| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 缩略词表 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第10-15页 |
| 1.1 柑橘砧穗间相互影响及作用 | 第10-12页 |
| 1.1.1 柑橘砧木对接穗生理生化特性的影响 | 第10-11页 |
| 1.1.2 柑橘接穗对砧木生理生化特性的影响 | 第11页 |
| 1.1.3 柑橘接穗与砧木之间相互作用的机制 | 第11-12页 |
| 1.2 砧穗间普遍存在mRNA交流现象 | 第12-14页 |
| 1.2.1 mRNA远距离运输对接穗/砧木发育的影响 | 第12-13页 |
| 1.2.2 mRNA远距离运输对接穗/砧木开花的影响 | 第13-14页 |
| 1.2.3 mRNA远距离运输对接穗/砧木胁迫反应的影响 | 第14页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第14-15页 |
| 2 材料与方法 | 第15-27页 |
| 2.1 实验材料 | 第15-16页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第15页 |
| 2.1.2 数据 | 第15-16页 |
| 2.1.3 试剂盒、酶与载体 | 第16页 |
| 2.2 实验方法 | 第16-27页 |
| 2.2.1 枳参考基因的组装及注释 | 第16-17页 |
| 2.2.2 初步筛选柑橘砧穗间交流mRNA的生物信息学方法 | 第17-19页 |
| 2.2.2.1 SNP分析 | 第17-18页 |
| 2.2.2.2 通过转录组分析筛选柑橘砧穗间交流mRNA | 第18页 |
| 2.2.2.3 通过基因组分析筛选柑橘砧穗间交流mRNA | 第18-19页 |
| 2.2.3 柑橘砧穗间交流mRNA的实验验证方法 | 第19-25页 |
| 2.2.3.1 植物RNA提取 | 第19-20页 |
| 2.2.3.2 RNA中gDNA去除及反转录 | 第20-21页 |
| 2.2.3.3 基因克隆与测序 | 第21-23页 |
| 2.2.3.4 SNP-dCAPS标记方法 | 第23-24页 |
| 2.2.3.5 SNP-RT-PCR多重验证方法 | 第24页 |
| 2.2.3.6 PCR产物建库测序方法 | 第24-25页 |
| 2.2.4 超表达分析方法 | 第25-27页 |
| 2.2.4.1 超表达分析载体的构建 | 第25-26页 |
| 2.2.4.2 拟南芥的转化 | 第26-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-45页 |
| 3.1 红夏橙与枳特征性SNP的筛选 | 第27-28页 |
| 3.2 柑橘砧穗间交流mRNA的初步筛选 | 第28-35页 |
| 3.2.1 基于比较转录组分析筛选柑橘砧穗间交流mRNA | 第28-34页 |
| 3.2.2 基于比较基因组分析筛选柑橘砧穗间交流mRNA | 第34-35页 |
| 3.3 柑橘砧穗交流mRNA的实验验证 | 第35-42页 |
| 3.3.1 基于转录组比较分析筛选的候选mRNA的验证 | 第35-42页 |
| 3.3.1.1 SNP-dCAPS标记鉴定 | 第35-36页 |
| 3.3.1.2 SNP-RT-PCR多重验证 | 第36-39页 |
| 3.3.1.3 PCR产物建库测序分析 | 第39-42页 |
| 3.3.2 基于基因组比较分析筛选的候选mRNA的验证 | 第42页 |
| 3.4 可交流mRNA的生物信息学分析 | 第42-43页 |
| 3.5 可交流mRNA的超表达分析 | 第43-45页 |
| 4 讨论 | 第45-48页 |
| 4.1 柑橘砧穗交流mRNA的挖掘 | 第45页 |
| 4.2 柑橘砧穗交流mRNA鉴定方法的可靠性 | 第45-46页 |
| 4.3 柑橘砧穗交流mRNA的功能初探 | 第46-47页 |
| 4.4 未来工作展望 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-53页 |
| 附录一 ：数据分析 | 第53-56页 |
| 附录二 ：引物序列 | 第56-65页 |
| 附录三 ：部分候选mRNA列表 | 第65-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
