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鸢尾蛋白磷酸酶2C(PP2C)基因的克隆和功能分析及拟南芥PP2C基因家族的鉴定和基因组学分析

中文摘要第1-12页
ABSTRACT第12-15页
1 引言第15-30页
   ·蛋白磷酸酶的研究第15-25页
     ·蛋白磷酸酶的发现第15页
     ·蛋白磷酸酶的分类、结构及生化特性第15-18页
     ·植物PP2C 的生理功能第18-25页
   ·生物信息学概述第25-29页
     ·生物信息学简介第25-26页
     ·Perl 语言简介第26-27页
     ·进化树第27-28页
     ·基因家族的研究第28-29页
   ·本课题研究的目的及意义第29-30页
2 材料和方法第30-53页
   ·实验材料第30-33页
     ·植物材料第30页
     ·菌株与质粒第30页
     ·酶与各种生化试剂第30页
     ·PCR 引物第30-31页
     ·软件及网络资源第31-33页
   ·实验方法第33-51页
     ·植物总RNA 的提取及检测第33-35页
     ·反转录cDNA 第一链的合成第35-36页
     ·cDNA 回收纯化第36页
     ·cDNA 的5′加尾反应第36-37页
     ·cDNA 全长序列的获得第37-39页
     ·目的片段的回收第39-40页
     ·目的片段与克隆载体的连接第40页
     ·大肠杆菌感受态细胞制备及转化第40-41页
     ·质粒DNA 的提取第41-42页
     ·对重组质粒的酶切鉴定第42-43页
     ·Northern 杂交第43-44页
     ·Southern 杂交第44-46页
     ·正义表达载体的构建第46-47页
     ·农杆菌感受态细胞的制备和转化第47-48页
     ·拟南芥的无土栽培、转化及分析第48-51页
     ·野生型与转基因拟南芥植株在培养基上萌发及生长情况第51页
   ·拟南芥PP2C 基因家族鉴定及基因组学分析第51-53页
     ·Clustal 的使用第51-52页
     ·Mega4.0 构建系统发生树的方法第52页
     ·本地BLAST 方法第52-53页
3 结果与分析第53-74页
   ·鸢尾蛋白磷酸酶 2C(IrisPP2C1)基因的分离第53-56页
     ·鸢尾花RNA 的提取及反转录第53页
     ·IrisPP2C1 中间片段的分离第53-54页
     ·IrisPP2C1 5′片段的分离第54-55页
     ·IrisPP2C1 3′片段的分离第55页
     ·IrisPP2C1 全长cDNA 的分离第55-56页
   ·IrisPP2C1 序列的分析第56-59页
     ·IrisPP2C1 全长cDNA 分析第56页
     ·IrisPP2C1 编码蛋白序列的分析第56-58页
     ·IrisPP2C1 预测蛋白的跨膜结构分析第58-59页
   ·鸢尾 IrisPP2C1 基因的表达分析第59-60页
     ·IrisPP2C1 基因的Southern 杂交分析第59-60页
     ·IrisPP2C1 对ABA 信号的响应第60页
   ·IrisPP2C1 蛋白的亚细胞定位研究第60-62页
   ·转基因拟南芥植株的获得及表型观察第62-64页
     ·正义表达载体的构建第62页
     ·T_1 代转基因植株的鉴定第62-63页
     ·转基因植株的形态学变化第63-64页
   ·转基因拟南芥在种子萌发和根生长过程中对ABA 的响应第64-65页
     ·种子萌发率的检测第64-65页
     ·根的生长测定第65页
   ·拟南芥中PP2C 家族的成员鉴定及基因组学分析第65-74页
     ·拟南芥PP2C 基因的鉴定第65-68页
     ·拟南芥PP2C 基因家族进化树分析第68-69页
     ·拟南芥PP2C 蛋白质元件的分布第69页
     ·PP2C 基因在染色体上的定位和复制分析第69-74页
4 讨论第74-77页
   ·鸢尾 IrisPP2C1 基因及其同源基因之间的序列分析第74页
   ·鸢尾 IrisPP2C1 基因的表达和调控第74页
   ·鸢尾 IrisPP2C1 基因可能的信号转导机制第74-75页
   ·PP2C 家族是拟南芥中的一大类基因家族第75-76页
   ·利用 Perl 语言鉴定基因家族的各个成员第76-77页
5 结论第77-78页
参考文献第78-85页
致谢第85-86页
攻读学位期间发表的学术论文第86页

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