摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-13页 |
第一章 绪论 | 第13-24页 |
·B 细胞表位预测方法研究进展 | 第13-15页 |
·B 细胞表位预测的方法及应用 | 第13-15页 |
·分子对接研究进展 | 第15-17页 |
·分子对接的原理及应用 | 第16-17页 |
·用于结构研究的计算生物学方法 | 第17页 |
·同源建模 | 第17页 |
·从头预测 | 第17页 |
·禽流感病毒的生物学研究进展 | 第17-23页 |
·禽流感病毒的形态特征及其化学组成 | 第17-18页 |
·禽流感病毒的基因组结构及其编码蛋白的功能 | 第18-19页 |
·禽流感病毒的免疫原性及抗原变异机理 | 第19-20页 |
·HA的结构及功能 | 第20-21页 |
·禽流感病毒的流行情况 | 第21-22页 |
·禽流感疫苗研制 | 第22-23页 |
·本研究的目的及意义 | 第23-24页 |
第二章 B细胞表位数据库的建立 | 第24-34页 |
·材料和方法 | 第24-25页 |
·材料 | 第24页 |
·方法 | 第24-25页 |
·结果 | 第25-32页 |
·62 个抗原抗体复合物晶体结构数据集 | 第25-28页 |
·表位的类型 | 第28-30页 |
·表位的大小 | 第30页 |
·表位的面积 | 第30-31页 |
·表位富含的氨基酸 | 第31-32页 |
·表位氨基酸的二级结构 | 第32页 |
·讨论 | 第32-34页 |
第三章 异源抗体对接预测B细胞表位的可行性分析 | 第34-40页 |
·材料和方法 | 第34-35页 |
·材料 | 第34页 |
·方法 | 第34-35页 |
·结果 | 第35-38页 |
·预测表位的空间构象 | 第35-36页 |
·预测表位的氨基酸组成 | 第36-38页 |
·讨论 | 第38-40页 |
第四章 B细胞表位预测方法的建立 | 第40-47页 |
·材料和方法 | 第40-43页 |
·材料 | 第40页 |
·方法 | 第40-43页 |
·结果 | 第43-46页 |
·阈值的确定 | 第43-46页 |
·讨论 | 第46-47页 |
第五章 GD/1/96 HA B细胞表位的预测及其与SX/2/06 HA抗原性差异分析 | 第47-59页 |
·材料和方法 | 第47-51页 |
·材料 | 第47-48页 |
·方法 | 第48-51页 |
·结果 | 第51-58页 |
·结构模板的获得 | 第51-52页 |
·模板的优化-分子动力学模拟 | 第52-53页 |
·同源建模的结果 | 第53页 |
·模型的评价 | 第53-54页 |
·A/Goose/Guangdong/1/96(H5N1)HA B细胞表位预测打分结果 | 第54页 |
·表位的确定及空间绘图 | 第54页 |
·GD/1/96 与SX/2/06 的抗原相关性计算 | 第54页 |
·找出引起抗原差异性的氨基酸 | 第54-56页 |
·差异位点的分析 | 第56-58页 |
·讨论 | 第58-59页 |
第六章 结论 | 第59-60页 |
参考文献 | 第60-64页 |
致谢 | 第64-65页 |
作者简介 | 第65页 |