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兔疥螨虫株的分子分类及其疫苗研究

中文摘要第1-6页
英文摘要第6-18页
第一部分 文献综述第18-44页
 一 疥螨与疥螨病研究进展第18-30页
  1 病原形态与分类第18-19页
   ·病原形态第18页
   ·分类第18-19页
  2 生物学特性第19-20页
   ·生活史第19-20页
   ·生活习性第20页
  3 流行病学第20-21页
   ·宿主第20-21页
   ·感染与流行第21页
   ·疥螨病流行的促进因素第21页
  4 临床症状第21-22页
  5 病理学变化第22-23页
   ·组织病理学变化第22页
   ·血液病理学变化第22-23页
  6 致病过程及机理第23-24页
  7 免疫学第24-26页
   ·抗原研究第24-25页
   ·疥螨引起的免疫应答第25-26页
  8 疥螨的分子生物学第26-28页
   ·疥螨的遗传学研究第26-27页
   ·疥螨cDNA文库的构建第27页
   ·疥螨表达序列标签(EST)分析第27-28页
  9 诊断第28-29页
   ·病原学诊断第28页
   ·免疫学诊断第28-29页
     ·血凝抑制实验第28页
     ·酶联免疫吸附试验(ELISA)第28-29页
     ·聚合酶链反应(PCR)第29页
  10 治疗第29-30页
  11 展望第30页
 二 寄生虫核酸疫苗研究进展第30-43页
  1 原虫核酸疫苗第30-37页
   ·疟疾第31-32页
   ·利什曼原虫病(Leishmaniosis)第32页
   ·隐孢子虫病(Cryptosporidiosis)第32-33页
   ·弓形虫病(Toxoplasmosis)第33-36页
   ·球虫病(Coccidiosis)第36-37页
   ·泰勒虫病第37页
  2 蠕虫核酸疫苗第37-42页
   ·血吸虫病(Schistosomiosis)第37-40页
     ·脂肪酸结合蛋白(FABP)第37-39页
     ·代谢酶类基因片段第39-40页
   ·囊尾蚴病(Cysticercosis)第40-41页
   ·旋毛虫病(Trichinellosis)第41-42页
   ·捻转血矛线虫病第42页
  3 节肢昆虫核酸疫苗第42页
  4 寄生虫核酸疫苗的展望第42-43页
 三 本研究的目的和意义第43-44页
第二部分 研究内容第44-139页
 第一章 基于线粒体细胞色素氧化酶I(COI)序列的兔和猪四个疥螨分离株的系统发育关系分析第44-59页
  引言第44-45页
  1 材料和方法第45-48页
   ·材料第45页
     ·载体、工具酶和主要试剂第45页
     ·主要仪器设备第45页
     ·培养基及常用液体的配制第45页
   ·试验方法第45-48页
     ·疥螨虫体的采集第45-46页
     ·疥螨虫体基因组DNA的提取第46页
     ·引物的设计第46-47页
     ·PCR的反应体系和条件第47页
     ·PCR产物的纯化第47页
     ·序列分析与系统树的建立第47-48页
  2 结果与分析第48-51页
   ·4个疥螨分离株COI基因序列变异及组成第48-51页
   ·疥螨分离株的COI基因序列同源性分析第51页
   ·基于疥螨COI基因构建分子系统树第51页
  3 讨论第51-57页
   ·DNA提取第51-54页
   ·线粒体细胞色素氧化酶I(COI)基因的选择第54页
   ·基因序列组成特征第54-55页
   ·密码子不同位点碱基组成特征第55页
   ·氨基酸组成和密码子使用特征第55页
   ·疥螨属内的系统发生关系研究第55-57页
     ·目前采用传统分类方法对疥螨属内的种级分类尚存一定争议第55-56页
     ·分子标记基因已广泛应用于疥螨属内螨虫的分类学研究中第56-57页
     ·在分子系统学研究中,物种分类地位的确定依据第57页
  4 小结第57-59页
 第二章 兔疥螨副肌球蛋白基因的扩增及序列分析第59-78页
  引言第59页
