| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-15页 |
| 1 绪论 | 第15-39页 |
| ·课题背景和研究目的 | 第15-22页 |
| ·文献综述 | 第22-39页 |
| ·动物肠道微生物研究进展 | 第22-28页 |
| ·动物线粒体基因组研究进展 | 第28-33页 |
| ·动物分子系统发育研究进展 | 第33-36页 |
| ·野生哺乳动物线粒体基因组和系统发育研究概况 | 第36-39页 |
| 2 狼肠道菌群16S rRNA基因序列分析和多样性研究 | 第39-57页 |
| ·前言 | 第39-40页 |
| ·材料和方法 | 第40-44页 |
| ·实验动物和样品采集 | 第40页 |
| ·样品处理和粪便基因组DNA提取 | 第40-41页 |
| ·16S rRNA基因的PCR扩增及产物纯化 | 第41-42页 |
| ·PCR产物的连接和转化 | 第42页 |
| ·阳性克隆的筛选和测序 | 第42-43页 |
| ·序列分析 | 第43页 |
| ·库容检测 | 第43-44页 |
| ·结果 | 第44-52页 |
| ·16S rRNA克隆文库分析和多样性检测 | 第44-45页 |
| ·狼粪便微生物种类和多样性 | 第45-52页 |
| ·讨论 | 第52-55页 |
| ·本章小结 | 第55-57页 |
| 3 蒙古狼线粒体基因组全序列及其系统发育地位 | 第57-71页 |
| ·前言 | 第57页 |
| ·材料和方法 | 第57-62页 |
| ·实验动物和样品采集 | 第57页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第57-58页 |
| ·引物设计、Long-PCR和Sub-PCR扩增 | 第58-60页 |
| ·克隆及测序 | 第60-61页 |
| ·序列分析 | 第61页 |
| ·系统发育分析 | 第61-62页 |
| ·结果 | 第62-68页 |
| ·蒙古狼线粒体基因组组成结构 | 第62-66页 |
| ·系统发育分析 | 第66-68页 |
| ·讨论 | 第68-70页 |
| ·本章小结 | 第70-71页 |
| 4 豺、貉线粒体基因组全序列基因组成和结构分析 | 第71-83页 |
| ·前言 | 第71-72页 |
| ·豺生物学研究现状简述 | 第71页 |
| ·貉生物学研究现状简述 | 第71-72页 |
| ·本章研究目标 | 第72页 |
| ·材料和方法 | 第72-74页 |
| ·实验动物 | 第72页 |
| ·样品采集、基因组DNA提取 | 第72-73页 |
| ·PCR扩增、克隆和测序 | 第73-74页 |
| ·序列分析和基因组比较 | 第74页 |
| ·结果 | 第74-81页 |
| ·豺、貉线粒体基因组组成和结构 | 第74-75页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第75页 |
| ·rRNA基因和tRNA基因 | 第75-80页 |
| ·非编码区 | 第80-81页 |
| ·讨论 | 第81-82页 |
| ·本章小结 | 第82-83页 |
| 5 犬科线粒体基因组比较和系统发育分析 | 第83-104页 |
| ·前言 | 第83-84页 |
| ·材料和方法 | 第84-87页 |
| ·碱基替代率分析和分歧时间估算 | 第84-85页 |
| ·线粒体基因组控制区分析 | 第85页 |
| ·犬型亚目系统发育分析 | 第85-87页 |
| ·结果 | 第87-99页 |
| ·犬科动物线粒体基因组基因组成和结构特征 | 第87-89页 |
| ·犬科动物线粒体基因组控制区比较 | 第89-91页 |
| ·犬科动物线粒体基因组碱基替代率和分歧时间 | 第91-95页 |
| ·犬型亚目系统发育 | 第95-99页 |
| ·讨论 | 第99-102页 |
| ·本章小结 | 第102-104页 |
| 结论 | 第104-105页 |
| 参考文献 | 第105-134页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第134-135页 |
| 致谢 | 第135-137页 |