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普通小麦淀粉相关品质性状的全基因组关联分析

致谢第4-7页
摘要第7-9页
1 文献综述第9-15页
    1.1 淀粉的结构和功能第9-11页
        1.1.1 淀粉的结构第9页
        1.1.2 淀粉的生物合成第9-10页
        1.1.3 小麦淀粉及其组分的影响因素第10页
        1.1.4 小麦淀粉性状与品质的关系第10-11页
        1.1.5 小麦淀粉品质性状的遗传研究第11页
    1.2 分子标记技术发展第11-13页
        1.2.1 限制性片段长度多态性标记(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)第12页
        1.2.2 简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)第12页
        1.2.3 多样性微阵列技术(Diversity array technology,DArT)第12-13页
        1.2.4 单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)第13页
    1.3 关联分析及其应用第13-15页
        1.3.1 关联分析的基础第13页
        1.3.2 关联分析的应用第13-15页
2 引言第15-16页
3 材料与方法第16-19页
    3.1 试验材料及田间种植第16页
    3.2 小麦品质测定第16-18页
        3.2.1 总淀粉含量(Starch content,SC)测定第16页
        3.2.2 直链淀粉含量(Amylose content,AC)测定第16-17页
        3.2.3 支链淀粉含量(Amylopectin content,Ac)测定第17页
        3.2.4 籽粒硬度、蛋白质含量、湿面筋含量测定第17-18页
    3.3 DNA提取以及SNP分型第18页
    3.4 群体结构与主成分分析第18页
    3.5 数据统计与分析第18-19页
        3.5.1 表型数据的统计分析第18页
        3.5.2 SNP标记的统计分析第18页
        3.5.3 连锁不平衡分析第18-19页
    3.6 关联分析与候选基因的筛选第19页
4 结果与分析第19-46页
    4.1 群体结构与主成分分析第19页
    4.2 SNP标记分析第19-20页
    4.3 连锁不平衡分析第20-21页
    4.4 小麦品质性状的基本统计量第21-22页
    4.5 小麦品质性状间的相关性第22-23页
    4.6 小麦品质性状的关联分析第23-39页
        4.6.1 小麦品质性状频率分布图第23-24页
        4.6.2 小麦淀粉品质性状的关联位点第24页
        4.6.3 小麦蛋白质含量、湿面筋含量和籽粒硬度的关联位点第24页
        4.6.4 一因多效的SNP位点第24-32页
        4.6.5 小麦淀粉品质性状的优势等位变异第32页
        4.6.6 小麦蛋白质含量、湿面筋含量和籽粒硬度的优势等位变异第32-39页
    4.7 候选基因功能分析第39-46页
5 结论与讨论第46-50页
    5.1 小麦35K芯片数据分析第46页
    5.2 小麦品质性状间的相关性第46页
    5.3 小麦品质性状的关联分析第46-48页
        5.3.1 小麦淀粉性状的关联分析第47页
        5.3.2 小麦蛋白质含量、湿面筋含量和籽粒硬度的关联分析第47-48页
    5.4 小麦品质性状的候选基因第48-50页
参考文献第50-56页
Abstract第56-58页
附录1 英文缩略表第59页
附录2 供试小麦材料第59-61页
附录3 SNP标记信息第61-62页
附图1第62-63页

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