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一种B细胞构象表位预测方法的建立及初步应用

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
第一章 绪论第13-24页
   ·B 细胞表位预测方法研究进展第13-15页
     ·B 细胞表位预测的方法及应用第13-15页
   ·分子对接研究进展第15-17页
     ·分子对接的原理及应用第16-17页
   ·用于结构研究的计算生物学方法第17页
     ·同源建模第17页
     ·从头预测第17页
   ·禽流感病毒的生物学研究进展第17-23页
     ·禽流感病毒的形态特征及其化学组成第17-18页
     ·禽流感病毒的基因组结构及其编码蛋白的功能第18-19页
     ·禽流感病毒的免疫原性及抗原变异机理第19-20页
     ·HA的结构及功能第20-21页
     ·禽流感病毒的流行情况第21-22页
     ·禽流感疫苗研制第22-23页
   ·本研究的目的及意义第23-24页
第二章 B细胞表位数据库的建立第24-34页
   ·材料和方法第24-25页
     ·材料第24页
     ·方法第24-25页
   ·结果第25-32页
     ·62 个抗原抗体复合物晶体结构数据集第25-28页
     ·表位的类型第28-30页
     ·表位的大小第30页
     ·表位的面积第30-31页
     ·表位富含的氨基酸第31-32页
     ·表位氨基酸的二级结构第32页
   ·讨论第32-34页
第三章 异源抗体对接预测B细胞表位的可行性分析第34-40页
   ·材料和方法第34-35页
     ·材料第34页
     ·方法第34-35页
   ·结果第35-38页
     ·预测表位的空间构象第35-36页
     ·预测表位的氨基酸组成第36-38页
   ·讨论第38-40页
第四章 B细胞表位预测方法的建立第40-47页
   ·材料和方法第40-43页
     ·材料第40页
     ·方法第40-43页
   ·结果第43-46页
     ·阈值的确定第43-46页
   ·讨论第46-47页
第五章 GD/1/96 HA B细胞表位的预测及其与SX/2/06 HA抗原性差异分析第47-59页
   ·材料和方法第47-51页
     ·材料第47-48页
     ·方法第48-51页
   ·结果第51-58页
     ·结构模板的获得第51-52页
     ·模板的优化-分子动力学模拟第52-53页
     ·同源建模的结果第53页
     ·模型的评价第53-54页
     ·A/Goose/Guangdong/1/96(H5N1)HA B细胞表位预测打分结果第54页
     ·表位的确定及空间绘图第54页
     ·GD/1/96 与SX/2/06 的抗原相关性计算第54页
     ·找出引起抗原差异性的氨基酸第54-56页
     ·差异位点的分析第56-58页
   ·讨论第58-59页
第六章 结论第59-60页
参考文献第60-64页
致谢第64-65页
作者简介第65页

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