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优质肉鸡黑素皮质素受体3、4基因单核苷酸多态性与生产性状相关研究

1 文献综述第1-27页
   ·优质肉鸡定义及其肉质性状的研究现况第13-15页
     ·优质肉鸡定义及肉质风味性状第13-14页
     ·优质肉鸡性状重要候选基因的研究第14-15页
   ·黑素皮质素及其受体研究进展第15-19页
     ·黑素皮质素研究概况第15-16页
     ·黑素皮质素受体研究概况第16-19页
       ·黑素皮质素受体的分子结构特点第16-17页
       ·黑素皮质素受体介导的细胞信号传导途径第17-18页
       ·黑素皮质素受体的生理及生物学效应第18-19页
   ·黑素皮质素受体基因研究进展第19-22页
     ·黑素皮质素受体基因研究概况第19-20页
     ·MC3R和MC4R基因与性状相关研究的概况第20-22页
   ·分子标记与单链构象多态性技术的研究进展第22-26页
     ·分子标记概述第22-24页
       ·限制性片段长度多态性标记第22-23页
       ·微卫星标记第23页
       ·单核苷酸多态性标记第23-24页
     ·单链构象多态性检测技术第24-26页
       ·SSCP技术的建立与发展第24-25页
       ·PCR-SSCP技术的原理第25页
       ·PCR-SSCP技术的特点第25-26页
   ·本研究的主要内容和目的意义第26-27页
2 试验材料和方法第27-36页
   ·试验材料与设备第27-29页
     ·试验鸡群来源及采样第27页
     ·分子试验所需试剂、药品及来源第27页
     ·主要仪器与设备第27-28页
     ·缓冲液与常用试剂的配制第28-29页
     ·主要分子生物学软件第29页
   ·试验方法第29-36页
     ·屠宰和肉质性状数据测定第29-30页
     ·细胞DNA的提取第30页
     ·DNA浓度和纯度的检测第30-31页
     ·PCR引物设计第31-32页
       ·根据Genbank发布MC3R基因序列设计引物第31页
       ·根据Genbank发布MC4R基因序列设计引物第31-32页
     ·PCR反应第32-33页
     ·PCR产物的检测及测序第33页
     ·琼脂糖凝胶的制备及检测方法第33页
     ·变性聚丙烯酰胺电泳及检测方法第33-34页
       ·聚丙烯酰胺凝胶制备及上样第33-34页
       ·聚丙烯酰胺凝胶银染第34页
     ·数据统计分析第34-36页
       ·等位基因频率第34-35页
       ·遗传纯合度第35页
       ·遗传杂合度第35页
       ·有效等位基因数第35页
       ·多态信息含量第35页
       ·统计分析模型第35-36页
3 试验结果及分析第36-72页
   ·分子试验结果及分子生物学分析第36-45页
     ·鸡基因组抽体提结果第36页
     ·MC4R-EXON、5’-UTL引物PCR扩增及测序对比第36-37页
       ·MC4R-EXON、5’-UTL引物PCR结果第36-37页
       ·MC4R-EXON、5’-UTL引物PCR产物测序比对结果第37页
     ·MC3R、MC4R各SSCP引物PCR扩增结果第37-39页
       ·MC3R-X、Y引物PCR扩增结果第37-38页
       ·MC4R-1.1、2.2、3.2、4.1引物PCR扩增结果第38-39页
     ·MC3R、MC4R基因各SSCP多态性检测结果第39-42页
       ·MC3R-X引物产物SSCP检测及SNP第39-40页
       ·MC4R-2.2引物产物SSCP检测及SNP第40-41页
       ·MC4R-3.2引物产物SSCP检测及SNP第41-42页
     ·MC3R、MC4R基因试验结果分子生物学分析第42-45页
       ·SNPs错义突变第42-43页
       ·氨基酸改变对多肽功能、结构影响的分析第43-45页
