| 摘要 | 第6-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 前言 | 第16-18页 |
| 第一章 文章综述 | 第18-31页 |
| 1 单核苷酸多态性研究进展 | 第18-22页 |
| 1.1 单核苷酸多态性的定义及特点 | 第18-20页 |
| 1.2 单核苷酸多态性的检测方法 | 第20-21页 |
| 1.2.1 直接测序法 | 第20页 |
| 1.2.2 以构象为基础的检测方法 | 第20页 |
| 1.2.3 基因芯片（Gene Chip）技术 | 第20-21页 |
| 1.2.4 DNA 池检测技术 | 第21页 |
| 1.3 单核苷酸多态性在鱼类中的应用 | 第21-22页 |
| 2 表观遗传学研究 | 第22-26页 |
| 2.1 表观遗传学的定义、特点及形式 | 第22页 |
| 2.2 DNA 甲基化的作用机制 | 第22-23页 |
| 2.3 DNA 甲基化在鱼类中研究进展 | 第23-26页 |
| 2.3.1 DNA 甲基化的作用贯穿鱼类生长发育过程 | 第24页 |
| 2.3.2 DNA 甲基化模式受环境因素影响 | 第24-26页 |
| 2.3.2.1 温度对 DNA 甲基化模式的影响 | 第25页 |
| 2.3.2.2 周围环境化学物质对 DNA 甲基化模式的影响 | 第25-26页 |
| 2.3.2.3 激素对 DNA 甲基化模式的影响 | 第26页 |
| 3 单核苷酸多态性与 DNA 甲基化之间的密切关系 | 第26-27页 |
| 4 鱼类性类固醇激素生成酶相关基因的 SNP 和表观遗传研究进展 | 第27-29页 |
| 4.1 鱼类 P450c17-Ⅱ（17α-羟化酶）SNP 和表观遗传学研究进展 | 第27-28页 |
| 4.2 鱼类细胞色素 P450 芳香化酶（P450arom/Cyp19）SNP 和表观遗传学研究进展 | 第28-29页 |
| 4.3 鱼类 Foxl2 基因 SNP 和表观遗传学研究进展 | 第29页 |
| 5 本研究的立项依据与研究意义 | 第29-31页 |
| 第二章 牙鲆 cyp-17Ⅱ基因甲基化位点的突变对其基因表达和繁殖内分泌的影响机理 | 第31-50页 |
| 1 材料和方法 | 第32-38页 |
| 1.1 实验主要试剂 | 第32页 |
| 1.2 实验鱼和数据获取 | 第32页 |
| 1.3 肝重指数（HSI）和性腺成熟系数（GSI） | 第32-33页 |
| 1.4 血浆中激素含量的测定（RIA） | 第33页 |
| 1.5 基因组 DNA 提取 | 第33页 |
| 1.6 PCR-SSCP 分析 | 第33页 |
| 1.7 RNA 提取和反转录聚合酶链式反应（RT-PCR） | 第33-34页 |
| 1.8 荧光定量 PCR (qPCR) | 第34页 |
| 1.9 DNA 甲基化模式分析 | 第34-37页 |
| 1.10 数据分析 | 第37-38页 |
| 2 结果 | 第38-47页 |
| 2.1 基因组 DNA 和总 RNA 提取结果 | 第38-39页 |
| 2.2 目的基因（cyp17-Ⅱ）与内参基因（18S）的扩增效率验证 | 第39-40页 |
| 2.3 cyp17-Ⅱ外显子的多态性 | 第40-42页 |
| 2.3.1 cyp17-Ⅱ外显子 PCR 扩增结果 | 第40页 |
| 2.3.2 SSCP 银染及测序结果 | 第40-42页 |
| 2.4 cyp17-Ⅱ基因 CpG 富集区的 DNA 甲基化水平 | 第42-45页 |
| 2.4.1 CpG 富集区预测及测序结果 | 第42页 |
| 2.4.2 BS-PCR 扩增结果 | 第42-43页 |
| 2.4.3 BS-PCR 产物测序分析 | 第43页 |
