基因调控网络的建模及其结构分解方法研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-14页 |
| ·课题背景 | 第8-10页 |
| ·生物信息学 | 第8-9页 |
| ·基因调控网络 | 第9-10页 |
| ·国内外相关领域的研究现状 | 第10-12页 |
| ·国外研究概况和最新进展报告 | 第10-11页 |
| ·国内研究现状 | 第11-12页 |
| ·主要研究内容及创新意义 | 第12-14页 |
| ·主要研究内容 | 第12-13页 |
| ·创新意义和研究价值 | 第13-14页 |
| 第二章 生物信息学与基因调控网络模型 | 第14-30页 |
| ·生物信息学研究背景 | 第14-15页 |
| ·什么是生物信息学 | 第14-15页 |
| ·生物信息学研究内容与发展 | 第15-18页 |
| ·研究现状和发展趋势 | 第16-18页 |
| ·相关研究内容 | 第18页 |
| ·基因调控网络 | 第18-29页 |
| ·研究背景 | 第18-20页 |
| ·相关研究内容 | 第20-21页 |
| ·建模的思路和方法 | 第21-24页 |
| ·基因调控网络的模型 | 第24-28页 |
| ·应用及展望 | 第28-29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第三章 布尔网络与概率布尔型基因调控网络 | 第30-42页 |
| ·布尔型基因调控网络的提出与结构 | 第30-36页 |
| ·布尔基因网络的提出 | 第30页 |
| ·布尔基因网络 | 第30-36页 |
| ·布尔基因网络的小世界拓扑特性 | 第36-41页 |
| ·小世界网络 | 第36-39页 |
| ·小世界布尔基因网络 | 第39-41页 |
| ·本章小结 | 第41-42页 |
| 第四章 基因调控网络的结构分析 | 第42-68页 |
| ·概率布尔型基因调控网络的提出 | 第42-47页 |
| ·为什么要概率化 | 第42-43页 |
| ·概率布尔网络的结构定义和反应规则的描述 | 第43-47页 |
| ·概率布尔型基因调控网络的构建 | 第47-56页 |
| ·网络构建方法的描述 | 第47-48页 |
| ·通过交互信息最小化进行基因聚类 | 第48-56页 |
| ·PBN 的结构分析 | 第56-65页 |
| ·模块化讨论 | 第65-67页 |
| ·本章小结 | 第67-68页 |
| 第五章 模糊概率基因调控网络的建模 | 第68-76页 |
| ·模糊化基因调控网络建模的发展和研究意义 | 第68-69页 |
| ·模糊概率布尔网络 | 第69-75页 |
| ·为什么要模糊化 | 第69-70页 |
| ·模糊概率布尔网络 | 第70-75页 |
| ·本章小结 | 第75-76页 |
| 第六章 时序基因表达数据的动态模糊聚类 | 第76-88页 |
| ·研究背景 | 第76-77页 |
| ·动态模糊聚类 | 第76-77页 |
| ·时序基因表达数据 | 第77页 |
| ·动态模糊聚类算法 | 第77-82页 |
| ·模糊聚类算法(FCM) | 第77-78页 |
| ·AR 模型 | 第78-79页 |
| ·动态模糊聚类算法 | 第79-81页 |
| ·精确度评价算法 | 第81-82页 |
| ·实验结果和分析 | 第82-87页 |
| ·仿真数据和真实数据 | 第82-85页 |
| 1 仿真数据 | 第82-83页 |
| 2 真实数据 | 第83-85页 |
| ·实验结果与分析 | 第85-87页 |
| 1 人工数据实验 | 第85页 |
| 2 真实数据实验 | 第85-87页 |
| ·本章小结 | 第87-88页 |
| 第七章 总结和展望 | 第88-90页 |
| 博士学位论文的主要创新点 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-103页 |
| 附录：作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第103页 |
