| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略词表 | 第14-15页 |
| 1 前言 | 第15-37页 |
| 1.1 拟南芥生物学研究基础 | 第15-17页 |
| 1.2 环形RNA简介 | 第17-24页 |
| 1.2.1 环形RNA的形成机制 | 第18-21页 |
| 1.2.2 环形RNA的主要特征 | 第21页 |
| 1.2.3 环形RNA的基因调控功能 | 第21-24页 |
| 1.3 环形RNA的测序及建库方式 | 第24-25页 |
| 1.4 环形RNA已有数据库 | 第25-29页 |
| 1.5 环形RNA的预测方法 | 第29-33页 |
| 1.6 miRNA结合方式 | 第33-34页 |
| 1.7 RNA-seq技术特点 | 第34-35页 |
| 1.8 研究目的及意义 | 第35-37页 |
| 2 材料与方法 | 第37-51页 |
| 2.1 数据来源和生物信息学工具 | 第37-39页 |
| 2.1.1 RNA-seq数据来源 | 第37-38页 |
| 2.1.2 microRNA数据来源 | 第38页 |
| 2.1.3 拟南芥参考基因组以及基因组注释信息来源 | 第38页 |
| 2.1.4 生物信息学工具 | 第38-39页 |
| 2.2 数据分析方法 | 第39-51页 |
| 2.2.1 数据预处理 | 第40-43页 |
| 2.2.2 环形RNA的预测 | 第43-44页 |
| 2.2.3 表达量统计 | 第44-48页 |
| 2.2.4 GO富集分析 | 第48-51页 |
| 3 结果与分析 | 第51-61页 |
| 3.1 拟南芥环形RNA的预测结果 | 第51-53页 |
| 3.2 表达量统计分析结果 | 第53-55页 |
| 3.3 GO富集分析结果 | 第55-61页 |
| 4 结论 | 第61-63页 |
| 5 讨论与展望 | 第63-65页 |
| 5.1 讨论 | 第63-64页 |
| 5.2 展望 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-73页 |
| 附录Ⅰ 拟南芥2310个候选环形RNA列表 | 第73-115页 |
| 附录Ⅱ 差异表达分析结果 | 第115-129页 |
| 附录Ⅲ 攻读硕士学位期间发表论文情况 | 第129页 |