| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-26页 |
| ·研究背景 | 第10-21页 |
| ·概述 | 第10-11页 |
| ·复杂生物网络可视化研究现状 | 第11-21页 |
| ·本论文的主要研究内容 | 第21-26页 |
| ·可视化研究中存在的问题及对策 | 第21-22页 |
| ·本论文的主要研究内容 | 第22-23页 |
| ·图形和页码对照表 | 第23-26页 |
| 第二章 一种新的快速网格布局算法 | 第26-44页 |
| ·已有的网格布局算法分析 | 第26-29页 |
| ·Li & Kurata 的工作 | 第26-27页 |
| ·Miyano 小组的工作 | 第27-29页 |
| ·Barsky 的工作 | 第29页 |
| ·目标函数及优化策略 | 第29-35页 |
| ·算法参数讨论 | 第35-40页 |
| ·算法时间复杂度 | 第40-41页 |
| ·与其他相关算法比较 | 第41-43页 |
| ·本章小结 | 第43-44页 |
| 第三章 复杂生物网络可视化系统——LucidDraw | 第44-68页 |
| ·LucidDraw 系统功能结构 | 第44-49页 |
| ·功能结构图 | 第44-46页 |
| ·其他系统架构分析 | 第46-49页 |
| ·功能和实现I ——MATLAB GUI | 第49-59页 |
| ·构建复杂生物网络 | 第50-54页 |
| ·实现算法参数控制 | 第54-59页 |
| ·功能和实现II ——LucidDraw GUI | 第59-67页 |
| ·LucidDraw GUI 功能按钮 | 第59-61页 |
| ·实现三种节点标签 | 第61-67页 |
| ·本章小结 | 第67-68页 |
| 第四章 LucidDraw 系统的可视化及其应用 | 第68-78页 |
| ·LucidDraw 可视化效果分析 | 第68-74页 |
| ·LucidDraw 应用研究 | 第74-77页 |
| ·本章小结 | 第77-78页 |
| 第五章 结论及进一步研究方向 | 第78-81页 |
| ·全文的主要结论 | 第78页 |
| ·进一步研究方向 | 第78-79页 |
| ·本文主要的创新点 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-87页 |
| 附录一 LucidDraw 操作指南 | 第87-91页 |
| 附录二 作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第91-92页 |
| 致谢 | 第92页 |