| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-15页 |
| 缩略词表 | 第15-17页 |
| 第1章 文献综述 | 第17-42页 |
| ·香菇研究概述 | 第17-19页 |
| ·生物学特性 | 第17页 |
| ·食药用功效 | 第17-18页 |
| ·遗传育种进展 | 第18-19页 |
| ·分子标记技术的类型及其在食用菌研究中的应用 | 第19-40页 |
| ·分子标记的类型 | 第20-33页 |
| ·基于分子杂交技术的分子标记 | 第20-21页 |
| ·基于PCR技术的分子标记 | 第21-30页 |
| ·限制性酶切和PCR结合的分子标记 | 第30-31页 |
| ·基于单个核苷酸多态性的DNA标记 | 第31-33页 |
| ·分子标记技术在食用菌研究中的应用 | 第33-40页 |
| ·菌株遗传多样性和亲缘关系分析 | 第33-35页 |
| ·种质资源评价及菌株鉴定 | 第35-36页 |
| ·杂交亲本选择及杂交子鉴定 | 第36-37页 |
| ·基因克隆 | 第37-38页 |
| ·遗传图谱构建和基因定位 | 第38-39页 |
| ·线粒体遗传研究 | 第39-40页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第40-42页 |
| 第2章 香菇SSR标记的开发及SSR-PCR技术体系的优化 | 第42-60页 |
| ·引言 | 第42页 |
| ·材料与方法 | 第42-50页 |
| ·试验材料 | 第42-44页 |
| ·供试香菇菌株 | 第42页 |
| ·供试培养基 | 第42-44页 |
| ·试验试剂 | 第44-45页 |
| ·贮存液 | 第44页 |
| ·DNA提取液 | 第44-45页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备试剂 | 第45页 |
| ·质粒提取试剂 | 第45页 |
| ·试验方法 | 第45-50页 |
| ·香菇基因组DNA的提取 | 第45-46页 |
| ·PCR产物纯化回收 | 第46页 |
| ·克隆与测序 | 第46-48页 |
| ·ISSR-PCR扩增 | 第48页 |
| ·ISSR-抑制PCR法开发香菇微卫星标记 | 第48-49页 |
| ·数据库法开发香菇微卫星标记 | 第49页 |
| ·SSR-PCR反应体系的建立和优化 | 第49-50页 |
| ·结果与分析 | 第50-56页 |
| ·ISSR-抑制PCR法开发SSR标记 | 第50-52页 |
| ·ISSR扩增和测序结果 | 第50-51页 |
| ·抑制PCR和SSR的分离 | 第51-52页 |
| ·数据库搜索法开发SSR标记 | 第52-53页 |
| ·SSR引物的筛选 | 第53-55页 |
| ·SSR-PCR反应体系的建立和优化 | 第55-56页 |
| ·SSR-PCR反应体系的正交优化 | 第55-56页 |
| ·退火温度优化 | 第56页 |
| ·讨论 | 第56-60页 |
| ·ISSR-抑制PCR法开发香菇SSR标记 | 第57-58页 |
| ·数据库搜索法开发香菇SSR标记 | 第58页 |
| ·SSR-PCR反应体系的建立和优化 | 第58-60页 |
| 第3章 中国香菇野生种质遗传多样性的SSR分析 | 第60-74页 |
| ·引言 | 第60-61页 |
| ·材料与方法 | 第61-68页 |
| ·供试菌株 | 第61-62页 |
| ·试验试剂 | 第62-63页 |
| ·贮存液 | 第62-63页 |
| ·染色溶液(碱性法) | 第63页 |
| ·试验方法 | 第63-68页 |
| ·香菇基因组DNA的提取 | 第63页 |
| ·SSR-PCR扩增 | 第63-64页 |
| ·PAGE凝胶电泳 | 第64页 |
| ·银染程序 | 第64-65页 |
| ·数据分析 | 第65-68页 |
| ·结果与分析 | 第68-72页 |
| ·SSR标记的多态性 | 第68-69页 |
| ·基于SSR标记的聚类分析 | 第69-70页 |
| ·基于SSR标记的主坐标分析 | 第70-72页 |
| ·讨论 | 第72-74页 |
| 第4章 中国香菇野生种质遗传多样性的TRAP分析 | 第74-91页 |
| ·引言 | 第74页 |
| ·材料和方法 | 第74-76页 |
| ·供试菌株 | 第74页 |
| ·DNA提取 | 第74页 |
| ·TRAP引物设计 | 第74-75页 |
| ·PCR反应体系优化 | 第75页 |
| ·TRAP-PCR扩增 | 第75页 |
| ·数据分析 | 第75页 |
| ·扩增条带的序列测定 | 第75-76页 |
| ·结果和分析 | 第76-86页 |
| ·TRAP-PCR体系的优化 | 第76-81页 |
| ·模板DNA浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第76-77页 |
