| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 引言 | 第8-10页 |
| 1 理论方法 | 第10-16页 |
| 1.1 量子化学方法 | 第10页 |
| 1.2 分子力学 | 第10-12页 |
| 1.3 ABEEMσπ浮动电荷分子力场 | 第12-16页 |
| 1.3.1 ABEEMσπ模型力场形式 | 第12-13页 |
| 1.3.2 ABEEMσπ-GB/SA 模型 | 第13-16页 |
| 2 ABEEMσπ模型参数的确定 | 第16-19页 |
| 2.1 原子类型的定义 | 第16-17页 |
| 2.2 ABEEMσπ浮动电荷力场参数 | 第17-18页 |
| 2.3 氢键拟合函数 | 第18-19页 |
| 3 中性组氨酸二肽的研究 | 第19-38页 |
| 3.1 六个稳定构象的研究 | 第19-22页 |
| 3.2 研究组氨酸二肽与水分子的二聚体 | 第22-26页 |
| 3.2.1 位点的选择 | 第22-23页 |
| 3.2.2 侧链与一个 H_2O 的相互作用 | 第23-26页 |
| 3.3 研究 His(H_2O)_n(n=1~6)的性质 | 第26-36页 |
| 3.3.1 最低构象 His1(H_2O)_n(n=1~6)的研究 | 第26-28页 |
| 3.3.2 His(H_2O)_n(n=1~6)的结合能 | 第28-33页 |
| 3.3.3 连续结合能 | 第33-34页 |
| 3.3.4 协同效应 | 第34-36页 |
| 3.4 本章小结 | 第36-38页 |
| 4 带正电组氨酸二肽的研究 | 第38-44页 |
| 4.1 带正电组氨酸六个稳定构象的研究 | 第38-40页 |
| 4.2 研究 ProHis(H_2O)_n(n=1~5)复合物的性质 | 第40-43页 |
| 4.2.1 结合能的计算 | 第40-42页 |
| 4.2.2 连续结合能 | 第42-43页 |
| 4.3 本章小结 | 第43-44页 |
| 5 组氨酸二肽水溶液动力学模拟 | 第44-49页 |
| 5.1 研究对象的选择 | 第44页 |
| 5.2 动力学模拟细节 | 第44页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第44-48页 |
| 5.3.1 结构的稳定性 | 第44-46页 |
| 5.3.2 溶剂化自由能的计算 | 第46-48页 |
| 5.4 本章小结 | 第48-49页 |
| 结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-53页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
