| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-38页 |
| ·青枯菌 | 第13-19页 |
| ·青枯菌及其引起的病害 | 第13-14页 |
| ·青枯菌的传统分类 | 第14-15页 |
| ·青枯菌种以下演化型分类框架 | 第15-17页 |
| ·青枯菌 Po82 菌株简介 | 第17-19页 |
| ·青枯菌全基因组学研究进展 | 第19-27页 |
| ·全基因组测序技术的发展 | 第19-20页 |
| ·比较基因组学 | 第20-21页 |
| ·泛基因组 | 第21-22页 |
| ·青枯菌全基因组学研究进展 | 第22-27页 |
| ·III 型分泌系统 | 第27-37页 |
| ·病原细菌的分泌系统 | 第27-29页 |
| ·III 型分泌系统 | 第29-37页 |
| ·本研究目的、意义及技术路线 | 第37-38页 |
| ·本研究目的及意义 | 第37页 |
| ·技术路线 | 第37-38页 |
| 第二章 青枯菌 Po82 菌株比较基因组学研究 | 第38-65页 |
| ·实验材料 | 第38-40页 |
| ·供试菌株、质粒及培养条件 | 第38-39页 |
| ·主要试剂 | 第39页 |
| ·培养基 | 第39-40页 |
| ·实验方法 | 第40-47页 |
| ·Po82 菌株抑制性差减杂交文库的构建 | 第40-46页 |
| ·Po82 菌株全基因组序列生物信息学分析 | 第46-47页 |
| ·结果 | 第47-61页 |
| ·抑制性差减杂交文库的构建及分析 | 第47-55页 |
| ·Po82 菌株基因组分析 | 第55-61页 |
| ·结论与讨论 | 第61-65页 |
| ·抑制性差减杂交文库的构建及分析 | 第61-62页 |
| ·Po82 菌株全基因组序列分析 | 第62-64页 |
| ·候选基因的确定 | 第64-65页 |
| 第三章 Po82 菌株 III 型分泌系统调控基因 hrpB 的功能研究 | 第65-81页 |
| ·实验材料 | 第65-67页 |
| ·供试菌株、质粒及培养条件 | 第65-66页 |
| ·培养基 | 第66-67页 |
| ·主要试剂 | 第67页 |
| ·实验方法 | 第67-72页 |
| ·hrpB 基因生物信息学分析 | 第67页 |
| ·hrpB 基因重组自杀质粒的构建及鉴定 | 第67-69页 |
| ·感受态细胞的制备及电转化 | 第69页 |
| ·突变株的筛选与鉴定 | 第69-70页 |
| ·互补载体的构建及鉴定 | 第70页 |
| ·互补菌株的筛选与鉴定 | 第70页 |
| ·致病力测定 | 第70-71页 |
| ·Po82 菌株总 RNA 的提取 | 第71页 |
| ·半定量 RT-PCR | 第71-72页 |
| ·生长曲线的测定 | 第72页 |
| ·运动性检测 | 第72页 |
| ·结果 | 第72-79页 |
| ·hrpB 基因生物信息学分析 | 第72-74页 |
| ·hrpB 基因重组自杀质粒的构建 | 第74-75页 |
| ·hrpB 基因突变株的构建 | 第75页 |
| ·互补菌株的构建 | 第75-76页 |
| ·致病力测定结果 | 第76-77页 |
| ·半定量 RT-PCR 分析 | 第77页 |
| ·生长曲线的测定 | 第77-78页 |
| ·运动性测定 | 第78-79页 |
| ·结论与讨论 | 第79-81页 |
| 第四章 Po82 菌株 III 型效应子 HopAF1 的功能研究 | 第81-105页 |
| ·实验材料 | 第81-82页 |
| ·供试菌株、质粒及培养条件 | 第81-82页 |
| ·培养基 | 第82页 |
| ·主要试剂 | 第82页 |
| ·实验方法 | 第82-90页 |
| ·hopAF1 基因生物信息学分析 | 第82页 |
| ·hopAF1 基因在青枯菌种群中的分布 | 第82-83页 |
| ·hopAF1 基因重组自杀质粒的构建及鉴定 | 第83-84页 |
| ·感受态细胞的制备及电转化 | 第84页 |
| ·hopAF1 基因突变菌株的筛选与鉴定 | 第84页 |
| ·互补载体的构建及鉴定 | 第84页 |
| ·互补菌株的筛选与鉴定 | 第84页 |
| ·致病力测定 | 第84-85页 |