  1 材料和方法第59-63页
   ·材料第59-60页
     ·兔疥螨虫株来源第59-60页
     ·载体、菌株、工具酶和主要试剂第60页
     ·主要仪器设备第60页
     ·培养基及常用液体的配制第60页
   ·试验方法第60-63页
     ·兔疥螨总RNA的提取第60-61页
     ·引物设计及合成第61页
     ·RT-PCR扩增体系与反应条件第61-62页
     ·PCR产物回收与连接第62页
     ·转化第62页
     ·重组质粒DNA的小量制备第62-63页
     ·重组质粒的PCR鉴定和酶切鉴定第63页
     ·兔疥螨副肌球蛋白基因的生物信息学预测第63页
  2 结果第63-75页
   ·兔疥螨副肌球蛋白基因的RT-PCR扩增与重组质粒pMD18-T-Pmy鉴定第63-65页
   ·副肌球蛋白基因的序列测定、碱基组成及同源性分析第65-68页
     ·疥螨虫株副肌球蛋白全基因的碱基组成分析第65-68页
     ·GenBank中报道的螨类副肌球蛋白基因及推导的氨基酸同源性分析第68页
     ·副肌球蛋白基因的系统树构建第68页
   ·兔疥螨副肌球蛋白的生物信息学分析第68-75页
     ·副肌球蛋白基因密码子偏向性分析第68-70页
     ·兔疥螨副肌球蛋白的氨基酸分析第70-71页
     ·兔疥螨副肌球蛋白的二级结构预测分析第71-72页
     ·兔疥螨副肌球蛋白的疏水性预测第72页
     ·兔疥螨副肌球蛋白的跨膜区分析第72-73页
     ·兔疥螨副肌球蛋白的糖基化位点预测第73-74页
     ·兔疥螨副肌球蛋白的信号肽位点预测第74-75页
  3 讨论第75-77页
   ·兔疥螨虫株副肌球蛋白密码子偏向性分析第75页
   ·GenBank中登录的疥螨虫株副肌球蛋白基因间的比较第75-76页
   ·基于副肌球蛋白基因进行各物种系统发育关系分析第76-77页
   ·兔疥螨副肌球蛋白基因的特性第77页
  4 小结第77-78页
 第三章 兔疥螨副肌球蛋白基因的原核和真核表达第78-99页
  引言第78-79页
  1 材料和方法第79-87页
   ·材料第79-80页
     ·菌株与质粒第79页
     ·工具酶和主要试剂第79页
     ·主要仪器设备第79页
     ·培养基和常用溶液的配制第79-80页
   ·试验方法第80-87页
     ·pET32a-Pmy原核表达载体的构建及表达第80-85页
     ·pVAX1-Pmy重组真核表达载体的构建及表达第85-87页
  2 结果第87-93页
   ·pET32a-Pmy在大肠杆菌中的原核表达第87-91页
     ·pET32a-Pmy的PCR鉴定和酶切鉴定第87页
     ·重组pET32a-Pmy表达质粒的诱导表达第87-88页
     ·重组质粒表达条件的优化第88-90页
     ·融合蛋白表达产物Western-Blotting检测第90-91页
   ·Pmy-pVAX1在COS-7细胞中的真核表达第91-93页
     ·真核表达载体pVAX1-Pmy的PCR和酶切鉴定第91页
     ·脂质体转染和RT-PCR检测基因转录第91-92页
     ·间接免疫荧光检测结果第92-93页
  3 讨论第93-98页
   ·副肌球蛋白的分布和特征第93页
   ·原核表达系统第93-96页
     ·原核表达载体的选择第93-94页
     ·原核表达条件的优化第94-95页
     ·目的蛋白在大肠杆菌中的表达形式第95-96页
     ·包涵体的纯化及目的蛋白的回收第96页
   ·真核表达系统第96-98页
     ·pVAX1特性第96-97页
     ·关于转染的影响因素第97页
     ·转染细胞的选择第97-98页
     ·目的抗原的检测第98页
  4 小结第98-99页
 第四章 pVAX1-Pmy真核质粒在小鼠体内的动态分布和安全性研究第99-109页
  引言第99页
  1 材料和方法第99-103页
   ·材料第99-100页
     ·试验动物第99页
     ·菌株和质粒第99页
