摘要 | 第1-13页 |
ABSTRACT | 第13-16页 |
英汉縮略语名词对照 | 第16-17页 |
1 引言 | 第17-41页 |
·动物近交系的定义及近交的遗传学效应 | 第17-18页 |
·动物近交系的定义 | 第17页 |
·近交的遗传学效应 | 第17-18页 |
·动物近交系培育的遗传学意义 | 第18页 |
·国内外动物近交系研究概况 | 第18-19页 |
·版纳微型猪近交系的培育 | 第19-23页 |
·版纳猪近交系的建立 | 第19-21页 |
·立项背景 | 第19页 |
·系祖选择 | 第19-20页 |
·系祖选定 | 第20页 |
·近交衰退 | 第20-21页 |
·版纳微型猪祖先的出现及版纳微型猪近交系的建立 | 第21-22页 |
·版纳微型猪祖先的出现 | 第21页 |
·版纳微型猪近交系的建立 | 第21-22页 |
·版纳微型猪近交系亚系的形成 | 第22页 |
·版纳微型猪近交系鉴定后的应用前景 | 第22-23页 |
·表达序列标签(EST)在新基因克隆中的应用 | 第23-25页 |
·荧光定量PCR(qPCR) | 第25页 |
·本研究相关基因研究概况 | 第25-39页 |
·GH(生长激素基因) | 第25-27页 |
·AQP3(水通道蛋白基因3) | 第27-28页 |
·VEGF(血管内皮生长因子) | 第28-30页 |
·TNF-α(肿瘤坏死因子α) | 第30-31页 |
·IFN-α(α干扰素) | 第31-32页 |
·IL-6(白细胞介素6) | 第32-34页 |
·SRY(Y染色体性别决定基因) | 第34-35页 |
·FAIM1(Fas细胞凋亡抑制分子) | 第35-36页 |
·PQBP1(多聚谷氨酰胺结合蛋白1) | 第36页 |
·STXBP6(突触结合蛋白6) | 第36-37页 |
·RBKS(核糖激酶) | 第37页 |
·FAR1(脂乙酰辅酶A还原酶1) | 第37-38页 |
·CENPP(着丝粒蛋白P) | 第38-39页 |
·本研究的目的和意义 | 第39-41页 |
2 材料与方法 | 第41-62页 |
·主要仪器及试剂 | 第41-43页 |
·主要仪器 | 第41-42页 |
·主要试剂 | 第42-43页 |
·主要试剂的配制 | 第43-44页 |
·实验材料采集 | 第44页 |
·基因组DNA和RNA提取 | 第44-47页 |
·血液DNA提取 | 第44-45页 |
·组织RNA提取 | 第45-47页 |
·核酸的质量检测 | 第47-48页 |
·琼脂糖凝胶检测(胶染法+点染法) | 第47页 |
·核酸蛋白测定仪检测浓度和纯度 | 第47-48页 |
·cDNA第一链合成 | 第48页 |
·引物的设计及合成 | 第48-52页 |
·PCR扩增及产物检测 | 第52-53页 |
·不同基因的PCR反应体系及扩增程序 | 第52-53页 |
·PCR产物检测 | 第53页 |
·PCR产物的回收纯化 | 第53-54页 |
·连接反应 | 第54页 |
·感受态细胞的制备 | 第54-55页 |
·连接产物的转化 | 第55页 |
·菌液PCR鉴定 | 第55-56页 |
·质粒提取 | 第56-57页 |
·酶切鉴定 | 第57页 |
·PCR鉴定 | 第57页 |
·基因序列测定 | 第57页 |
·荧光定量分析基因的表达量 | 第57-58页 |
·原核表达载体的构建 | 第58-60页 |
·重组质粒在大肠杆菌中的表达 | 第60页 |
·蛋白表达产物的SDS-PAGE检测 | 第60页 |
·Western blot验证 | 第60页 |
·生物信息学分析 | 第60-62页 |
3 结果与分析 | 第62-137页 |
·核酸提取后的检测结果 | 第62-63页 |
·DNA检测结果 | 第62页 |
·RNA检测结果 | 第62-63页 |
·版纳微型猪近交系GH基因克隆、表达及功能预测 | 第63-70页 |
·GH基因扩增结果 | 第63页 |
·GH基因序列及氨基酸序列 | 第63-64页 |
·GH蛋白保守结构域 | 第64-65页 |
·GH蛋白二级结构 | 第65页 |
·GH蛋白三级结构 | 第65页 |
·不同猪品种GH基因序列比对结果 | 第65-66页 |
·多物种GH氨基酸序列比对结果 | 第66-68页 |
·GH多物种系统进化树 | 第68页 |
·pET-32α-GH重组质粒鉴定结果 | 第68-69页 |
·pET-32α-GH重组蛋白的SDS-PAGE检测结果 | 第69-70页 |
·pET-32α-GH重组蛋白的Western blot鉴定 | 第70页 |
·版纳微型猪近交系AQP3基因克隆、表达及功能预测 | 第70-75页 |
·AQP3基因扩增结果 | 第70-71页 |
·AQP3基因序列及氨基酸序列 | 第71-72页 |
