37页
     ·测序的质量评价第37-38页
   ·中国春小麦3B 染色体SR2/FHB 区BAC 测序第38-39页
   ·BAC 克隆3B-088-P23 和3B-028-F08 的全序列组装第39页
   ·BAC 克隆3B-088-P23 和3B-028-F08 的序列分析第39-54页
     ·~52kb 小麦线粒体DNA 插入到小麦3B 染色体的分析第39-48页
       ·~52kb NUMT 的鉴定和验证第39-40页
       ·四倍体小麦Langdon BAC 文库高密度尼龙膜的筛选第40页
       ·~52kb NUMT 的中国春缺体-四体分析第40-42页
       ·~52kb NUMT 的基因和重复序列分布第42-44页
       ·~52kb NUMT 与水稻的共线性分析第44-45页
       ·~52kb NUMT 核苷酸替换规律和InDels分析第45-47页
       ·~52kb NUMT 插入事件发生时间推测第47-48页
     ·~52kb NUMT 侧翼序列分析第48-54页
       ·重复序列分析第48-50页
       ·基因分析第50页
       ·简单重复序列分析第50-54页
4 讨论第54-58页
   ·~52KB NUMT 插入其核基因组发生时间的推测第54-55页
   ·~52KB NUMT 的进化保守性及与水稻共线性分析第55页
   ·线粒体DNA 序列向核基因组转移与整合机制(模式)第55-56页
   ·~52KB NUMT 位点基因及重复序列分布第56-58页
   ·下一步研究设想第58页
5 结论第58-60页
参考文献第60-74页
致谢第74-75页
攻读学位期间发表论文情况第75页

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