| ·半定量 RT-PCR | 第85页 |
| ·基于 Gateway 技术构建表达载体 | 第85-87页 |
| ·腺苷酸环化酶转导实验 | 第87-89页 |
| ·GFP 载体的构建 | 第89-90页 |
| ·生长曲线的测定 | 第90页 |
| ·运动性检测 | 第90页 |
| ·生物被膜形成测定 | 第90页 |
| ·结果 | 第90-103页 |
| ·hopAF1 基因生物信息学分析 | 第90-92页 |
| ·hopAF1 基因在青枯菌种群中的分布 | 第92页 |
| ·hopAF1 基因重组自杀质粒的构建 | 第92-93页 |
| ·hopAF1 基因突变株的构建 | 第93页 |
| ·互补菌株的构建与鉴定 | 第93-94页 |
| ·致病力测定 | 第94-96页 |
| ·半定量 RT-PCR 分析 | 第96页 |
| ·基于 Gateway 技术表达载体的构建及青枯菌的转化 | 第96-97页 |
| ·腺苷酸环化酶转导实验 | 第97-100页 |
| ·GFP 载体的构建 | 第100-101页 |
| ·生长曲线的测定 | 第101页 |
| ·运动性检测 | 第101-102页 |
| ·生物被膜形成测定 | 第102-103页 |
| ·结论与讨论 | 第103-105页 |
| 第五章 四个 Po82 菌株特异基因的功能研究 | 第105-130页 |
| ·实验材料 | 第105-106页 |
| ·供试菌株、质粒及培养条件 | 第105-106页 |
| ·培养基 | 第106页 |
| ·主要试剂 | 第106页 |
| ·实验方法 | 第106-110页 |
| ·候选基因的生物信息学分析 | 第106页 |
| ·候选重组自杀质粒的构建及鉴定 | 第106-108页 |
| ·感受态细胞的制备及电转化 | 第108页 |
| ·基因突变株的筛选与鉴定 | 第108页 |
| ·互补载体的构建及鉴定 | 第108-109页 |
| ·互补菌株的筛选与鉴定 | 第109页 |
| ·致病力测定 | 第109页 |
| ·半定量 RT-PCR | 第109-110页 |
| ·生长曲线的测定 | 第110页 |
| ·运动性测定 | 第110页 |
| ·生物被膜形成的测定 | 第110页 |
| ·结果 | 第110-127页 |
| ·MarR 转录调控因子家族基因 m00553 的功能研究 | 第110-115页 |
| ·转录调控因子编码基因 c01536 的功能研究 | 第115-116页 |
| ·III 型效应子编码基因 c00283 的功能研究 | 第116-122页 |
| ·III 型效应子编码基因 m00778 的功能研究 | 第122-127页 |
| ·结论与讨论 | 第127-130页 |
| ·转录调控因子编码基因 | 第128页 |
| ·III 型效应子编码基因 | 第128-130页 |
| 第六章 Po82 菌株 III 型效应子 AvrPtoB 和 XopX 类似物功能研究 | 第130-150页 |
| ·实验材料 | 第130-131页 |
| ·供试菌株、质粒及培养条件 | 第130-131页 |
| ·培养基 | 第131页 |
| ·主要试剂 | 第131页 |
| ·实验方法 | 第131-134页 |
| ·基因生物信息学分析 | 第131页 |
| ·重组自杀质粒的构建及鉴定 | 第131-132页 |
| ·感受态细胞的制备及电转化 | 第132页 |
| ·突变株的筛选与鉴定 | 第132页 |
| ·互补载体的构建及鉴定 | 第132-133页 |
| ·互补菌株的筛选与鉴定 | 第133页 |
| ·致病力测定 | 第133页 |
| ·半定量 RT-PCR | 第133-134页 |
| ·生长曲线的测定 | 第134页 |
| ·运动性检测 | 第134页 |
| ·生物被膜形成的测定 | 第134页 |
| ·结果 | 第134-148页 |
| ·c01857 基因功能研究 | 第134-141页 |
| ·m00718 基因功能研究 | 第141-148页 |
| ·结论与讨论 | 第148-150页 |
| 第七章 全文结论 | 第150-152页 |
| 附录 | 第152-160页 |
| 参考文献 | 第160-174页 |
| 致谢 | 第174-175页 |
| 作者简介 | 第175页 |