·AQP3蛋白保守结构域 | 第72页 |
·AQP3蛋白二级结构 | 第72页 |
·AQP3蛋白三级结构 | 第72-73页 |
·不同猪品种AQP3基因序列比对结果 | 第73页 |
·多物种AQP3氨基酸序列比对结果 | 第73-74页 |
·AQP3多物种系统进化树 | 第74-75页 |
·AQP3基因多组织荧光定量检测结果 | 第75页 |
·版纳微型猪近交系VEGF基因克隆、表达及功能预测 | 第75-81页 |
·VEGF基因扩增结果 | 第75-76页 |
·VEGF基因序列及氨基酸序列 | 第76-77页 |
·VEGF蛋白保守结构域 | 第77页 |
·VEGF蛋白二级结构 | 第77页 |
·VEGF蛋白三级结构 | 第77-78页 |
·不同猪品种VEGF基因序列比对结果 | 第78-79页 |
·多物种VEGF氨基酸序列比对结果 | 第79-80页 |
·VEGF多物种系统进化树 | 第80-81页 |
·VEGF基因多组织荧光定量检测结果 | 第81页 |
·版纳微型猪近交系TNF-α基因克隆、表达及功能预测 | 第81-88页 |
·TNF-α基因扩增结果 | 第81-82页 |
·TNF-α基因序列及氨基酸序列 | 第82-83页 |
·TNF-α蛋白保守结构域 | 第83页 |
·TNF-α蛋白二级结构 | 第83页 |
·TNF-α蛋白三级结构 | 第83-84页 |
·不同猪品种TNF-α基因序列比对结果 | 第84页 |
·多物种TNF-α氨基酸序列比对结果 | 第84-87页 |
·TNF-α多物种系统进化树 | 第87页 |
·TNF-α基因多组织荧光定量检测结果 | 第87-88页 |
·版纳微型猪近交系IFN-α基因克隆、表达及功能预测 | 第88-93页 |
·IFN-α基因扩增结果 | 第88页 |
·IFN-α基因序列及氨基酸序列 | 第88-89页 |
·IFN-α蛋白保守结构域 | 第89页 |
·IFN-α蛋白二级结构 | 第89-90页 |
·IFN-α蛋白三级结构 | 第90页 |
·不同猪品种IFN-α基因序列比对结果 | 第90-91页 |
·多物种IFN-α氨基酸序列比对结果 | 第91-92页 |
·IFN-α多物种系统进化树 | 第92页 |
·IFN-α基因多组织荧光定量检测结果 | 第92-93页 |
·版纳微型猪近交系IL-6基因克隆、表达及功能预测 | 第93-99页 |
·IL-6基因扩增结果 | 第93-94页 |
·IL-6基因序列及氨基酸序列 | 第94页 |
·IL-6蛋白保守结构域 | 第94-95页 |
·IL-6蛋白二级结构 | 第95页 |
·IL-6蛋白三级结构 | 第95页 |
·不同品种猪IL-6基因序列比对结果 | 第95-96页 |
·多物种IL-6氨基酸序列比对结果 | 第96-97页 |
·IL-6多物种系统进化树 | 第97-98页 |
·IL-6基因多组织荧光定量检测结果 | 第98-99页 |
·版纳微型猪近交系SRY基因克隆、表达及功能预测 | 第99-106页 |
·SRY基因扩增结果 | 第99-100页 |
·SRY F1/R1 PCR扩增结果 | 第99页 |
·SRY F2/R2 PCR扩增结果 | 第99-100页 |
·SRY基因序列及氨基酸序列 | 第100页 |
·SRY蛋白保守结构域 | 第100-101页 |
·SRY蛋白二级结构 | 第101页 |
·SRY蛋白三级结构 | 第101-102页 |
·不同品种猪SRY基因序列比对结果 | 第102-103页 |
·多物种SRY氨基酸序列比对结果 | 第103-104页 |
·SRY多物种系统进化树 | 第104-105页 |
·pET-32a-SRY重组质粒鉴定结果 | 第105页 |
·pET-32a-SRY重组蛋白的SDS-PAGE检测结果 | 第105-106页 |
·版纳微型猪近交系FAIM1基因克隆、表达及功能预测 | 第106-111页 |
·FAIM1基因扩增结果 | 第106-107页 |
·FAIM1基因序列及氨基酸序列 | 第107-108页 |
·FAIM1蛋白保守结构域 | 第108页 |
·FAIM1蛋白二级结构 | 第108页 |
·FAIM1蛋白三级结构 | 第108-109页 |
·多物种FAIM1氨基酸序列比对结果 | 第109-110页 |
·FAIM1多物种系统进化树 | 第110页 |
·FAIM1基因多组织荧光定量检测结果 | 第110-111页 |
·版纳微型猪近交系PQBP1基因克隆、表达及功能预测 | 第111-116页 |
·PQBP1基因扩增结果 | 第111-112页 |
·PQBP1基因序列及氨基酸序列 | 第112页 |
·PQBP1蛋白保守结构域 | 第112-113页 |
·PQBP1蛋白二级结构 | 第113页 |
·PQBP1蛋白三级结构 | 第113页 |
