| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第10-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-31页 |
| 1 表观遗传学 | 第13-16页 |
| 1.1 DNA 修饰 | 第13-14页 |
| 1.2 组蛋白修饰 | 第14页 |
| 1.3 染色质重塑 | 第14-15页 |
| 1.4 非编码 RNA 修饰 | 第15-16页 |
| 1.5 副突变 | 第16页 |
| 2 DNA 甲基化 | 第16-25页 |
| 2.0 DNA 甲基转移酶 | 第16-17页 |
| 2.1 DNA 甲基化的检测方法 | 第17-20页 |
| 2.2 甲基化数据库 | 第20页 |
| 2.3 DNA 甲基化与其他表观遗传学现象之间的关系 | 第20-21页 |
| 2.4 DNA 甲基化的应用研究 | 第21-25页 |
| 2.4.1 DNA 甲基化与杂种优势 | 第21-22页 |
| 2.4.2 DNA 甲基化与胚胎发育 | 第22-23页 |
| 2.4.3 DNA 甲基化与分子辅助标记 | 第23-24页 |
| 2.4.4 DNA 甲基化与克隆动物发育 | 第24-25页 |
| 3 MSAP 的应用原理及研究现状 | 第25-31页 |
| 3.1 MSAP 方法的应用原理 | 第25页 |
| 3.1.1 高质量 DNA 的提取 | 第25页 |
| 3.1.2 模板 DNA 的制备 | 第25页 |
| 3.1.3 PCR 反应 | 第25页 |
| 3.1.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第25页 |
| 3.2 MSAP 在动植物间的研究进展 | 第25-31页 |
| 3.2.1 不同动植物间 MSAP 分析 | 第25-26页 |
| 3.2.2 动植物不同生长期的 MSAP 分析 | 第26-27页 |
| 3.2.3 动植物子代间的 MSAP 分析 | 第27页 |
| 3.2.4 动植物不同组织间 MSAP 分析 | 第27-28页 |
| 3.2.5 MSAP 对动植物抗逆性研究 | 第28-31页 |
| 第二章 中国对虾 MSAP 体系的建立与优化 | 第31-39页 |
| 1 材料与方法 | 第31-34页 |
| 1.1 材料动物 | 第31页 |
| 1.2 药品与试剂 | 第31-32页 |
| 1.2.1 试验药品 | 第31-32页 |
| 1.2.2 试验仪器 | 第32页 |
| 1.3 试验方法 | 第32-33页 |
| 1.3.1 基因组 DNA 的提取 | 第32页 |
| 1.3.2 甲基化敏感扩增多态性（MSAP）分析 | 第32-33页 |
| 1.3.3 选择性扩增反应 | 第33页 |
| 1.3.4 变性电泳 | 第33页 |
| 1.4 MSAP 条带统计与分析 | 第33-34页 |
| 2 实验结果与分析 | 第34-37页 |
| 2.1 DNA 酶切结果分析 | 第34页 |
| 2.2 预扩增反应和选择性扩增反应结果分析 | 第34-36页 |
| 2.2.1 预扩增反应中不同 DNA 模板浓度下的结果分析 | 第35页 |
| 2.2.2 预扩增反应中不同缓冲液量情况下产物的结果分析 | 第35页 |
| 2.2.3 选择性扩增反应中不同 DNA 模板浓度下的结果分析 | 第35-36页 |
| 2.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳 PAGE 图谱分析 | 第36-37页 |
| 3 讨论 | 第37-39页 |
| 第三章 中国对虾野生群体和黄海 1 号不同组织基因组 DNA 甲基化的 MSAP 分析 | 第39-50页 |
| 1 材料与方法 | 第40-42页 |
| 1.1 材料来源 | 第40页 |
| 1.2 药品与试剂 | 第40页 |
| 1.2.1 试验药品 | 第40页 |
| 1.2.2 试验仪器 | 第40页 |
| 1.3 基因组 DNA 的提取 | 第40页 |
| 1.4 甲基化敏感扩增多态性（MSAP）分析 | 第40-42页 |
| 1.4.1 酶切和连接反应 | 第40页 |
| 1.4.2 预扩增反应 | 第40-41页 |
| 1.4.3 选择性扩增反应 | 第41-42页 |
| 1.4.4 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第42页 |
| 1.5 MSAP 条带统计与分析 | 第42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-47页 |
| 2.1 MSAP 带型分析 | 第42-43页 |
| 2.2 中国对虾基因组 DNA 甲基化水平分析 | 第43-45页 |
| 2.2.1 不同组织间 DNA 甲基化水平差异 | 第44页 |
| 2.2.2 不同群体间 DNA 甲基化水平差异 | 第44-45页 |
| 2.3 中国对虾的甲基化多态性水平分析 | 第45-47页 |
| 3 讨论 | 第47-50页 |
| 第四部分 氨氮和 pH 胁迫下中国对虾基因组 DNA 甲基化的 MSAP 分析 | 第50-62页 |
| 1 材料与方法 | 第50-53页 |
| 1.1 实验材料 | 第50-51页 |
| 1.2 药品与试剂 | 第51页 |
| 1.2.1 试验药品 | 第51页 |
| 1.2.2 试验仪器 | 第51页 |
| 1.3 实验方法 | 第51页 |
| 1.3.1 实验材料处理 | 第51页 |
| 1.3.2 pH 和氨氮胁迫试验的甲基化敏感扩增多态性（MSAP）分析 | 第51页 |
| 1.4 氨氮和 pH 胁迫下中国对虾甲基化特异性条带的分析 | 第51-53页 |
| 1.4.1 特异性条带的筛选及处理 | 第51-52页 |
| 1.4.2 特异性条带的克隆 | 第52页 |
| 1.4.3 特异性条带的序列分析 | 第52-53页 |
| 2 结果与分析 | 第53-59页 |
| 2.1 氨氮胁迫下中国对虾死亡率分析 | 第53页 |
| 2.2 氨氮胁迫下中国对虾基因组 DNA 甲基化水平 | 第53-54页 |
| 2.3 pH 胁迫下中国对虾死亡率分析 | 第54-55页 |
| 2.4 pH 胁迫下中国对虾基因组 DNA 甲基化水平分析 | 第55-56页 |
| 2.5 中国对虾氨氮和 pH 胁迫下甲基化标记筛选 | 第56-59页 |
| 3 讨论 | 第59-62页 |
| 参考文献 | 第62-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 文章 | 第73-74页 |
