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地衣芽孢杆菌T-1群体感应淬灭基因ytnP的克隆表达及其功能研究

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-9页
第一章 引言第14-26页
    1.1 细菌的群体感应系统第14-17页
        1.1.1 革兰氏阴性菌的LuxI/LuxR系统第14-15页
        1.1.2 革兰氏阳性菌的双组分群体感应系统第15-16页
        1.1.3 LuxS/AI-2依赖的群体感应系统第16页
        1.1.4 其他的QS系统第16页
        1.1.5 群体感应与病原菌致病性第16-17页
    1.2 嗜水气单胞菌的群体感应系统第17-20页
        1.2.1 嗜水气单胞菌简介第17-18页
        1.2.2 嗜水气单胞菌的群体感应系统第18-19页
        1.2.3 嗜水气单胞菌的毒力因子第19-20页
        1.2.4 嗜水气单胞菌的生物被膜第20页
    1.3 群体感应淬灭酶第20-25页
        1.3.1 群体感应淬灭第20-21页
        1.3.2 AHL内酯酶第21-24页
        1.3.3 AHLs酰化酶第24-25页
        1.3.4 AHLs氧化还原酶第25页
    1.4 本研究的目的和意义第25-26页
第二章 地衣芽孢杆菌(B.licheniformis)T-1的ytnP基因全长的克隆及分析第26-38页
    2.1 实验材料第26-27页
        2.1.1 菌株与质粒第26-27页
        2.1.2 试剂与工具酶第27页
        2.1.3 缓冲液和培养基第27页
        2.1.4 引物合成第27页
        2.1.5 主要实验仪器第27页
    2.2 实验方法第27-30页
        2.2.1 地衣芽孢杆菌T-1基因组的提取第27-28页
        2.2.2 ytnP扩增引物的设计第28页
        2.2.3 ytnP的全长克隆第28-29页
        2.2.4 ytnP序列的生物信息学分析第29-30页
    2.3 结果与分析第30-36页
        2.3.1 地衣芽孢杆菌T-1基因组提取第30页
        2.3.2 地衣芽孢杆菌T-1ytnP基因的全长克隆第30-31页
        2.3.3 ytnP序列的生物信息学分析第31-36页
    2.4 讨论第36-38页
第三章 ytnP的原核表达,纯化与酶活测定第38-58页
    3.1 实验材料第38-41页
        3.1.1 菌株与质粒第38页
        3.1.2 实验试剂第38-39页
        3.1.3 溶液配置第39-40页
        3.1.4 引物合成第40页
        3.1.5 主要实验仪器第40-41页
    3.2 实验方法第41-47页
        3.2.1 大肠杆菌表达载体pEASY-BluntE1-ytnP的构建第41-42页
        3.2.2 ytnP在大肠杆菌中的表达与检测第42-44页
        3.2.3 重组酶YtnP的纯化第44-45页
        3.2.4 重组酶YtnP的透析复性第45-46页
        3.2.5 BCA蛋白定量测定蛋白浓度第46页
        3.2.6 YtnP活性测定第46-47页
        3.2.7 Ytnp的酶活测定第47页
    3.3 结果与分析第47-56页
        3.3.1 高保真酶克隆ytnP第47-49页
        3.3.2 重组酶YtnP在大肠杆菌中的表达鉴定第49-51页
        3.3.3 YtnP的纯化第51-53页
        3.3.4 YtnP的透析复性第53-54页
        3.3.5 BCA测定蛋白浓度第54页
        3.3.6 YtnP酶活测定第54-56页
    3.4 讨论第56-58页
第四章 YtnP对嗜水气单胞菌生物膜的影响第58-68页
    4.1 实验材料第58-59页
        4.1.1 菌株第58-59页
        4.1.2 主要试剂第59页
        4.1.3 培养基第59页
        4.1.4 仪器设备第59页
    4.2 实验方法第59-61页
        4.2.1 YtnP的制备第59页
        4.2.2 嗜水气单胞菌初始浓度对生物膜形成的影响第59-60页
        4.2.3 YtnP对嗜水气单胞菌生物膜的抑制作用第60页
        4.2.4 4种抗生素对嗜水气单胞菌最小抑菌浓度(Minimal Inhibit Concentration,MIC)的测定第60页
        4.2.5 YtnP和抗生素协同作用对嗜水气单胞菌MIC的影响第60页
        4.2.6 数据处理第60-61页
    4.3 结果与分析第61-66页
        4.3.1 不同浓度的嗜水气单胞菌对其生物膜形成的影响第61页
        4.3.2 YtnP对嗜水气单胞菌生物膜的抑制作用第61-63页
        4.3.3 4种抗生素对嗜水气单胞菌的MIC测定结果第63页
        4.3.4 YtnP与抗生素的协同作用对嗜水气单胞菌MIC的影响第63-66页
    4.4 讨论第66-68页
第五章 YtnP对嗜水气单胞菌毒力因子表达调控研究第68-83页
    5.1 材料与方法第68-69页
        5.1.1 实验菌株和实验用鱼第68-69页
        5.1.2 主要试剂第69页
        5.1.3 溶液第69页
        5.1.4 主要仪器第69页
    5.2 实验方法第69-73页
        5.2.1 细菌生长曲线绘制第69-70页
        5.2.2 细菌RNA的提取第70页
        5.2.3 细菌RNA质量的检测第70页
        5.2.4 细菌RNA的反转录第70-71页
        5.2.5 荧光定量PCR检测毒力基因表达第71-72页
        5.2.6 溶血活性测定第72页
        5.2.7 YtnP对异育银鲫(C.auratusgibelio)的保护实验第72-73页
        5.2.8 数据分析第73页
    5.3 结果与分析第73-80页
        5.3.1 嗜水气单胞菌生长曲线第73-74页
        5.3.2 荧光定量引物验证第74页
        5.3.3 添加YtnP对嗜水气单胞菌毒力基因表达量的影响第74-78页
        5.3.4 溶血活性测定第78-79页
        5.3.5 重组酶YtnP对异育银鲫的保护实验第79-80页
    5.4 讨论第80-83页
全文总结第83页
展望第83-84页
参考文献第84-91页
致谢第91页

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