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水稻白叶枯病菌c-di-GMP信号途径相关基因的功能鉴定及其毒性调控机理的分析

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
第一章 绪论第13-27页
   ·水稻白叶枯病菌致病性表达第13页
   ·c-di-GMP 信号调节机制第13-21页
     ·c-di-GMP 的合成和降解第14-15页
     ·c-di-GMP 调控一系列表型特征第15-17页
     ·c-di-GMP 信号通过与受体或效应蛋白的结合影响不同的细胞行为第17-19页
     ·DGCs 和 PDEs 的感应结构域结合上游的环境信号来改变 c-di-GMP 的水平第19页
     ·c-di-GMP 在细胞不同时期的分布第19-20页
     ·水稻白叶枯病菌 c-di-GMP 信号传导系统第20-21页
   ·双组份信号传导系统第21-25页
     ·TCS 的结构特征第22页
       ·TCS 感应信号特征第22-23页
     ·TCS 磷酸化第23页
     ·TCS 与细菌的致病性紧密相关第23-24页
       ·水稻白叶枯病菌中双组分系统第24-25页
   ·本研究的目的意义和技术路线第25-27页
第二章 双组份调控系统 PdeK/PdeR 调控 c-di-GMP 的代谢和水稻白叶枯病菌的毒性第27-53页
   ·实验材料第27-29页
     ·菌株、质粒和引物第27-28页
     ·主要的试剂和仪器第28页
     ·培养基和菌株培养条件第28-29页
   ·试验方法第29-34页
     ·Xoo 基因组 DNA 的制备第29页
     ·突变体及互补菌株的构建第29-30页
     ·突变体表型测定第30页
     ·qRT-PCR 检测 EPS 及毒性相关基因的表达第30-31页
     ·酶活性检测第31-33页
     ·酵母双杂交第33-34页
     ·磷酸化对酶活的影响第34页
     ·基因序列的生物信息学分析第34页
   ·结果与分析第34-51页
     ·PXO99A中 c-di-GMP 代谢相关蛋白分析第34-36页
     ·PdeR 活性测定第36-41页
     ·突变体及互补菌株的构建第41-43页
     ·突变体及互补菌株表型检测第43-46页
     ·qPCR 检测 EPS 相关基因表达第46-47页
     ·qPCR 检测 T3SS 相关基因表达第47-48页
     ·酵母双杂交检测第48-50页
     ·PdeK 对 PdeR 酶活性的影响第50-51页
   ·讨论第51-53页
第三章 水稻白叶枯病菌 c-di-GMP 受体蛋白 PXO_00403 调控其毒性和过敏性反应第53-69页
   ·实验材料第53-54页
     ·菌株和质粒第53页
     ·主要的生化试剂和仪器第53页
     ·培养基和菌株培养条件第53-54页
   ·实验方法第54-55页
     ·PXO_00403 突变体及互补菌株的构建第54页
     ·突变体表型分析第54-55页
     ·qRT-PCR 检测毒性相关基因的表达第55页
     ·酶活性测定第55页
     ·ITC 检测与 c-di-GMP 结合第55页
     ·基因序列生物信息学分析第55页
   ·结果与分析第55-68页
     ·PXO_00403 突变体和互补菌株的构建第55-58页
     ·突变体及互补菌株表型检测第58-61页
     ·qPCR 检测 T3SS 相关基因表达第61-62页
     ·PXO_00403 活性测定第62-66页
     ·ITC 检测 PXO_00403 与 c-di-GMP 的结合第66-68页
   ·讨论第68-69页
第四章 水稻白叶枯病菌 GGDEF 结构域蛋白 PXO_00649 和 PXO_02615 功能鉴定第69-79页
   ·实验材料第69页
     ·菌株和质粒第69页
     ·主要的生化试剂和仪器第69页
     ·培养基和菌株培养条件第69页
   ·实验方法第69-71页
     ·PXO_00649 和 PXO_02615 突变体及互补菌株的构建第69-70页
     ·突变体表型分析第70页
     ·qRT-PCR 检测毒性相关基因的表达第70页
     ·酶活性测定第70-71页
     ·基因序列生物信息学分析第71页
   ·结果与分析第71-78页
     ·PXO_02615 和 PXO_00649 生物信息学分析第71-72页
     ·PXO_02615 和 PXO_00649 突变体和互补菌株的构建第72-73页
     ·突变体及互补菌株表型检测第73-76页
     ·PXO_02615 和 PXO_00649 蛋白表达第76-78页
   ·讨论第78-79页
第五章 全文结论第79-80页
参考文献第80-92页
附录第92-103页
致谢第103-104页
作者简历第104页

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