·多物种PQBP1氨基酸序列比对结果 | 第113-115页 |
·PQBP1多物种系统进化树 | 第115页 |
·PQBP1基因多组织荧光定量检测结果 | 第115-116页 |
·版纳微型猪近交系STXBP6基因克隆、表达及功能预测 | 第116-120页 |
·STXBP6基因扩增结果 | 第116页 |
·STXBP6基因序列及氨基酸序列 | 第116-117页 |
·STXBP6蛋白保守结构域 | 第117页 |
·STXBP6蛋白二级结构 | 第117-118页 |
·STXBP6蛋白三级结构 | 第118页 |
·多物种STXBP6氨基酸序列比对结果 | 第118-119页 |
·STXBP6多物种系统进化树 | 第119页 |
·STXBP6基因多组织荧光定量检测结果 | 第119-120页 |
·版纳微型猪近交系RBKS基因克隆、表达及功能预测 | 第120-126页 |
·RBKS基因扩增结果 | 第120-121页 |
·RBKS基因序列及氨基酸序列 | 第121页 |
·RBKS蛋白保守结构域 | 第121-122页 |
·RBKS蛋白二级结构 | 第122页 |
·RBKS蛋白三级结构 | 第122-123页 |
·多物种RBKS氨基酸序列比对结果 | 第123-124页 |
·RBKS多物种系统进化树 | 第124-125页 |
·RBKS基因多组织荧光定量检测结果 | 第125-126页 |
·版纳微型猪近交系FAR1基因克隆、表达及功能预测 | 第126-132页 |
·FAR1基因扩增结果 | 第126页 |
·FAR1基因序列及氨基酸序列 | 第126-127页 |
·FAR1蛋白保守结构域 | 第127页 |
·FAR1蛋白二级结构 | 第127-128页 |
·FAR1蛋白三级结构 | 第128页 |
·多物种FAR1氨基酸序列比对结果 | 第128-130页 |
·FAR1多物种系统进化树 | 第130-131页 |
·FAR1基因多组织荧光定量检测结果 | 第131-132页 |
·版纳微型猪近交系CENPP基因克隆、表达及功能预测 | 第132-137页 |
·CENPP基因扩增结果 | 第132页 |
·CENPP基因序列及氨基酸序列 | 第132-133页 |
·CENPP蛋白保守结构域 | 第133页 |
·CENPP蛋白二级结构 | 第133-134页 |
·多物种CENPP氨基酸序列比对结果 | 第134-135页 |
·CENPP多物种系统进化树 | 第135-136页 |
·CENPP基因多组织荧光定量检测结果 | 第136-137页 |
4 讨论 | 第137-144页 |
·BMI种质遗传特性相关候选基因的筛选及确定 | 第137-139页 |
·基因的组织差异表达现象解析 | 第139-141页 |
·关于信号肽对蛋白质表达的影响 | 第141页 |
·关于EST拼接克隆新基因的策略 | 第141-144页 |
5 小结 | 第144-146页 |
·主要研究结果 | 第144-145页 |
·本研究的创新点 | 第145-146页 |
参考文献 | 第146-160页 |
附录 | 第160-180页 |
附录1 GenBank收录的版纳微型猪近交系GH的mRNA序列 | 第160-161页 |
附录2 GenBank收录的版纳微型猪近交系AQP3的mRNA序列 | 第161-163页 |
附录3 GenBank收录的版纳微型猪近交系VEGF的mRNA序列 | 第163-164页 |
附录4 GenBank收录的版纳微型猪近交系TNF-α的mRNA序列 | 第164-165页 |
附录5 GenBank收录的版纳微型猪近交系IFN-α的mRNA序列 | 第165-167页 |
附录6 GenBank收录的版纳微型猪近交系IL-6的mRNA序列 | 第167-168页 |
附录7 GenBank收录的版纳微型猪近交系SRY基因序列 | 第168-170页 |
附录8 GenBank收录的版纳微型猪近交系FAIM1的mRNA序列 | 第170-171页 |
附录9 GenBank收录的版纳微型猪近交系PQBP1的mRNA序列 | 第171-173页 |
附录10 GenBank收录的版纳微型猪近交系STXBP6的mRNA序列 | 第173-174页 |
附录11 GenBank收录的版纳微型猪近交系RBKS的mRNA序列 | 第174-176页 |
附录12 GenBank收录的版纳微型猪近交系FAR1的mRNA序列 | 第176-178页 |
附录13 GenBank收录的版纳微型猪近交系CENPP的mRNA序列 | 第178-180页 |
在读博士研究生期间发表学术论文 | 第180-181页 |
在读博士研究生期间主持项目 | 第181页 |
在读博士研究生期间参与项目 | 第181-182页 |
致谢 | 第182页 |