| 2.4.4 L2 位点的两基因型 BS-PCR 测序结果 | 第43-45页 |
| 2.4 两个 SNP 位点和繁殖性状的相关性分析 | 第45-46页 |
| 2.5 两个 SNP 位点与卵巢中 cyp17-Ⅱ基因表达的相关性分析 | 第46-47页 |
| 3 讨论 | 第47-49页 |
| 4 小结 | 第49-50页 |
| 第三章 牙鲆卵巢发育期内 cyp17-Ⅱ的甲基化水平与基因表达水平及繁殖性状相关性分析 | 第50-64页 |
| 1 材料与方法 | 第51-54页 |
| 1.1 实验鱼 | 第51页 |
| 1.2 组织学观察 | 第51-52页 |
| 1.3 雌性牙鲆血浆中雌二醇（E2）和睾酮（T）含量的测定（RIA） | 第52页 |
| 1.4 RNA 提取和反转录聚合酶链式反应（RT-PCR） | 第52页 |
| 1.5 荧光定量 PCR (qPCR) | 第52页 |
| 1.6 亚硫酸修饰 DNA | 第52-53页 |
| 1.7 CpG 富集区的预测和亚硫酸-PCR (BS-PCR) | 第53页 |
| 1.8 cyp17-Ⅱ基因开放阅读框编码氨基酸序列的分析 | 第53页 |
| 1.9 数据分析 | 第53-54页 |
| 2 实验结果 | 第54-61页 |
| 2.1 牙鲆卵巢分期性腺发育组织学分析 | 第54页 |
| 2.2 cyp17-Ⅱ基因在卵巢发育期中的表达 | 第54-55页 |
| 2.3 发育周期中血浆睾酮和雌激素含量的变化 | 第55-57页 |
| 2.4 cyp17-Ⅱ基因 CpG 富集区的甲基化水平检测 | 第57-58页 |
| 2.5 cyp17-Ⅱ基因开放阅读框和特异保守区内的 CpG 位点甲基化模式 | 第58-60页 |
| 2.6 cyp17-Ⅱ基因 CpG 富集区甲基化水平和基因表达的相关性分析 | 第60-61页 |
| 3 讨论 | 第61-63页 |
| 4 小结 | 第63-64页 |
| 第四章 牙鲆卵巢发育期内 Cyp19 和 Foxl2 基因甲基化水平与基因表达水平及繁殖性状相关性分析 | 第64-80页 |
| 1 材料与方法 | 第65-67页 |
| 1.1 实验鱼 | 第65页 |
| 1.2 RNA 提取和反转录聚合酶链式反应（RT-PCR） | 第65页 |
| 1.3 荧光定量 PCR (qPCR) | 第65-66页 |
| 1.4 Cyp19a 和 Foxl2 基因结构和氨基酸序列分析 | 第66页 |
| 1.5 亚硫酸修饰 DNA | 第66页 |
| 1.6 CpG 富集区的预测和亚硫酸-PCR (BS-PCR) | 第66-67页 |
| 1.7 雌性牙鲆血浆中雌二醇（E2）含量的测定（RIA） | 第67页 |
| 1.8 数据分析 | 第67页 |
| 2 实验结果 | 第67-76页 |
| 2.1 Cyp19a 和 Foxl2 基因在卵巢发育期中的表达 | 第67-69页 |
| 2.2 Cyp19a 和 Foxl2 基因结构分析结果 | 第69-70页 |
| 2.3 Cyp19a 和 Foxl2 基因 CpG 富集区预测结果 | 第70-71页 |
| 2.4 Cyp19a 基因和 Foxl2 基因 CpG 富集区甲基化模式在发育期中的变化趋势 | 第71-76页 |
| 2.4.1 Cyp19a 基因启动子区和外显子 1 甲基化模式在发育期中变化趋势 | 第71-74页 |
| 2.4.2 Foxl2 基因 CpG 富集区甲基化模式在发育期中的变化趋势 | 第74-76页 |
| 2.5 牙鲆卵巢发育期中血清雌二醇水平变化 | 第76页 |
| 3 讨论 | 第76-78页 |
| 4 小结 | 第78-80页 |
| 参考文献 | 第80-96页 |
| 致谢 | 第96-97页 |
| 个人简介 | 第97页 |
| 教育背景 | 第97页 |
| 发表的学术论 | 第97-98页 |
