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牛源环孢子虫与贾第虫的分子特性与检测研究

摘要第1-14页
前言第14-18页
第一部分 牛源环孢子虫形态学观察和分子特性及分子检测的研究第18-76页
 第一章 牛源环孢子虫形态学观察第18-26页
  1 材料与方法第18-20页
   ·材料第18-19页
     ·主要仪器第18页
     ·环孢子虫第18页
     ·溶液配制第18-19页
   ·方法第19-20页
     ·粪样采集第19页
     ·蔗糖漂浮法第19页
     ·改良抗酸染色法第19页
     ·卵囊的孢子化第19页
     ·卵囊的分离与纯化第19-20页
  2 结果与分析第20-22页
   ·蔗糖漂浮法检查结果第20页
   ·改良抗酸染色法检查结果第20-21页
   ·卵囊孢子化情况第21-22页
   ·卵囊的分离纯化第22页
  3 讨论第22-24页
   ·牛源环孢子虫的形态学特点第22-23页
   ·环孢子虫卵囊的孢子化特点第23-24页
   ·关于环孢子虫的分离与纯化第24页
  本章小结第24-26页
 第二章 牛源环孢子虫的分子特性研究第26-50页
  1 材料与方法第26-36页
   ·材料第26-28页
     ·主要仪器第26页
     ·环孢子虫卵囊第26页
     ·工程菌和载体第26页
     ·酶类和试剂第26-27页
     ·培养基第27页
     ·缓冲液及其它溶液第27-28页
     ·其它试剂第28页
   ·方法第28-36页
     ·引物的设计与合成第28-29页
     ·环孢子虫分离与纯化第29页
     ·环孢子虫基因组DNA的抽提第29-30页
     ·ITS1+序列PeR扩增第30-31页
     ·18S rDNA部分序列套式PCR扩增第31-32页
     ·PCR产物的检测第32页
     ·18S rDNA扩增产物RFLP分析第32页
     ·PCR产物的回收与纯化第32-33页
     ·PCR纯化产物与pGEM-T Easy载体的连接第33页
     ·感受态细胞的制备第33-34页
     ·连接产物的转化第34页
     ·阳性克隆的筛选与PCR鉴定第34页
     ·PCR阳性克隆的质粒抽提第34-35页
     ·重组质粒酶切鉴定第35页
     ·阳性克隆的序列测定第35-36页
     ·序列相似性比较和种类确定第36页
  2 结果与分析第36-45页
   ·ITS-1+序列PCR扩增结果第36页
   ·18S rDNA部分序列套式PCR扩增结果第36-37页
   ·18S rDNA扩增产物RFLP分析结果第37-38页
   ·ITS-1+重组质粒的鉴定结果第38-39页
   ·18SrDNA重组质粒的鉴定结果第39-40页
   ·ITS-1+序列测定与分析第40-41页
   ·18S rDNA序列测定与分析第41-45页
  3 讨论第45-49页
   ·环孢子虫的命名与分类学地位第45-46页
   ·关于环孢子虫的ITS-1序列第46-47页
   ·环孢子虫的18S rDNA系统发育分析第47-48页
   ·环孢子虫的PCR-RFLP分析第48-49页
  本章小结第49-50页
 第三章 牛源环孢子虫分子检测方法研究第50-76页
  第一节 牛源环孢子虫套式PCR检测方法的建立第50-60页
   1 材料与方法第50-53页
   ·材料第50页
     ·主要仪器第50页
     ·虫体及对照DNA材料第50页
     ·临床奶牛粪便样品第50页
     ·酶类和试剂第50页
     ·缓冲液及其它溶液第50页
   ·方法第50-53页
     ·引物的设计与合成第50-51页
     ·环孢子虫DNA阳性参照模板的制备第51页
     ·临床样品的处理第51页
     ·临床样品DNA的抽提第51-52页
     ·套式PCR退火温度的优化第52页
     ·特异性检测第52-53页
     ·敏感性检测第53页
     ·临床样品的检测试验第53页
   2 结果与分析第53-57页
   ·最佳退火温度的确定第53-54页
   ·特异性试验第54-56页
     ·对照样品DNA有效性检测第54-55页
     ·特异性引物PCR扩增结果第55-56页
   ·敏感性试验第56-57页
   ·临床样品的检测结果第57页
     ·传统检测第57页
     ·套式PCR检测第57页
   3 讨论第57-60页
   ·关于环孢子虫的检测方法第57-58页
   ·关于PCR检测方法的特异性第58页
   ·关于PCR检测方法的敏感性第58-59页
   ·临床样品检测结果的分析第59-60页
  第二节 牛源环孢子虫套式PCR-液相杂交-酶显色检测方法的建立第60-76页
   1 材料与方法第60-64页
   ·材料第60-61页
     ·主要仪器第60页