     ·主要试剂第99-100页
     ·主要仪器设备第100页
     ·常用液体配制第100页
   ·试验方法第100-103页
     ·Pmy-pVAX1质粒的大量制备及纯化第100-102页
     ·核酸疫苗在小鼠体内的动态分布第102-103页
  2 结果第103-106页
   ·Pmy-pVAX1质粒在小鼠体内的动态分布第103-105页
   ·质粒的安全性检测结果第105-106页
  3 讨论第106-107页
   ·DNA疫苗的分布第106-107页
   ·DNA疫苗的安全性第107页
  4 小结第107-109页
 第五章 兔γ-干扰素(γ-IFN)、白细胞介素-2(IL-2)和白细胞介素-4(IL-4)真核表达质粒的构建第109-114页
  引言第109页
  1 材料和方法第109-111页
   ·材料第109-110页
     ·载体、质粒和菌株第109页
     ·工具酶和主要试剂第109页
     ·主要仪器设备第109-110页
     ·培养基及常用液体的配制第110页
   ·试验方法第110-111页
     ·双酶切反应第110页
     ·酶切产物与载体的连接第110页
     ·转化感受态细胞第110页
     ·重组质粒的提取第110-111页
     ·重组质粒的酶切鉴定第111页
  2 结果第111-112页
   ·兔IL-2、IL-4和γ-IFN基因片段的获取第111页
   ·pVAX1-IL-2、pVAX1-IL-4和pVAX1-IFN-γ酶切鉴定结果第111-112页
  3 讨论第112-113页
   ·构建三种细胞因子真核表达载体的意义第112-113页
   ·兔IL-2、IL-4和γ-IFN基因的获得第113页
  4 小结第113-114页
 第六章 副肌球蛋白核酸疫苗及蛋白疫苗的小鼠免疫研究第114-139页
  引言第115页
  1 材料与方法第115-120页
   ·材料第116-117页
     ·实验动物第116页
     ·质粒、菌株和细胞第116页
     ·工具酶和主要试剂第116页
     ·主要仪器设备第116页
     ·培养基及常用液体的配制第116-117页
   ·方法第117-120页
     ·核酸疫苗和蛋白疫苗的准备第117页
     ·小鼠的免疫第117-118页
     ·样品的采集第118页
     ·基因免疫小鼠体液免疫水平的检测第118页
     ·基因免疫小鼠细胞免疫水平的检测第118-120页
  2 结果第120-132页
   ·免疫前后小鼠血清抗体的ELISA检测结果第120-125页
     ·小鼠血清中IgG的检测结果第120-122页
     ·小鼠血清中IgG1的检测结果第122页
     ·小鼠血清中IgG2a的检测结果第122-125页
     ·小鼠血清中IgE的检测结果第125页
     ·小鼠血清中IgM的检测结果第125页
   ·小鼠的淋巴细胞转化检测结果第125-129页
   ·小鼠脾细胞悬液分泌的细胞因子检测结果第129-131页
     ·IL-2、IL-4、IL-5及γ-IFN标准曲线的绘制第129页
     ·细胞因子检测结果第129-131页
   ·小鼠外周血CD4~+、CD8~+T细胞数量的检测结果第131-132页
  3 讨论第132-137页
   ·关于DAN疫苗的免疫途径第132页
   ·关于基因疫苗诱导机体产生特异性免疫的机制第132-133页
   ·宿主感染疥螨后的免疫应答特征第133-134页
   ·核酸疫苗和蛋白疫苗的免疫效果第134-137页
     ·抗体的检测第135-136页
     ·淋巴细胞增殖能力的检测第136页
     ·细胞因子的检测第136-137页
     ·流式检测结果第137页
  4 小结第137-139页
第三部分 结论第139-141页
参考文献第141-152页
致谢第152-153页
攻读学位期间发表的学术论文第153页

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