   ·各个SNPs位点的遗传学分析第45-50页
     ·定义SNPs及基因型名称第45页
     ·各个SNPs位点等位基因在不同群体中的分布第45-48页
       ·MC3R-1424位点等位基因及基因型频率第45-46页
       ·MC4R-923位点等位基因及基因型频率第46-47页
       ·MC4R-944位点等位基因及基因型频率第47-48页
     ·各个SNPs位点的遗传特性分析第48-50页
   ·各屠宰性状的单位点基因型遗传效应分析第50-63页
     ·屠宰前体重的各SNP位点基因型遗传效应分析第50-52页
       ·各群体鸡屠宰前体重测定结果及分析第50页
       ·屠宰前体重的各SNP位点基因型遗传效应分析第50-52页
     ·屠体重的各SNP位点基因型遗传效应分析第52-53页
       ·各群体鸡屠体重测定结果及分析第52页
       ·屠体重的各SNP位点基因型遗传效应分第52-53页
     ·半净膛率的各SNP位点基因型遗传效应分析第53-55页
       ·各群体鸡半净膛率计算结果及分析第53-54页
       ·半净膛率的各SNP位点基因型遗传效应分析第54-55页
     ·胸肌重的各SNP位点基因型遗传效应分析第55-57页
       ·各群体鸡胸肌重测定结果及分析第55-56页
       ·胸肌重的各SNP位点基因型遗传效应分析第56-57页
     ·腿肌重的各SNP位点基因型遗传效应分析第57-58页
       ·各群体鸡腿肌重测定结果及分析第57页
       ·腿肌重的各SNP位点基因型遗传效应分析第57-58页
     ·腿肌率的各SNP点基因型遗传效应分析第58-60页
       ·各群体鸡腿肌率计算结果及分析第58-59页
       ·腿肌率的各SNP位点基因型遗传效应分析第59-60页
     ·腹脂重的各SNP位点基因型遗传效应分析第60-61页
       ·各群体鸡腹脂重测定结果及分析第60-61页
       ·腹脂重的各SNP位点基因型遗传效应分析第61页
     ·皮脂厚的各SNP位点基因型遗传效应分析第61-63页
       ·各群体鸡皮脂厚测定结果及分析第61-62页
       ·皮脂厚的各SNP位点基因型遗传效应分析第62-63页
   ·单位点基因型对肉质性状的遗传效应分析第63-68页
     ·各群体鸡胸肌肉质性状测定结果及分析第63-65页
     ·各个SNP位点对肉质性状的遗传效应分析第65-68页
       ·MC3R-1424位点对肉质性状的遗传效应分析第65-66页
       ·MC4R-923位点对肉质性状的遗传效应分析第66-67页
       ·MC4R-944位点对肉质性状的遗传效应分析第67-68页
   ·复合位点基因型对生产性状的遗传效应分析第68-72页
     ·复合位点的定义第68页
     ·复合位点对屠宰性状的遗传效应分析第68-70页
     ·复合位点对肉质性状的遗传效应分析第70-72页
4 讨论第72-82页
   ·试验材料的选择第72页
   ·于DNA的抽提第72页
   ·关于PCR扩增反应第72-74页
   ·影响PCR-SSCP检测的因素第74-77页
     ·PCR产物的质量第74-75页
     ·DNA片段中点突变的位置对SSCP的影响第75页
     ·PCR片段的长度第75页
     ·非变性聚丙烯酰胺凝胶成分第75-76页
     ·上样缓冲液与扩增产物变性第76页
     ·电泳电压第76-77页
     ·SSCP结果的分辨第77页
     ·其它因素第77页
   ·关于本试验各产物PCR-SSCP的带型及SNPs第77-78页
   ·关于三个位点的群体遗传学分析第78-79页
   ·关于三个位点对屠宰性状的遗传效应分析第79-80页
   ·关于三个位点对肉质性状的遗传效应分析第80-81页
   ·关于各基因型组合对生产性状的遗传效应分析第81-82页
5 结论第82-84页
参考文献第84-89页
致谢第89-90页
附录第90页

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