     ·虫体及对照DNA材料第60页
     ·主要试剂和酶类第60页
     ·缓冲液及其它溶液第60-61页
   ·方法第61-64页
     ·探针和引物的设计与合成第61页
     ·套式PCR扩增第61-62页
     ·套式PCR产物的检测和浓度的测定第62页
     ·液相杂交-酶显色检测方法的建立第62页
     ·液相杂交与固相杂交的比较第62-63页
     ·特异性检测第63页
     ·敏感性检测第63页
     ·PCR产物检测的定量第63页
     ·临床样品的检测试验第63-64页
   2 结果与分析第64-71页
   ·套式PCR产物的检测和浓度的测定第64页
   ·液相杂交退火温度的优化第64-65页
   ·液相杂交退火时间的优化第65页
   ·液相杂交探针用量的优化第65-66页
   ·杂交产物与微孔板结合时间的优化第66-67页
   ·酶标抗地高辛抗体使用浓度的优化第67页
   ·液相杂交与固相杂交的比较第67-68页
   ·特异性试验第68-69页
   ·敏感性试验第69-70页
   ·PCR产物检测的定量第70-71页
   ·临床样品的检测试验第71页
   3 讨论第71-74页
   ·核酸杂交-酶显色检测PCR产物的优越性第71-72页
   ·与常规PCR检测方法的结果比较和分析第72-73页
   ·关于核酸杂交的方式第73页
   ·关于反应条件的分析第73-74页
   本章小结第74-76页
第二部分 牛源贾第虫形态学观察和分子特性及分子检测的研究第76-101页
 第四章 牛源贾第虫形态学观察第76-82页
  1 材料与方法第76-77页
   ·材料第76页
     ·主要仪器第76页
     ·贾第虫第76页
     ·溶液配制第76页
   ·方法第76-77页
     ·粪样采集第76页
     ·检查方法第76-77页
     ·包囊的分离与纯化第77页
  2 结果与分析第77-79页
   ·包囊形态第77-78页
   ·包囊的分离纯化第78-79页
  3 讨论第79-81页
   ·贾第虫的形态特征第79-80页
   ·关于贾第虫的感染情况第80页
   ·关于贾第虫的分离与纯化第80-81页
  本章小结第81-82页
 第五章 牛源贾第虫的分子特性研究第82-94页
  1 材料与方法第82-86页
   ·材料第82页
   ·方法第82-86页
     ·引物的设计与合成第82-83页
     ·贾第虫分离与纯化第83页
     ·贾第虫基因组DNA的抽提第83页
     ·16S rRNA基因PCR扩增第83-84页
     ·TPI基因PCR扩增第84页
     ·PCR产物的检测第84页
     ·PCR产物的回收与纯化第84-85页
     ·PCR纯化产物与pMD18-T载体的连接第85页
     ·感受态细胞的制备第85页
     ·连接产物的转化第85页
     ·阳性克隆的筛选与PCR鉴定第85页
     ·PCR阳性克隆的质粒抽提第85页
     ·重组质粒酶切鉴定第85-86页
     ·阳性克隆的序列测定第86页
     ·系统发育分析与种类确定第86页
  2 结果与分析第86-91页
   ·16S rRNA基因PCR扩增结果第86-87页
   ·TPI基因PCR扩增结果第87页
   ·16S rDNA重组质粒的鉴定第87-88页
   ·TPI基因重组质粒的鉴定第88-89页
   ·序列测定结果第89页
   ·系统发育与基因型分析第89-91页
  3 讨论第91-93页
   ·贾第虫的种类及基因型第91-92页
   ·高GC含量模板的PCR扩增第92-93页
  本章小结第93-94页
 第六章 牛源贾第虫套式PCR检测方法的建立第94-101页
  1 材料与方法第94-95页
   ·材料第94页
   ·方法第94-95页
     ·引物的设计与合成第94页
     ·贾第虫DNA阳性参照模板的制备第94页
     ·套式PCR退火温度的优化第94-95页
     ·特异性检测第95页
     ·敏感性检测第95页
     ·临床样品的检测试验第95页
  2 结果与分析第95-99页
   ·最佳退火温度的确定第95-96页
   ·特异性试验第96页
   ·敏感性试验第96-98页
   ·临床样品的检测结果第98-99页
  3 讨论第99-100页
   ·关于贾第虫的检测方法第99页
   ·关于模板DNA的制备第99-100页
  本章小结第100-101页
全文总结第101-103页
致谢第103-104页
参考文献第104-115页
Abstract第115-118页
附录A 文献综述第118-134页
附录B 质粒pGEM-T Easy基因图谱第134-135页
附录C 质粒pMD18-T基因图谱第135-136页
附录D 学习期间发表论文及获奖情况第136-138页

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