基于转录组分析探讨杂交加倍事件对水稻可变剪接的影响
| 中文摘要 | 第3-4页 |
| 英文摘要 | 第4-8页 |
| 引言 | 第8-18页 |
| 1 杂交及杂种优势 | 第8-11页 |
| 1.1 杂种优势的重要性 | 第8-9页 |
| 1.2 杂种优势的结果及机理 | 第9-11页 |
| 2 多倍化及其后果 | 第11-14页 |
| 2.1 多倍体 | 第11页 |
| 2.2 多倍体基因表达的影响 | 第11-12页 |
| 2.3 多倍体转录组分析 | 第12-14页 |
| 3 可变剪接 | 第14-16页 |
| 3.1 可变剪接的功能 | 第14页 |
| 3.2 可变剪接的普遍性和演化 | 第14-15页 |
| 3.3 高通量测序及可变剪接 | 第15页 |
| 3.4 可变剪接的调控 | 第15页 |
| 3.5 杂交中发生的可变剪接 | 第15-16页 |
| 4 杂种和多倍体中可变剪接的研究进展 | 第16-17页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第17-18页 |
| 5.1 研究目标 | 第17页 |
| 5.2 研究意义 | 第17-18页 |
| 材料与方法 | 第18-22页 |
| 1 实验材料 | 第18页 |
| 2 实验方法 | 第18-22页 |
| 2.1 实验材料的获取 | 第18页 |
| 2.2 RNA的提取 | 第18-19页 |
| 2.3 数据来源和数据分析 | 第19-22页 |
| 2.3.1 数据来源 | 第19页 |
| 2.3.2 数据预处理 | 第19页 |
| 2.3.3 回帖 | 第19-20页 |
| 2.3.4 重新注释参考基因组 | 第20页 |
| 2.3.5 报告剪接事件 | 第20页 |
| 2.3.6 量化剪接事件 | 第20-21页 |
| 2.3.7 基因功能分析 | 第21页 |
| 2.3.8 统计学分析 | 第21-22页 |
| 结果与分析 | 第22-39页 |
| 1 转录组数据信息 | 第22-23页 |
| 2 可变剪接事件数目 | 第23-25页 |
| 3 杂交种的差异剪接基因 | 第25-30页 |
| 3.1 杂交种的差异剪接基因数目 | 第25-26页 |
| 3.2 差异剪接基因的生物学功能 | 第26页 |
| 3.3 剪接变化的类型 | 第26-30页 |
| 4 多倍体的差异剪接基因 | 第30-36页 |
| 4.1 四倍体水稻纯合度 | 第30-31页 |
| 4.2 多倍体中与亲本的剪接方式的比较 | 第31-34页 |
| 4.3 差异剪接基因的生物学功能 | 第34-36页 |
| 5 新出现或丢失的可变剪接事件 | 第36-37页 |
| 6 组织特异的可变剪接事件 | 第37-39页 |
| 6.1 组织特异的可变剪接事件数量 | 第37-38页 |
| 6.2 组织特异的可变剪接事件的生物学功能 | 第38-39页 |
| 讨论 | 第39-43页 |
| 结论 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-49页 |
| 附表 | 第49-51页 |
| 致谢 | 第51页 |