| ·dNTPs浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第77页 |
| ·Mg2+浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第77-78页 |
| ·随机引物浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第78-80页 |
| ·固定引物浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第80页 |
| ·Taq酶浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第80-81页 |
| ·最佳TRAP-PCR反应体系 | 第81页 |
| ·TRAP标记的多态性 | 第81-82页 |
| ·基于TRAP标记的遗传相似性分析 | 第82-84页 |
| ·基于TRAP标记的聚类分析 | 第84-85页 |
| ·基于TRAP标记的主坐标分析 | 第85页 |
| ·TRAP标记真实性的验证 | 第85-86页 |
| ·讨论 | 第86-91页 |
| ·TRAP-PCR的优化 | 第86-87页 |
| ·TRAP标记技术 | 第87-89页 |
| ·中国香菇野生种质的遗传多样性 | 第89-91页 |
| 第5章 中国香菇野生种质遗传多样性的SSR和TRAP整合比较分析 | 第91-99页 |
| ·前言 | 第91页 |
| ·中国香菇野生种质遗传多样性SSR及TRAP分析间的比较 | 第91-93页 |
| ·两种标记方法间的相似点 | 第92页 |
| ·扩增结果的高多态性 | 第92页 |
| ·中国香菇自然种群的遗传关系 | 第92页 |
| ·两种标记方法间的不同点 | 第92-93页 |
| ·中国香菇野生种质遗传多样性的SSR和TRAP数据整合分析 | 第93-99页 |
| ·遗传相似性分析 | 第93页 |
| ·聚类分析 | 第93-94页 |
| ·主坐标分析 | 第94-96页 |
| ·讨论 | 第96-99页 |
| ·供试菌株的遗传关系 | 第96-97页 |
| ·各群体遗传多样性分析 | 第97-99页 |
| 第6章 中国香菇栽培种质遗传多样性的IRAP和REMAP分析 | 第99-116页 |
| ·前言 | 第99-100页 |
| ·材料和方法 | 第100-103页 |
| ·供试菌株 | 第100页 |
| ·DNA提取 | 第100页 |
| ·引物设计 | 第100-102页 |
| ·PCR反应体系优化 | 第102-103页 |
| ·IRAP-PCR扩增 | 第103页 |
| ·数据分析 | 第103页 |
| ·结果和分析 | 第103-112页 |
| ·IRAP-PCR体系的优化 | 第103-106页 |
| ·模板DNA浓度对IRAP-PCR反应结果的影响 | 第103页 |
| ·引物浓度对IRAP-PCR反应结果的影响 | 第103-104页 |
| ·dNTPs浓度对IRAP-PCR反应结果的影响 | 第104-105页 |
| ·Mg2+浓度对IRAP-PCR反应结果的影响 | 第105页 |
| ·Taq酶浓度对IRAP-PCR反应结果的影响 | 第105-106页 |
| ·退火温度优化 | 第106页 |
| ·IRAP和REMAP标记的多态性 | 第106-108页 |
| ·基于IRAP和REMAP标记的遗传相似性分析 | 第108页 |
| ·基于IRAP和REMAP标记的聚类分析 | 第108-111页 |
| ·基于IRAP和REMAP标记的主坐标分析 | 第111-112页 |
| ·讨论 | 第112-116页 |
| ·IRAP-PCR的优化 | 第112-113页 |
| ·IRAP及REMAP标记技术 | 第113-114页 |
| ·香菇栽培菌株的遗传关系 | 第114-116页 |
| 第7章 香菇栽培菌株IRAP-SCAR标记的开发 | 第116-123页 |
| ·前言 | 第116页 |
| ·材料和方法 | 第116-117页 |
| ·供试菌株 | 第116页 |
| ·特异性扩增条带的序列测定 | 第116页 |
| ·引物设计 | 第116页 |
| ·PCR扩增 | 第116-117页 |
| ·结果和分析 | 第117-121页 |
| ·特异性带选择 | 第117页 |
| ·DNA回收 | 第117页 |
| ·菌落PCR检测 | 第117-118页 |
| ·测序结果 | 第118-120页 |
| ·SCAR引物设计 | 第120-121页 |
| ·SCAR-PCR | 第121页 |
| ·讨论 | 第121-123页 |
| 全文结论 | 第123-125页 |
| 本论文主要创新点及下一步研究工作设想 | 第125-126页 |
| 参考文献 | 第126-146页 |
| 致谢 | 第146-147页 |
| 附录1 测定的12个TRAP序列 | 第147-150页 |
| 附录2 16个野生香菇菌株的IRAP聚类结果 | 第150-151页 |
| 附录3 攻读博士学位期间发表与课题相关的论文 | 第151-152页 |
